2011 Fiscal Year Annual Research Report
網羅的ゲノム・エピゲノム解析による小児固形腫瘍の分子機構解析と分子標的療法の開発
Project/Area Number |
21390316
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Research Institution | Gunma Institute of Public Health and Environmental Sciences |
Principal Investigator |
林 泰秀 群馬県衛生環境研究所, 研究企画課係, 研究員 (30238133)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
外松 学 群馬県衛生環境研究所, 研究企画係, 研究員 (70251113)
朴 明子 群馬県衛生環境研究所, 研究企画係, 研究員 (50450375)
大木 健太郎 群馬県衛生環境研究所, 研究企画係, 研究員 (50400966)
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Keywords | 遺伝子 / ゲノム / マイクロアレイ / 癌 / 臨床 |
Research Abstract |
Isocitrate dehydrogenase(DH)はクエン酸回路の酵素で、脳腫瘍のゲノム解析により変異がみい出され、変異が悪性度の低い神経膠腫、急性骨髄性白血病(AML)でみられることが報告されている。今年度は、IDH1/2変異の関与を、神経芽腫(NB)、横紋筋肉腫(RMS)、Ewing/PNET腫瘍(EWS)、悪性ラブドイド腫瘍、脳腫瘍などの新鮮腫瘍や細胞株419検体で解析を行った。NBの2例で1塩基挿入によるfame shift(FS)変異(D143X)とミスセンス(MS)変異(I154V)を見出し、PNETの1例でMS変異(S389C)を検出した。またIDHZは1.塩基欠失によるFS変異がRMSの細胞株にみられ、NB1例(P23R)、EWS1例(I142L)、神経膠芽腫1株(V8A)にMS変異が同定された。IDH変異の頻度はNB3/132(2.3%)、Ewing肉腫1/55(1.8%),PNET1/22(4.5%)と低いが、一部の腫瘍の発症・進展に関与している可能性が示唆された。 さらに次世代シーケンサー(Illumind社)を用いて、エクソーム解析とSTAT3、AKTなどALK pathwayに関連する遺伝子群の解析を行った。エクソーム解析には病期4のNB3例を、またALK pathwayの遺伝子解析にはNB80例を検討し、新規異常を複数検出した。ALK pathwayを阻害する低分子化合物、TAW684、2、4-PDD(pyrimidinediamine derivative)およびPFO2341066のNB24株とEWS、RMS16株でIC50値と細胞:増殖速度を測定したところ、NBはEWS、RMSと比べて比較的阻害剤の効果が高いことが判明した。ALK pathwayはNBの発症に重要な役割をはたしており、治療標的になりうることが示唆された。
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Research Products
(55 results)
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[Journal Article] RAS mutations are frequent in FAB type M4 and M5 of acute myeloid leukemia, and related to late relapse : a study of the Japanese Childhood AML Cooperative Study Group2012
Author(s)
Sano H, Shimada A, Taki T, Murata C, Park MJ, Sotomatsu M, Tabuchi K, Tawa A, Kobayashi R, Horibe K, Tsuchida M, Hanada R, Tsukimoto I, Hayashi Y.
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Journal Title
Int J Hematol
Volume: 95
Pages: 509-515
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Identification of TRIB1 R107L gain-of-function mutation in human acute megakaryocytic leukemia2012
Author(s)
Yokoyama T, Toki T, Aoki Y, Kanezaki R, Park MJ, Kanno Y, Takahara T, Yamazaki Y, Ito E, Hayashi Y, Nakamura T.
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Journal Title
Blood
Volume: 119
Pages: 2608-2611
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Clinical significance of early T-cell precursor acute lymphoblastic leukaemia : Results of the Tokyo Children's Cancer Study Group Study L99-152012
Author(s)
Inukai T, Kiyokawa N, Campana D, Coustan-Smith E, Kikuchi A, Kobayashi M, Takahashi H, Koh K, Manabe A, Kumagai M, Ikuta K, Hayashi Y, Tsuchida M, Sugita K, Ohara A.
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Journal Title
Brit J Haematol
Volume: 156
Pages: 358-365
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] DNMT3A mutations are rare in childhood acute myeloid leukaemia, myelodysplastic syndromes and juvenile myelomonocytic leukaemia2012
Author(s)
Shiba N, Taki T, Park MJ, Shimada A, Sotomatsu M, Adachi S, Tawa A, Horibe K, Tsuchida M, Hanada R, Tsukimoto I, Arakawa H, Hayashi Y.
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Journal Title
Br J Haematol
Volume: 156
Pages: 413-414
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] CBL mutations in infant acute lymphoblastic leukaemia2012
Author(s)
Shiba N, Park MJ, Taki T, Takita J, Hiwatari M, Kanazawa T, Sotomatsu M, Ishii E, Arakawa H, Ogawa S, Hayashi Y.
