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2021 Fiscal Year Research-status Report

ゲノム・エピゲノムデータを用いた若年自殺リスクのバイオマーカー開発

Research Project

Project/Area Number 21K15712
Research InstitutionKobe University

Principal Investigator

大塚 郁夫  神戸大学, 医学部附属病院, 助教 (40722880)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2023-03-31
Keywords若年自殺 / ゲノム / エピゲノム / バイオマーカー
Outline of Annual Research Achievements

日米において、若年者の自殺率は高止まり・増加の一途を辿っており、深刻な社会問題である。またCOVID-19による種々のストレスにより、さらなる自殺の増加が世界的に懸念されている。自殺者試料の収集が困難なため、自殺の遺伝学的知見の獲得は大幅に遅れている中、申請者は、国内唯一・世界最大規模の自殺者DNA試料を有し、網羅的ゲノム・エピゲノム解析により、30歳代以下の自殺者における①末梢血テロメア異常短縮、②末梢血DNAメチル化年齢の異常老齢化、③自殺リスクに強く関連するGTF2IRD1遺伝子多型の存在、という予備的知見を見出した。本研究では、日本人若年自殺者及び、強い自殺念慮を有する若年者、さらには白人集団の追加試料を用いて上述の知見を多角的に追試し、臨床現場で真に有用な若年自殺リスクのバイオマーカーとなりうるかを検討する。本年度は約20例の若年自殺関連試料の網羅的メチル化データ取得や、約350例の自殺関連試料のGTF2IRD1遺伝子多型データ取得を実施し、2022年度の最終解析に向けて順調に準備を進めることができた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

予定していた若年自殺関連の試料数の網羅的メチル化データやGTF2IRD1遺伝子多型データを取得できており、遺伝学的統計解析手法の洗練含め、2022年度の最終解析に向けて順調に準備を進めることができている。

Strategy for Future Research Activity

本研究で新たに取得する若年自殺者および自殺念慮を有する若年者(と対照群)のゲノム・エピゲノムデータの解析により、30歳代以下の自殺者における①末梢血テロメア異常短縮、②末梢血DNAメチル化年齢の異常老齢化、③自殺リスクに強く関連するGTF2IRD1遺伝子多型、の知見を多角的に追試し、臨床現場で真に有用な若年自殺リスクのバイオマーカーとなりうるかを検討する。代表者らは現在、自殺者GWAS等のスケールアップも実施中であり、より確度の高いバイオマーカーとしての可能性を探るため、上記①②③の知見と併用できうる新たな遺伝統計学的データの探索も同時に進めていく。

  • Research Products

    (14 results)

All 2022 2021 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (12 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 10 results,  Open Access: 6 results) Presentation (1 results)

  • [Int'l Joint Research] Columbia University(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      Columbia University
  • [Journal Article] Polymorphisms in the hypoxia inducible factor binding site of the macrophage migration inhibitory factor gene promoter in schizophrenia2022

    • Author(s)
      Okazaki Satoshi、Boku Shuken、Watanabe Yuichiro、Otsuka Ikuo、Horai Tadasu、Morikawa Ryo、Kimura Atsushi、Shimmyo Naofumi、Tanifuji Takaki、Someya Toshiyuki、Hishimoto Akitoyo
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 17 Pages: e0265738

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0265738

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Novel missense SETD1A variants in Japanese patients with schizophrenia: Resequencing and association analysis2022

    • Author(s)
      Morikawa Ryo、Watanabe Yuichiro、Igeta Hirofumi、Arta Reza K.、Ikeda Masashi、Okazaki Satoshi、Hoya Satoshi、Saito Takeo、Otsuka Ikuo、Egawa Jun、Tanifuji Takaki、Iwata Nakao、Someya Toshiyuki
    • Journal Title

      Psychiatry Research

      Volume: 310 Pages: 114481~114481

    • DOI

      10.1016/j.psychres.2022.114481

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Epigenetic clock analysis and increased plasminogen activator inhibitor-1 in high-functioning autism spectrum disorder2022

    • Author(s)
      Okazaki Satoshi、Kimura Ryo、Otsuka Ikuo、Funabiki Yasuko、Murai Toshiya、Hishimoto Akitoyo
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 17 Pages: e0263478

