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2012 Fiscal Year Annual Research Report

ミトコンドリア膜を舞台としたタンパク質の交通管制機構の解明

Research Project

Project/Area Number 22227003
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

遠藤 斗志也  名古屋大学, 理学(系)研究科(研究院), 教授 (70152014)

Project Period (FY) 2010-05-31 – 2015-03-31
Keywordsミトコンドリア / 酵母 / トランスロケータ / 膜透過 / カルジオリピン / ERMES複合体
Research Abstract

酵母ミトコンドリアのタンパク質の交通管制システムについて,ミトコンドリアの膜構造,脂質,レドックス状態,ERとの関係なども含めて,その働く機構を理解することをめざした。
(1)ミトコンドリア機能に必須かつミトコンドリア特異的なリン脂質,カルジオリピンの合成経路は,ホスファチジン酸からCDP-DAGを合成するステップがミッシングリンクとなっていた。ERとミトコンドリアの両方で働くのではないかと言われていたCds1は,ERにのみ存在し,ミトコンドリアにはCds1以外のCDP-DAG合成酵素があることが示唆された。そこで,以前われわれが見出した,ミトコンドリア内膜トランスロケータのメンテナンス因子Tam41を酵母から精製し,Tam41がCDP-DAG合成酵素活性を持つことを直接確かめた。このことにより,カルジオリピン合成経路の全体像が完成した。
(2)ERとミトコンドリアをつなぐテザリング複合体ERMESの構成因子であるMdm12とMmm1を大腸菌に発現させて精製する実験系をつくった。Mdm12-Mmm1複合体,Mdm12について結晶化に成功した。X線構造解析を実施中である。
(3)ERMES複合体構成因子,ミトコンドリア内で脂質輸送に関わる可能性があるUps1/Ups2について,各々遺伝学的に相互作用する因子(各遺伝子欠失株について,合成増殖阻害を示す欠失変異株,多コピーサプレッサーとなる遺伝子)を検索し,多数の関連因子候補を得た。
(4)膜間部で酸化的リフォールディングを行うTim40-Erv1システムについて,基質類似ペプチドとTim40存在下でスピンラベルしたErv1を加え,Tim40のNMRシグナルがペプチドの存在に依存して緩和することを見出した。このことはTim40-基質-Erv1三者の複合体が重要な役割を果たすことを示す。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

当初はタンパク質の交通を中心にミトコンドリアの生合成の分子機構を解明することをめざしていた。今回,Tam41がカルジオリピン合成経路の最後のミッシングリンクであることを発見,さらにERMES,Ups1/Ups2などについて,脂質輸送との関連に関わる新しい知見が多数得られた。このことは,ミトコンドリア生合成を理解する上で,タンパク質トランスロケータを中心としたタンパク質の交通という観点からアプローチするだけではなく,脂質の交通という観点からも斬り込むことが必要な段階に来ていることを強く示唆するものであり,予想しなかった発展である。

Strategy for Future Research Activity

研究代表者が,名古屋大学から京都産業大学に異動したので,連携研究者の田村康(名古屋大学)を分担者に変更し,研究費を配分することで,京都産業大学と名古屋大学で,効率よく研究を推進したい。

  • Research Products

    (46 results)

All 2014 2013 2012 Other

All Journal Article (12 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Peer Reviewed: 11 results,  Open Access: 2 results,  Acknowledgement Compliant: 6 results) Presentation (33 results) (of which Invited: 9 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Multiple BiP genes of Alabidopsis thaliana are required for male gametogenesis and pollen competitiveness2014

    • Author(s)
      D. Maruyama, T. Sugiyama, T. Endo, and S. Nishikawa
    • Journal Title

      Plant Cell Physiol.

      Volume: 55 Pages: 801-810

    • DOI

      10.1093/pcp/pcu018

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Intra-molecular disulfide bond of Tim22 maintains integrity of the TIM22 complex in the mitochondrial inner membrane2014

    • Author(s)
      H. Okamoto, A. Miyagawa, T. Shiota, Y. Tamura and T. Endo
    • Journal Title

      J. Biol. Chem.

      Volume: 289 Pages: 4827-4838

    • DOI

      10.1074/jbc.M113.543264

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] A novel import route for an N-anchor mitochondrial outer membrane protein aided by the TIM23 complex2014

    • Author(s)
      J. Song, Y. Tamura, T. Yoshihisa, and T. Endo
    • Journal Title

      EMBO Rep.

