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2022 Fiscal Year Annual Research Report

ゲノム・エピゲノムデータを用いた若年自殺リスクのバイオマーカー開発

Research Project

Project/Area Number 21K15712
Research InstitutionKobe University

Principal Investigator

大塚 郁夫  神戸大学, 医学部附属病院, 助教 (40722880)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2023-03-31
Keywords若年自殺 / ゲノム / エピゲノム / バイオマーカー
Outline of Annual Research Achievements

最新の日本国内人口動態統計によると、10~44歳の死因第1位は「自殺」である。このように若年者の自殺率は高止まり・増加の一途を辿っており、深刻な社会問題とされる。またCOVID-19による種々のストレスにより、さらなる自殺の増加が世界的に懸念されている。自殺者試料の収集が困難なため、自殺の遺伝学的知見の獲得は大幅に遅れている中、申請者は、国内唯一・アジア圏最大の自殺者DNA試料を有し、プーリングサンプルを用いた網羅的ゲノム・エピゲノム解析により、30歳代以下の自殺者における①末梢血テロメア異常短縮、②末梢血DNAメチル化年齢の異常老齢化、③自殺リスクに強く関連するGTF2IRD1遺伝子多型の存在、という予備的知見を見出した。本研究では、20例の若年自殺者末梢血DNA各々のInfinium MethylationEPIC arrayによる網羅的メチル化データ取得を新たに行い、末梢血テロメア異常短縮、末梢血DNAメチル化年齢の異常老齢化、さらには末梢血natural killer細胞数異常増加の知見を独立サンプルで追試・見出すことができた。現在、若年自殺者の網羅的メチル化データのサンプルサイズをさらにスケールアップしている。また若年自殺者を含む約600例の自殺者のGTF2IRD1遺伝子多型データの追加取得も完了し、現在、理化学研究所BBJのコントロールデータを比較対照群として用いながら、同多型の若年自殺への効果を解析中である。

  • Research Products

    (13 results)

All 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (9 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 9 results,  Open Access: 2 results) Presentation (1 results) (of which Invited: 1 results) Book (2 results)

  • [Int'l Joint Research] Columbia University(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      Columbia University
  • [Journal Article] Epigenetic clock analysis reveals increased plasma cystatin C levels based on DNA methylation in major depressive disorder.2023

    • Author(s)
      Tanifuji T, Okazaki S, Otsuka I, Mouri K, Horai T, Shindo R, Shirai T, Hishimoto A.
    • Journal Title

      Psychiatry Research

      Volume: Epub ahead of print Pages: -

    • DOI

      10.1016/j.psychres.2023.115103

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Ribosomal DNA gene copies are increased in blood and brain of Japanese schizophrenia patients.2023

    • Author(s)
      Li S, Otsuka I, Tanifuji T, Okazaki S, Horai T, Takahashi M, Kondo T, Ueno Y, Hishimoto A.
    • Journal Title

      PLoS One

      Volume: 18 Pages: e0280694

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0280694

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Identification of Novel, Replicable Genetic Risk Loci for Suicidal Thoughts and Behaviors Among US Military Veterans.2023

    • Author(s)
      Kimbrel NA, et al; the International Suicide Genetics Consortium.
    • Journal Title

      JAMA Psychiatry

      Volume: 80 Pages: 135-145

    • DOI

      10.1001/jamapsychiatry.2022.3896

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Epigenetic clock analysis in methamphetamine dependence.2022

    • Author(s)
      Takemura Y, Tanifuji T, Okazaki S, Shinko Y, Otsuka I, Horai T, Shirai T, Aso K, Yamamoto N, Hishimoto A.
    • Journal Title

      Psychiatry Research

      Volume: 317 Pages: 114901

    • DOI

      10.1016/j.psychres.2022.114901

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Preventive effects of preoperative ramelteon on postoperative delirium in Asian elderly population: A randomized, double-blind, placebo-controlled trial, and a systematic review and meta-analysis.2022

    • Author(s)
      Tanifuji T, Otsuka I, Okazaki S, Horai T, So R, Shiroiwa K, Mouri K, Tanaka M, Ohmoto N, Sora I, Hirai M, Fukumoto T, Ku Y, Hishimoto A.
    • Journal Title

      Asian Journal of Psychiatry

      Volume: 78 Pages: 103282

    • DOI

      10.1016/j.ajp.2022.103282

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Successful electroconvulsive therapy for 22q11.2 deletion syndrome with Schizophrenia and Parkinson's disease.2022

    • Author(s)
      Tanifuji T, Otsuka I, Kimura A, Horai T, Okazaki S, Satake W, Hishimoto A.
    • Journal Title

      Psychiatry and Clinical Neurosciences

      Volume: 76 Pages: 603-604

    • DOI

      10.1111/pcn.13467

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Improving polygenic prediction in ancestrally diverse populations.2022

    • Author(s)
      Ruan Y, Lin YF, Feng YA, Chen CY, Lam M, Guo Z; Stanley Global Asia Initiatives; He L, Sawa A, Martin AR, Qin S, Huang H, Ge T.
    • Journal Title

      Nature Genetics

      Volume: 54 Pages: 573-580

    • DOI

      10.1038/s41588-022-01054-7

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Epigenetic aging in Williams syndrome.2022

    • Author(s)
      Okazaki S, Kimura R, Otsuka I, Tomiwa K, Funabiki Y, Hagiwara M, Murai T, Hishimoto A.
    • Journal Title

      Journal of Child Psychology and Psychiatry

      Volume: 63 Pages: 1553-1562

    • DOI

      10.1111/jcpp.13613

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mapping the genetic architecture of suicide attempt and suicide death using polygenic risk scores for clinically-related psychiatric disorders and traits.2022

    • Author(s)
      Otsuka I, Galfalvy H, Guo J, Akiyama M, Rujescu D, Tureck G, Hishimoto A, Mann JJ.
    • Journal Title

      Psychological Medicine

      Volume: Epub ahead of print Pages: -

    • DOI

      10.1017/S0033291721004700

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] ゲノム/エピゲノム解析からみた自殺と細胞老化2022

    • Author(s)
      大塚郁夫
    • Organizer
      BPCNPNPPP4学会合同年会(東京)
    • Invited
  • [Book] 臨床での活用が期待される自殺の生物学的知見(別冊・医学のあゆみ)2022

    • Author(s)
      大塚郁夫、菱本明豊
    • Total Pages
      101
    • Publisher
      医歯薬出版株式会社
  • [Book] 不安と自殺・自傷 ー特に遺伝学的知見の観点からー(臨床精神医学)2022

    • Author(s)
      大塚郁夫、谷藤貴紀
    • Total Pages
      1088
    • Publisher
      アークメディア

URL: 

Published: 2023-12-25  

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