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0263478

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Accelerated epigenetic age and shortened telomere length based on DNA methylation in Nicolaides?Baraitser syndrome2022

    • Author(s)
      Shinko Yutaka、Okazaki Satoshi、Otsuka Ikuo、Horai Tadasu、Kim Saehyeon、Tanifuji Takaki、Hishimoto Akitoyo
    • Journal Title

      Molecular Genetics & Genomic Medicine

      Volume: 10 Pages: e1876

    • DOI

      10.1002/mgg3.1876

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Dissecting the Shared Genetic Architecture of Suicide Attempt, Psychiatric Disorders, and Known Risk Factors.2022

    • Author(s)
      International Suicide Genetics Consortium.
    • Journal Title

      Biological Psychiatry

      Volume: 91 Pages: 313~327

    • DOI

      10.1016/j.biopsych.2021.05.029

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Searching for biomarkers in schizophrenia and psychosis: Case‐control study using capillary electrophoresis and liquid chromatography time‐of‐flight mass spectrometry and systematic review for biofluid metabolites2021

    • Author(s)
      Kim Saehyeon、Okazaki Satoshi、Otsuka Ikuo、Shinko Yutaka、Horai Tadasu、Shimmyo Naofumi、Hirata Takashi、Yamaki Naruhisa、Tanifuji Takaki、Boku Shuken、Sora Ichiro、Hishimoto Akitoyo
    • Journal Title

      Neuropsychopharmacology Reports

      Volume: 42 Pages: 42~51

    • DOI

      10.1002/npr2.12223

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A preliminary genetic association study of GAD1 and GABAB receptor genes in patients with treatment-resistant schizophrenia2021

    • Author(s)
      Miyazawa Atsuhiro、Kanahara Nobuhisa、Kogure Masanobu、Otsuka Ikuo、Okazaki Satoshi、Watanabe Yoshinori、Yamasaki Fumiaki、Nakata Yusuke、Oda Yasunori、Hishimoto Akitoyo、Iyo Masaomi
    • Journal Title

      Molecular Biology Reports

      Volume: 49 Pages: 2015~2024

    • DOI

      10.1007/s11033-021-07019-z

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mapping the genetic architecture of suicide attempt and suicide death using polygenic risk scores for clinically-related psychiatric disorders and traits2021

    • Author(s)
      Otsuka Ikuo、Galfalvy Hanga、Guo Jia、Akiyama Masato、Rujescu Dan、Turecki Gustavo、Hishimoto Akitoyo、Mann J. John
    • Journal Title

      Psychological Medicine

      Volume: Epub Pages: 1~9

    • DOI

      10.1017/S0033291721004700

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Association of Two Variable Number of Tandem Repeats in the Monoamine Oxidase A Gene Promoter with Schizophrenia2021

    • Author(s)
      Tanifuji Takaki、Okazaki Satoshi、Otsuka Ikuo、Horai Tadasu、Shinko Yutaka、Kim Saehyeon、Sora Ichiro、Hishimoto Akitoyo
    • Journal Title

      Neuropsychiatric Disease and Treatment

      Volume: Volume 17 Pages: 3315~3323

    • DOI

      10.2147/NDT.S338854

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Serum levels of glial cell line-derived neurotrophic factor as a biomarker for mood disorders and lithium response2021

    • Author(s)
      Idemoto Keita et al.
    • Journal Title

      Psychiatry Research

      Volume: 301 Pages: 113967~113967

    • DOI

      10.1016/j.psychres.2021.113967

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 臨床での活用が期待される自殺の生物学的知見2021

    • Author(s)
      大塚郁夫, 菱本明豊.
    • Journal Title

      医学のあゆみ

      Volume: 279(1) Pages: 29~34

  • [Journal Article] 自殺の神経生物学的異常2021

    • Author(s)
      大塚郁夫, 菱本明豊.
    • Journal Title

      臨床精神医学

      Volume: 50(6) Pages: 577~583

  • [Presentation] 日本人自殺者のゲノムワイド関連解析2021

    • Author(s)
      大塚郁夫
    • Organizer
      第43回日本生物学的精神医学会・第51回日本神経精神薬理学会合同年会

URL: 

Published: 2022-12-28  

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