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2022 Fiscal Year Research-status Report

Structural basis for histone discrimination mechanism by FACT

Research Project

Project/Area Number 21K06021
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

津中 康央 (津中康央)  大阪大学, 大学院工学研究科, 特任講師(常勤) (40551552)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
KeywordsFACT / ヒストンバリアント / ヌクレオソーム / ヒストン交換 / ヒストンテイル / 構造生物学
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、FACTがどのように標準的なヒストンとヒストンバリアントを識別し、ヌクレオソーム構造を変化させているのかを明らかにしたい。そのためにまず、これまで見つかっていないヒストン側のFACT相互作用部位を同定することを目指した。今年度も引き続き、核磁気共鳴 (NMR) 解析により、H2A-H2B二量体やH3-H4四量体とFACTのこれまで見つかっていない相互作用部位を探索した。NMRは比較的弱く、動的な相互作用部位であっても解析することが可能である。その結果、昨年度に同定したヒストンテイルの領域に加えて、これまで見つかっていないヒストン構造領域でのFACT結合部位を同定した。このうち、昨年度に同定したヒストンテイル領域のこれまで見つかっていないFACT結合部位については、学術論文にまとめ、学術雑誌に掲載された。さらに、昨年度に同定された結合部位のうち、FACTと関連するヒストンバリアントで保存されていない領域のアミノ酸残基をバリアント型に変異させたものを遺伝子構築している。今後、これを用いて、ヒストン交換反応が変化するかどうかを調べる予定。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

FACTと関連するヒストンバリアントで保存されていない領域のアミノ酸残基をバリアント型に変異させたものを遺伝子の構築が遅れているため。

Strategy for Future Research Activity

今年度に同定された結合部位のうち、FACTと関連するヒストンバリアントで保存されていない領域のアミノ酸残基をバリアント型に変異させたものを遺伝子構築し、変異体の発現精製を行う。これを用いて、ヒストン交換反応が変化するかどうかを調べる予定。逆にヒストンバリアントの標準的ヒストンへの変異の効果も同様に調べる予定。これらの生化学的解析により、この部位が本当にFACTによるヒストン識別部位か否か、さらに ヒストン交換反応にどのような効果があるのかを明らかにする。

Causes of Carryover

新型コロナウィルス感染症拡大のため、参加予定だった学会に参加できず、旅費を使用できなかった。この未使用分は次年度に構造解析用のPCの購入費に充てる予定である。

  • Research Products

    (3 results)

All 2022

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 1 results)

  • [Journal Article] FACT modulates the conformations of histone H2A and H2B N-terminal tails within nucleosomes2022

    • Author(s)
      Tsunaka Yasuo、Ohtomo Hideaki、Nishimura Yoshifumi
    • Journal Title

      Communications Biology

      Volume: 5 Pages: 814

    • DOI

      10.1038/s42003-022-03785-z

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Histone tail network and modulation in a nucleosome2022

    • Author(s)
      Tsunaka Yasuo、Furukawa Ayako、Nishimura Yoshifumi
    • Journal Title

      Current Opinion in Structural Biology

      Volume: 75 Pages: 102436~102436

    • DOI

      10.1016/j.sbi.2022.102436

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Dynamic structures of intrinsically disordered proteins related to the general transcription factor TFIIH, nucleosomes, and histone chaperones2022

    • Author(s)
      Okuda Masahiko、Tsunaka Yasuo、Nishimura Yoshifumi
    • Journal Title

      Biophysical Reviews

      Volume: 14 Pages: 1449~1472

    • DOI

      10.1007/s12551-022-01014-9

    • Peer Reviewed

URL: 

Published: 2023-12-25  

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