      Volume: 15 Pages: 670-677

    • DOI

      10.1002/embr.201338142

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Ubiquitin is phosphorylated by PINK1 to activate parkin2014

    • Author(s)
      F. Koyano, K. Okatsu, H. Kosako, Y. Tamura, E. Go, M. Kimura, Y. Kimura, H. Tsuchiya, H. Yoshihara, T. Hirokawa, T. Endo, E. A. Fon, J. F. Trempe, Y. Saeki, K. Tanaka, and N. Matsuda
    • Journal Title

      Nature

      Volume: 510 Pages: 162-166

    • DOI

      10.1038/nature13392

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] NMR analyses on the interactions of the yeast Tim50 C-terminal region with the presequence and Tim50 core domain2014

    • Author(s)
      B. Rahman, S. Kawano, K. Yunoki-Esaki, T. Anzai, and T. Endo
    • Journal Title

      FEBS Lett.

      Volume: 588 Pages: 678-684

    • DOI

      10.1016/j.febslet.2013.12.037

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Tam41 is a CDP-diacylglycerol synthase required for cardiolipin biosynthesis in mitochondria2013

    • Author(s)
      Y. Tamura, Y. Harada, S. Nishikawa, K. Yamano, M. Kamiya, T. Shiota, T. Kuroda, O. Kuge, H. Sesaki, K. Imai, K. Tomii, and T. Endo
    • Journal Title

      Cell Metab.

      Volume: 17 Pages: 709-718

    • DOI

      10.1016/j.cmet.2013.03.018

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Unveiling the last missing link of the cardiolipin synthetic pathway in mitochondria2013

    • Author(s)
      Y. Tamura and T. Endo
    • Journal Title

      Aging

      Volume: 6 Pages: 392-393

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Yos9p and Hrd1p mediate ER retention of misfolded proteins for ER-associated degradation2012

    • Author(s)
      T. Izawa, H. Nagai, T. Endo, and S. Nishikawa
    • Journal Title

      Mol. Biol. Cell

      Volume: 23 Pages: 1283-1293

    • DOI

      10.1091/mbc.E11-08-0722

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] (Close Up実験法)動的なタンパク質相互作用の「スナップショット」を撮る~in vivoにおける部位特異的光架橋法2012

    • Author(s)
      塩田拓也,西川周一, 遠藤斗志也
    • Journal Title

      実験医学

      Volume: 30 Pages: 1799-1805

  • [Journal Article] Role of Dom34:Hbs1 in non-stop protein clearance for normal organelle protein influx2012

    • Author(s)
      T. Izawa, T. Tsuboi, K. Kuroha, T. Inada, S. Nishikawa, and T. Endo
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 2 Pages: 447-453

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2012.08.010

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The Tom40 assembly process probed using the attachment of different intra-mitochondrial sorting signals2012

    • Author(s)
      T. Shiota, M. Maruyama, M. Miura, Y. Tamura, K. Yamano, M. Esaki, and T. Endo
    • Journal Title

      Mol. Biol. Cell

      Volume: 23 Pages: 3936-3947

    • DOI

      10.1091/mbc.E12-03-0202

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Phosphatidylethanolamine biogenesis in mitochondria: phosphatidylserine (PS) trafficking is independent of a PS decarboxylase and intermembrane space proteins, Ups1p and Ups2p2012

    • Author(s)
      Y. Tamura, O. Onguka, K. Itoh, T. Endo, M. Iijima, S. M. Claypool, H. Sesaki
    • Journal Title

      J. Biol. Chem

      Volume: 287 Pages: 43961-43971

    • DOI

      10.1074/jbc.M112.390997

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] NMR investigations of presequence recognition by the C-terminal region of yeast Tim50 and their interactive relationship with Tim50core domain2013

    • Author(s)
      Bytul M. Rahman, Shin Kawano, Kaori Esaki, Takahiro Anzai, and Toshiya Endo
    • Organizer
      第36 回分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20131203-20131205
  • [Presentation] 出芽酵母におけるミトコンドリアクリステジャンクション形成因子Mcsタンパク質の輸送経路2013

    • Author(s)
      植田依里,田村康,遠藤斗志也
    • Organizer
      第36 回分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20131203-20131205
  • [Presentation] Analysis of two presequence binding domains of Tim52013

    • Author(s)
      Kaori Esaki, Bytul Rahman, Yuki Ishimaru, Shin Kawano, and Toshiya Endo
    • Organizer
      DynaMito 2013: The 4th International Symposium on Dynamics of Mitochondria - from Molecular Mechanisms to Physiological Functions and Disease
    • Place of Presentation
      沖縄
    • Year and Date
      20131028-20131101
  • [Presentation] Transport, assembly, and quality control of mitochondrial proteins in yeast2013

    • Author(s)
      Toshiya Endo
    • Organizer
      Yeast 2013 (The 26th International Conference on Yeast Genetics and Molecular Biology)
    • Place of Presentation
      Frankfurt, Germany
    • Year and Date
      20130829-20130903
    • Invited
  • [Presentation] タンパク質と脂質の輸送と合成からみた酵母ミトコンドリアの生合成機構2013