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Journal Title
Br J Haematol
Volume: 156
Pages: 672-674
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Aberrations of NEGR1 on 1p31 and MYEOV on 11q13 in neuroblastoma2011
Author(s)
Takita J, Chen Y, Okubo J, Sanada M, Adachi M, Ohki K, Nishimura R, Hanada R, Igarashi T, Hayashi Y, Ogawa S.
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Journal Title
Cancer Sci
Volume: 102
Pages: 1645-1650
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] IDH1 and IDH2 mutations are rare in pediatric myeloid malignancies2011
Author(s)
Oki K, Takita J, Hiwatari M, Nishimura R, Sanada M, Okubo J, Adachi M, Sotomatsu M, Kikuchi A, Igarashi T, Hayashi Y, Ogawa S.
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Journal Title
Leukemia
Volume: 25
Pages: 382-384
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Aberrant activation of ALK kinase by a novel truncated form ALK protein in neuroblastoma
Author(s)
Okubo J, Takita J, Chen Y, Oki K, Nishimura R, Kato M, Sanada M, Hiwatari M, Hayashi Y, Igarashi T, Ogawa S.
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Journal Title
Oncogene
Volume: (in press)
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Novel splicing factor mutations in juvenile myelomonocytic leukemia
Author(s)
Takita J, Yoshida K, Sanada M, Nishimura R, Okubo J, Motomura A, Hiwatari M, Oki K, Igarashi T, Hayashi Y, Ogawa S.
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Journal Title
Leukemia
Volume: (in press)
DOI
Peer Reviewed
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[Presentation] NUP98-NSD1 fusion gene is strongly associated with a poor prognosis in pediatric acute myeloid leukemia : a study of the Japanese Childhood AML99 Cooperative Study Group2011
Author(s)
Shiba N, Taki T, Park M, Murata C, Oki K, Ichikawa H, Shimada A, Kanazawa T, Sotomatsu M, Tabuchi K, Adachi S, Tawa A, Horibe K, Tsuchida M, Hanada R, Tsukimoto I, Arakawa H, Hayashi Y.
Organizer
53rd Annual Meeting of the American Society of Hematology
Place of Presentation
San Diego
Year and Date
20111209-13
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[Presentation] JAK2 mutations and CRLF2 rearrangements in down syndrome associated acute lymphoblastic leukemia in Japan2011
Author(s)
Hanada I, Terui K, Toki T, Kudo K, Sato T, Kamio T, Sasaki S, Takahashi Y, Hayashi Y, Sugita K, Kojima S, Koike K, Kosaka Y, Kobayashi M, Ito E.
Organizer
53rd Annual Meeting of the American Society of Hematology
Place of Presentation
San Diego
Year and Date
20111209-13
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[Presentation] Heterogeneity in infants with acute myeloid leukemia : retrospective analysis of a Japanese nationwide survey2011
Author(s)
Shimada A, Tomizawa D, Kinoshita A, Hamamoto K, Tsukimoto I, Ogawa A, Taga T, Imamura T, Tawa A, Horibe K, Taki T, Hayashi Y, Adachi S.
Organizer
53rd Annual Meeting of the American Society of Hematology
Place of Presentation
San Diego
Year and Date
20111209-13
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[Presentation] GATA1 mutants lacking Rb-binding motif observed in transient abnormal myelopoiesis in down syndrome2011
Author(s)
Toki T, Kobayashi E, Kanezaki R, Wang RN, Terui K, Kanegane H, Maeda M, Endo M, Mizuochi T, Adach S, Hayashi Y, Shimizu R, Yamamoto M, Ito E.
Organizer
53rd Annual Meeting of the American Society of Hematology
Place of Presentation
San Diego
Year and Date
20111209-13
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[Presentation] TCCSG小児B前駆細胞型急性リンパ性白血病におけるCRLF2とIKZF1の解析2011
Author(s)
大木健太郎,大喜多肇,小林健一郎,清河信敬,朴明子,新井心,外松学,柴徳生,福島敬,康勝好,花田良二,真部淳,菊地陽,小原明,土田昌宏,林泰秀
Organizer
第53回日本小児血液・がん学会学術集会
Place of Presentation
前橋
Year and Date
2011-11-27
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[Presentation] ダウン症候群関連ALLの発症におけるJAK2、およびCRLF2遺伝子異常の解析2011
