2021 Fiscal Year Final Research Report
Spatio-temporal proteomics based on MS silencing
Project/Area Number |
20K21478
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Research Category |
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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Allocation Type | Multi-year Fund |
Review Section |
Medium-sized Section 47:Pharmaceutical sciences and related fields
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Research Institution | Kyoto University |
Principal Investigator |
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
小形 公亮 京都大学, 薬学研究科, 特定助教 (80866781)
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Project Period (FY) |
2020-07-30 – 2022-03-31
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Keywords | 質量分析 / プロテオミクス / タンパク質構造 / 化学修飾 / リン酸化修飾 |
Outline of Final Research Achievements |
In this study, to establish a method for selectively detecting signals in the proteome derived from target organs or target cells and simultaneously obtaining their spatiotemporal information, we aimed to develop a new technique called "MS Silencing", a new technology that renders proteins undetectable by mass spectrometry (MS) by applying random chemical or enzymatic modifications outside the target region. For the chemical modification, photoreactive aryl diazirines were selected to attenuate the MS signal from the target protein to 1/10 or less. In the enzymatic reaction, the protein surface was labeled with phosphate groups by in vitro kinase reaction, and the protein conformational change could be detected from the difference in the labeling rate.
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Free Research Field |
プロテオミクス
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Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
細胞や組織の中には数万種のタンパク質がひしめき合っており。その中である条件をもつタンパク質群のみを選択的に検出する手法を開発することにより、今まで見えなかったものが新たに見えてくる可能性がある。そのための一般的な手法として、今回のMSサイレンシング法の開発に成功した。ここでは、化学反応を用いる方法と酵素反応を用いる方法をそれぞれ開発し、いずれの方法も目的の性能を有していることを証明することができた。今後、様々な応用例に適用されることを期待している。
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