    • Author(s)
      遠藤斗志也
    • Organizer
      第185回酵母細胞研究会例会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2013-11-22
    • Invited
  • [Presentation] How the cell makes mitochondria: from the viewpoints of transport of proteins and lipids2013

    • Author(s)
      Toshiya Endo
    • Organizer
      DynaMito 2013: The 4th International Symposium on Dynamics of Mitochondria - from Molecular Mechanisms to Physiological Functions and Disease
    • Place of Presentation
      沖縄
    • Year and Date
      2013-10-28 – 2013-11-01
    • Invited
  • [Presentation] Novel pathway for import of yeast OM45 into the mitochondrial intermembrane space2013

    • Author(s)
      Jiyao Song, Tohry Yoshihisa, Yasushi Tamura, and Toshiya Endo
    • Organizer
      DynaMito 2013: The 4th International Symposium on Dynamics of Mitochondria - from Molecular Mechanisms to Physiological Functions and Disease
    • Place of Presentation
      沖縄
    • Year and Date
      2013-10-28 – 2013-11-01
  • [Presentation] Tam41 is a CDP-diacylglycerol synthase for cardiolipin biosynthesis in mitochondria2013

    • Author(s)
      Yasushi Tamura, Yoshihiro Harada, Shuh-ichi Nishikawa, Koji Yamano, Megumi Kamiya, Takuya Shiota, Takuya Kuroda, Osamu Kuge, Hiromi Sesaki, Kenichiro Imai, Kentaro Tomii, and Toshiya Endo
    • Organizer
      DynaMito 2013: The 4th International Symposium on Dynamics of Mitochondria - from Molecular Mechanisms to Physiological Functions and Disease
    • Place of Presentation
      沖縄
    • Year and Date
      2013-10-28 – 2013-11-01
  • [Presentation] Structural analysis of Mdm122013

    • Author(s)
      Shin Kawano, Si-quinbala, Eri Asai, and Toshiya Endo
    • Organizer
      DynaMito 2013: The 4th International Symposium on Dynamics of Mitochondria - from Molecular Mechanisms to Physiological Functions and Disease
    • Place of Presentation
      沖縄
    • Year and Date
      2013-10-28 – 2013-11-01
  • [Presentation] ERMES複合体構成タンパク質Mdm12の構造解析2013

    • Author(s)
      河野慎,スチンバラ,遠藤斗志也
    • Organizer
      第86回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2013-09-11 – 2013-09-13
  • [Presentation] Novel pathway for import of yeast OM45 into the mitochondrial intermembrane space2013

    • Author(s)
      Jiyao Song, Tohru Yoshihisa, Yasushi Tamura, and Toshiya Endo
    • Organizer
      第86回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2013-09-11 – 2013-09-13
  • [Presentation] ノンストップ膜タンパク質の品質管理機構の解析2013

    • Author(s)
      荒川俊輔,井澤俊明,西川周一,田村康,遠藤斗志也
    • Organizer
      第86回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2013-09-11 – 2013-09-13
  • [Presentation] ミトコンドリアにおけるリン脂質合成経路2013

    • Author(s)
      田村康,谷口真由美,神谷恵,遠藤斗志也
    • Organizer
      第86回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2013-09-11 – 2013-09-13
  • [Presentation] ミトコンドリア膜間部におけるタンパク質輸送機構の解明2013

    • Author(s)
      江崎芳,Bytul Rahman,石丸雄基,河野慎,遠藤斗志也
    • Organizer
      第86回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2013-09-11 – 2013-09-13
  • [Presentation] ミトコンドリアを介したリン脂質輸送因子の遺伝学的スクリーニングと機能解析2013

    • Author(s)
      田村 康, 谷口 真由美, 神谷 恵, 遠藤 斗志也
    • Organizer
      第65回細胞生物学会大会 シンポジウム「Proteostasis」
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2013-06-19 – 2013-06-21
    • Invited
  • [Presentation] OM45 is imported into the mitochondrial intermembrane space via a novel import pathway2013

    • Author(s)
      Jiyao Song, Tohru Yoshihissa, Yasushi Tamura, Toshiya Endo
    • Organizer
      第65回細胞生物学会大会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2013-06-19 – 2013-06-21
  • [Presentation] ERMES複合体Mdm12の構造解析2013

    • Author(s)
      河野慎,スチンバラ,遠藤斗志也
    • Organizer
      第13回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      鳥取
    • Year and Date
      2013-06-12 – 2013-06-14
  • [Presentation] OM45 is imported into the mitochondrial intermembrane space via a novel import pathway2013

    • Author(s)
      Jiyao Song, Tohru Yoshihisa, Yasushi Tamura, and Toshiya Endo
    • Organizer
      第77回日本生化学会中部支部例会・シンポジウム
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2013-05-25
  • [Presentation] 出芽酵母におけるミトコンドリアクリステジャンクション形成因子の輸送経路2013