Author(s)
花田勇,照井君典,土岐力,工藤耕,佐藤知彦,神尾卓哉,佐々木伸也,高橋良博,林泰秀,杉田完爾,小島勢二,小池健一,小阪嘉之,小林正夫,伊藤悦朗
Organizer
第53回日本小児血液・がん学会学術集会
Place of Presentation
前橋
Year and Date
2011-11-27
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[Presentation] ASPL-TFE3キメラ遺伝子にて診断確定を得た膣原発alveolar soft part sarcomaの一例2011
Author(s)
新井心,朴明子,大木健太郎,外松学,土岐文彰,山本英輝,西明,鈴木則夫,畠山信逸,中村和人,平戸純子,林泰秀
Organizer
第53回日本小児血液・がん学会学術集会
Place of Presentation
前橋
Year and Date
2011-11-27
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[Presentation] 次世代シークエンサによる神経芽腫のエクソーム解析2011
Author(s)
西村力,滝田順子,吉田健一,白石友一,川幡亮一郎,永田安伸,大久保淳,真田昌,林泰秀,五十嵐隆,宮野悟,小川誠司
Organizer
第53回日本小児血液・がん学会学術集会
Place of Presentation
前橋
Year and Date
2011-11-26
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[Presentation] 小児急性白血病におけるDNMT3A遺伝子変異の解析2011
Author(s)
柴徳生,朴明子,村田知里,嶋田明,滝智彦,外松学,田渕健,足立壮一,多和昭雄,堀部敬三,土田昌宏,花田良二,月本一郎,荒川浩一,林泰秀
Organizer
第53回日本小児血液・がん学会学術集会
Place of Presentation
前橋
Year and Date
2011-11-25
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[Presentation] 小児急性骨髄性白血病におけるNUP98-NSD転座の解析2011
Author(s)
柴徳生,朴明子,村田知里,嶋田明,滝智彦,外松学,田渕健,足立壮一,多和昭雄,堀部敬三,土田昌宏,花田良二,月本一郎,荒川浩一,林泰秀
Organizer
第53回日本小児血液・がん学会学術集会
Place of Presentation
前橋
Year and Date
2011-11-25
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[Presentation] T細胞型小児急性リンパ性白血病における遺伝子異常の解析2011
Author(s)
朴明子,清河信敬,小田慈,真部淳,原純一,小原明,花田良二,土田昌宏,小川誠司,堀部敬三,林泰秀
Organizer
第53回日本小児血液・がん学会学術集会
Place of Presentation
前橋
Year and Date
2011-11-25
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[Presentation] 乳児白血病におけるIDH1およびIDH2遺伝子の解析2011
Author(s)
樋渡光輝,大木健太郎,滝田順子,西村力,真田昌,大久保淳,外松学,菊地陽,五十嵐隆,林泰秀,小川誠司
Organizer
第53回日本小児血液・がん学会学術集会
Place of Presentation
前橋
Year and Date
2011-11-25
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[Presentation] ダウン症候群に合併した一過性骨髄増殖症(TAM)および急性巨核芽球性白血病(AMKL)の全エクソンシーケンス2011
Author(s)
吉田健一,土岐力,朴明子,永田安伸,王汝南,白石友一,真田昌,昆彩菜,佐藤亜依子,長崎正朗,宮野悟,金兼弘和,川上清,加藤剛二,小島勢二,林泰秀,伊藤悦朗,小川誠司
Organizer
第53回日本小児血液・がん学会学術集会
Place of Presentation
前橋
Year and Date
2011-11-25
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[Presentation] Novel GATA1 mutants with internal deletions in transient abnormal myelopoiesis in down syndrome2011
Author(s)
Toki T, Kobayashi E, Kanezaki R, Wang R, Terui K, Kanegane H, Maeda M, Koike T, Endo M, Adachi S, Hayashi Y, Shimizu R, Yamamoto M, Ito E.
Organizer
第73回日本血液学会学術集会
Place of Presentation
名古屋
Year and Date
2011-10-15
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[Presentation] Whole exome analysis of transient abnormal myelopoiesis and acute megakaryocytic leukemia with Down syndrome2011
Author(s)
Yoshida K, Toki T, Park MJ, Nagata Y, Wang R, Shiraishi Y, Sanada M, Nagasaki M, Miyano S, kanegane H, Kawakami K, Kato K, Hayashi Y, Ito E, Ogawa S.
Organizer
第73回日本血液学会学術集会
Place of Presentation
名古屋
Year and Date
2011-10-15
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[Presentation] The clinical significance of LEF1 mutation in childhood acute lymphblastic leukemia2011
Author(s)
Park MJ, Kiyokawa N, Oda M, Manabe A, Hara J, Ohara A, Hanada R, Tsuchida M, Ogawa S, Horibe K, Hayashi Y.
Organizer
第73回日本血液学会学術集会
Place of Presentation
名古屋
Year and Date
2011-10-15
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[Presentation] Mutation analysis for IDH1 and IDH2 in infantile leukemia2011
Author(s)
Hiwatari M, Ohki K, Takita J, Nishimura R, Sanada M, Okubo J, Sotomatsu M, Kikuchi A, Igarashi T, Hayashi Y, Ogawa S.
Organizer
第73回日本血液学会学術集会
Place of Presentation
名古屋
Year and Date
2011-10-14
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[Presentation] 次世代シーケンサーによる神経芽腫のエクソーム解析2011
Author(s)
西村力,滝田順子,吉田健一,白石友一,川幡亮一郎,永田安伸,大久保淳,真田昌,五十嵐隆,林泰秀,宮野悟,小川誠司
Organizer
第70回日本癌学会学術総会
Place of Presentation
名古屋
Year and Date
2011-10-04
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