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2011 Fiscal Year Annual Research Report

植物ヘテロクロマチン領域の反復配列サイレンシング機構の解明

Research Project

Project/Area Number 21570008
Research InstitutionNational Institute of Agrobiological Sciences

Principal Investigator

土生 芳樹  独立行政法人農業生物資源研究所, ゲノム機能改変研究ユニット, 主任研究員 (80266915)

Keywordsエピジェネティクス / シロイヌナズナ / DNAメチル化 / ヒストンメチル化 / Morpheus' Molecule 1 / トランスポゾン / 小分子RNA / サイレンシング
Research Abstract

本年度は、RdDM経路やヒストン修飾の段階で機能するさまざまな因子遺伝子とMOM1との多重変異体の解析と、MOM1に見られるクロモドメインの機能解析を行った。
1、mom1変異体とkyp変異体(ヒストンH3K9メチル基転移酵素遺伝子の変異体)およびago4変異体(RdDM経路で機能するARGONAUTEタンパク質遺伝子の変異体)を交配し、mom1 kypおよびmom1 ago4二重変異体を得た。現在、内在性不活性化領域を指標として、これらの変異体におけるヒストン修飾状態の解析をChIPにより進めている。
2、イネMOM1にはシロイヌナズナMOM1には見られないクロモドメインが存在する。MOM1によるサイレンシング機構におけるクロモドメインの必要性を検証するために、イネを用いた解析を行った。イネにはMOM1遺伝子が2コピー存在するが、これまでの解析から、そのうちの片方(MOM1b)が内在性トランスポゾン様配列(Pong6)のサイレンシングに必要であることが明らかになっている。2kbのプロモータ領域を含む野生型MOMlb遺伝子およびクロモドメ・インがメチル化リシンに結合する機能に必須の役割を果たすアミノ酸残基に変異を導入した変異型MOM1b遺伝子にtriple HAタグを結合してmom1b遺伝子変異体に導入し、Pong6のRNA蓄積量を指標とした相補実験を行ったところ、野生型、変異型いずれのMOM1b遺伝子の導入個体においてPog86の発現抑制が見られた。このことは、イネMOM1に存在するクロモドメインがサイレンシング機能に必要ではないことを示唆する。他の植物種のMOM1タンパク質が持つPHD fingerなどのクロマチン関連モチーフもシロイヌナズナMOM1には存在しないことと合わせて、MOM1がCHD3タンパク質から進化してきた過程で、クロモドメインやPHD fingerなどのドメインを必要としない特殊なサイレンシング機構を獲得したことが考えられる。

Research Products

(6 results)

All 2011

All Journal Article Presentation Book

  • [Journal Article] siRNA-mediated chromatin maintenance and its function in Arabidopsis thaliana2011

    • Author(s)
      Tatsuo Kanno, Yoshki Habu
    • Journal Title

      Biochim Biophys Acta

      Volume: 1809 Pages: 444-451

    • DOI

      10.1016/j.bbagrm.2011.05.002

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Involvement of SGS3 in trans-acting siRNA production in Arabidopsis thaliana2011

    • Author(s)
      Yoshikawa M, 他
    • Organizer
      NTU-JST Join Meeting on RNA and Biofunctions-Asia Studies
    • Place of Presentation
      台北(台湾)
    • Year and Date
      20111110-20111112
  • [Presentation] Processing of miR173-targeted TAS RNAs in Arabidopsis thaliana2011

    • Author(s)
      Yoshikawa M, 他
    • Organizer
      The 16th Annual Meeting of the RNA Society and The 13th Annual Meeting of the RNA Society of Japan
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      20110614-20110618
  • [Presentation] ペチュニア園芸品種(Petunia x hybrida)にピコティ形質を付与する低分子RNAの解析2011

    • Author(s)
      森田裕将, 他
    • Organizer
      園芸学会平成23年度春季大会
    • Place of Presentation
      宇都宮
    • Year and Date
      2011-03-20
  • [Book] Mechanisms linking cytosine methylation to histone modification in Arabidopsis thaliana. In : Non coding RNAs in plants2011

    • Author(s)
      Kyohei Arita, et al
    • Total Pages
      237-249
    • Publisher
      Springer
  • [Book] 植物におけるRNAサイレンシング機構:転写後型ジーンサイレンシング(PTGS)と転写型ジーンサイレンシング(TGS)2011

    • Author(s)
      吉川学, 他
    • Total Pages
      706-711
    • Publisher
      学研メディカル秀潤社

URL: 

Published: 2013-06-26  

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