    • Author(s)
      植田依里,田村康,河野慎,遠藤斗志也
    • Organizer
      第77回日本生化学会中部支部例会・シンポジウム
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2013-05-25
  • [Presentation] New perspective on biogenesis of mitochondrial proteins and lipids2013

    • Author(s)
      Toshiya Endo
    • Organizer
      EMBO Conference: From Structure to Function of Translocation Machines
    • Place of Presentation
      Dubrovnik, Croatia
    • Year and Date
      2013-04-13 – 2013-04-17
    • Invited
  • [Presentation] New perspective on biogenesis of mitochondrial proteins and lipids2012

    • Author(s)
      Toshiya Endo
    • Organizer
      第85回日本生化学会大会シンポジウム「New Paradigm of Organelle Biology and Physiology」
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20121214-20121216
    • Invited
  • [Presentation] ミトコンドリアを介したリン脂質生合成経路の解析2012

    • Author(s)
      田村康,遠藤斗志也
    • Organizer
      第85回日本生化学会大会シンポジウム「ミトコンドリアの動的な構造・機能変換とその生理機能」
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20121214-20121216
    • Invited
  • [Presentation] ミトコンドリア前駆体タンパク質の酸化における,Tim40/Mia40とErv1の構造基盤の解明2012

    • Author(s)
      安西高廣,河野慎,寺尾佳代子,遠藤斗志也
    • Organizer
      第85回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20121214-20121216
  • [Presentation] ERMES複合体構成因子Mdm12の結晶化2012

    • Author(s)
      河野慎,スチンバラ,遠藤斗志也
    • Organizer
      第85回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20121214-20121216
  • [Presentation] シロイヌナズナCPY*を用いた異常タンパク質の小胞体残留機構の解析2012

    • Author(s)
      荒川俊輔,井澤俊明,遠藤斗志也,西川周一
    • Organizer
      第85回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20121214-20121216
  • [Presentation] ERMESの形成過程および数の制御の解析2012

    • Author(s)
      前川健,田村康,吉久徹,遠藤斗志也
    • Organizer
      第85回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20121214-20121216
  • [Presentation] ミトコンドリアタンパク質輸送装置Tim22の分子内ジスルフィド結合の役割の解析2012

    • Author(s)
      岡本浩明,宮川明子,塩田拓也,田村康,遠藤斗志也
    • Organizer
      第85回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20121214-20121216
  • [Presentation] New perspective on import and maintenance of mitochondrial proteins2012

    • Author(s)
      Toshiya Endo
    • Organizer
      SFB594 3rd International Symposium Molecular Machines in Protein Folding and Translocation
    • Place of Presentation
      Munich, Germany
    • Year and Date
      20120723-20120725
    • Invited
  • [Presentation] オルガネラタンパク質の膜輸送システムにおけるDom34:Hbs1複合体の役割2012

    • Author(s)
      井澤俊明,黒羽一誠,稲田利文,西川周一,遠藤斗志也
    • Organizer
      第12回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      20120620-20120622
  • [Presentation] in vivo部位特異的光架橋法を用いたミトコンドリア外膜膜透過装置TOM40複合体の相互作用解析2012

    • Author(s)
      塩田拓也,崎山則征,神谷恵,島本真由子,今井賢一郎,浅野悠史,富井健太郎,Paul Horton,遠藤斗志也
    • Organizer
      第12回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      20120620-20120622
  • [Presentation] Tam41 is a novel CDP-diacylglycerol synthase for cardiolipin biosynthesis in mitochondria2012

    • Author(s)
      田村康,原田佳宗,西川周一,塩田拓也,神谷恵,山野晃史,黒田拓也,久下理,瀬崎博美,遠藤斗志也
    • Organizer
      第12回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      20120620-20120622
  • [Presentation] New insight into mitochondrial biogenesis

    • Author(s)
      Toshiya Endo
    • Organizer
      Organelle Homeostasis Research Center: Kick-off Symposium
    • Place of Presentation
      福岡
    • Invited
  • [Presentation] NMRによるミトコンドリア酸化還元トランスロケータTim40の基質認識機構の解析

    • Author(s)
      安西高廣,河野慎,遠藤斗志也
    • Organizer
      2013年度生物物理学会中部支部
    • Place of Presentation
      岡崎
  • [Book] Meth. Mol. Biol. "Membrane Biogenesis" (eds. D. Rapaport and J. M. Herrmann)pp207-2172013

    • Author(s)
      T. Shiota, S. Nishikawa, and T. Endo
    • Total Pages
      404
    • Publisher
      Springer

URL: 

Published: 2015-05-28  

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