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2009 Fiscal Year Annual Research Report

大規模遺伝子データセットに基づく西日本の淡水魚類相形成史の総合的解明

Research Project

Project/Area Number 21370035
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

渡辺 勝敏  Kyoto University, 大学院・理学研究科, 准教授 (00324955)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 向井 貴彦  岐阜大学, 地域科学部, 准教授 (80377697)
高橋 洋  独立行政法人水産大学校, 生物生産学科, 助教 (90399650)
Keywords淡水魚 / ミトコンドリアDNA / 分布域形成 / 牛物多横株 / 系統地理
Research Abstract

本研究は,豊かな種多様性を誇る西日本の純淡水魚類相の歴史的・生態学的形成プロセスを,これまでにない大規模な遺伝子データセットと新たな分析手法を駆使して,総合的に解き明かすことを目的とする.研究期間に,(1)西日本の主要な純淡水魚種に関する系統地理パターンの解明と比較,(2)現在の分布および地質年代における古地理復元に基づく,主要魚種それぞれの出現予測モデルの構築,(3)さまざまなDNAマーカーと,国内外来種の分布拡大時の動態を"実験"として利用することによる,群集構成種の地理的分化・分布域拡大・二次的接触による相互作用といった動的歴史の復元と検証,の3項目を実施する.
1.ミトコンドリアDNAを用いた多種系統地理解析:コイ科を中心に約20種の魚種に関して,野外試料収集とミトコンドリアDNA部分塩基配列を用いた系統地理分析を進め,約60%を終了した.一部成果について,学会発表および論文公表を行った.
2.各魚種の出現予測モデルの構築:西日本の純淡水魚類相において解明すべき主要課題を集約・設定し,魚類分布データの収集(環境省,国土交通省のデータベース,独自データ,その他)を実施した.ニッチモデリングおよびGISソフトウェアの習熟,および利用可能なデータの状方収集と整理を進めた.
3.集団分化・分布拡大・二次的接触後の動態
(1)mtDNAおよび核DNAを用いた統計的推定:mtDNAおよび核DNA(AFLP分析)を併用し,まずオヤニラミを主な対象として,集団の分化や分布拡大,二次的接触による遺伝的交流様態を明らかにした.
(2)国内外来集団を用いた「実験的」検証:オイカワ,モツゴ,ハス,ゼゼラ等を対象にmtDNAマーカーを用いて人為的撹乱を定量化し,一部成果につき学会発表を行った.

  • Research Products

    (12 results)

All 2010 2009 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (6 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] GEDIMAP : a database of genetic diversity for Japanese freshwater fishes2010

    • Author(s)
      Watanabe K, Kano Y, Takahashi H, Mukai T, Kakioka R, Tominaga K
    • Journal Title

      Ichthyological Research 57

      Pages: 107-109

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Population divergence of Biwia zezera (Cyprinidae : Gobioninae) and the discovery of a cryptic species, based on mitochondrial and nuclear DNA sequence analyses2010

    • Author(s)
      Watanabe K, Kawase S, Mukai T, Kakioka R, Miyazaki J-I, Hosoya K
    • Journal Title

      Zoological Science

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genetic diversity and conservation units in wild and captive populations of endangered freshwater fishes : a case of Hemigrammocypris rasborella in Shizuoka, Japan2009

    • Author(s)
      Watanabe K, Kanagawa N, Kakioka R, Itai T, Mori S
    • Journal Title

      Ichthyological Research 56

      Pages: 411-416

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Faunal structure of Japanese freshwater fishes and its artificial disturbance2009

    • Author(s)
      Watanabe K
    • Journal Title

      Environmental Biology of Fishes (電子出版)

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 琵琶湖産魚類の比較人口学解析2010

    • Author(s)
      田畑諒一, 柿岡諒, 富永浩史, 小宮竹史, 渡辺勝敏
    • Organizer
      第57回日本生態学会大会
    • Place of Presentation
      東京大学 (東京都)
    • Year and Date
      2010-03-17
  • [Presentation] コイ科カマツカ隠蔽種群の二次的接触域における分布および交雑パターンモデリング2010

    • Author(s)
      富永浩史, 渡辺勝敏
    • Organizer
      第57回日本生態学会大会
    • Place of Presentation
      東京大学 (東京都)
    • Year and Date
      2010-03-17
  • [Presentation] Genetic and morphological analyses of the gudgeon, Squalidus chankaensis : consequences of past and present colonizations2009

    • Author(s)
      柿岡諒, 渡辺勝敏
    • Organizer
      International Conference on Evolutionary Ecology of Fishes Diversification, Adaptation and Speciation
    • Place of Presentation
      ドイツ, ベルリン
    • Year and Date
      20091123-20091125
  • [Presentation] 日本産モツゴにおけるmtDNAの地理的変異2009

    • Author(s)
      向井貴彦, 小西繭, 渡辺勝敏, 武内陽佑, 中島淳, 河口洋一, 鬼倉徳雄, 高田啓介
    • Organizer
      第42回日本魚類学会年会
    • Place of Presentation
      東京海洋大学 (東京都)
    • Year and Date
      20091010-20091011
  • [Presentation] 日本列島におけるオイカワの系統地理2009

    • Author(s)
      早川明里, 高村健二, 中島淳, 河口洋一, 鬼倉徳雄, 向井貴彦
    • Organizer
      第42回日本魚類学会年会
    • Place of Presentation
      東京海洋大学 (東京都)
    • Year and Date
      20091010-20091011
  • [Presentation] 日本産淡水魚類の種多様性および地域魚類相の均質化2009

    • Author(s)
      渡辺勝敏, 富永浩史
    • Organizer
      第42回日本魚類学会年会
    • Place of Presentation
      東京海洋大学 (東京都)
    • Year and Date
      2009-10-10
  • [Book] 淡水魚地理の自然史-多様性と分化をめぐって2010

    • Author(s)
      渡辺勝敏・高橋洋(編著)
    • Total Pages
      228
    • Publisher
      北海道大学出版会
  • [Remarks]

    • URL

      http://gedimap.zool.kyoto-u.ac.jp/

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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