2013 Fiscal Year Annual Research Report
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22229009
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
酒井 寿郎 東京大学, 先端科学技術研究センター, 教授 (80323020)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
川村 猛 東京大学, 先端科学技術研究センター, 特任助教 (70306835)
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| Project Period (FY) |
2010-05-31 – 2015-03-31
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| Keywords | メタボリックシンドローム / エピゲノム / ピストン修飾酵素 / 脂肪細胞分化 |
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| Research Abstract |
JHDM2Aがβアドレナリンの刺激を受け、Aキナーゼ(PKA)によってリン酸化を受けることを見出した。このリン酸化により、SWI/SNFクロマチンリモデラー蛋白質と核内受容体PPARγとが複合体形成することを見出した。PPARγは遠位のエンハンサー領域に結合しており、PKA依存的に遠位エンハンサーがプロモーターに近接することを見出した。このようなメカニズムによりエンハンサー上のPPARγやC/EBPαやβが転写活性に寄与することを発見した。
また、JHDM2Aの高感度モノクローナル抗体、リン酸化抗体の作製に成功し、ChIP Seqやプロテオミクス解析に供した。H3K9メチル化酵素SETDB1についても、同様に高感度モノクローナル抗体作製からChIP Seqに成功し、SETDB1がC/EBPαに結合して転写を抑制することそして、その結合様式として、DNAのメチル化を認識することを見出した。
SETD5についても、同様に抗体を作製し、ChIP Seqを行い脂肪細胞分化抑制の標的となる遺伝子を探索した。またノックアウトマウスを樹立した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
1: Research has progressed more than it was originally planned.
Reason
JHDM2AとSETDB1抗体の作製からChIP Seq、プロテオミクス解析は計画通り進めた。一方、当初予想だにしなかったJHDM2Aのリン酸化による外的環境変化への応答という重要な発見をした。さらにそれが、long range DNA loopingを介して “On-Off”の急速な転写を制御しているあらたなモデルを提示した。さらに、JHDM2Aのリン酸化がメタボリックシンドロームのあらたな指標となりうる点などはさらなる発展が期待できる。
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| Strategy for Future Research Activity |
JHDM2AがSWI/SNF chromatin remodelerと複合体を形成すること、これにはセリンのリン酸化が必要であることを見出した。SWI/SNF chromatin remodelerは10数個のタンパク質から構成されているため、in vitro translationにもとづくGSTプルダウンなどにより、結合タンパク質を見出す。SWI/SNFタンパク質との巨大複合体を精製する。さらにはJHDM2AのChIP Seqのインフォマティクス解析を進める。結合するDNAモチーフやピークコール解析を行う。SETDB1については、PHDドメインがDNAのメチル化を認識することを見出した。このドメインのタンパクを精製し、直接結合を証明する。MBDのChIP Seqを行い、SETDB1の結合部位とどれだけオーバーラップするか解析する。SETD5は引き続き骨の解析を進める。
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Research Products
(14 results)
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[Journal Article] Direct evidence of chromatin structure change in KLF4 gene caused by pitavastatin in endothelial cells2014
Author(s)
Maejima T, Tanaka; T, Minami; T, Hamakubo; T, Ihara; S, Sakai; J, Nozaki; N, Aburatani; H, Ruan; X, Tanabe; H, Ruan; Y, Endo; A, Kodama; T, Wada Y
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Journal Title
PLoS One. 2014
Volume: 9
Pages: e96005
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Sterol-regulatory-element-binding protein 2 and nuclear factor Y control human farnesyl diphosphate synthase expression and affect cell proliferation in hepatoblastoma cells2013
Author(s)
Ishimoto K, Tachibana K, Hanano I, Yamasaki D, Nakamura H, Kawai M, Urano Y, Tanaka T, Hamakubo T, Sakai J, Kodama T, Doi T
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Journal Title
Biochem J
Volume: 429
Pages: 347-357
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Human mannose-binding lectin 2 is directly regulated by peroxisome proliferator-activated receptors (PPARs) via a peroxisome proliferator responsive element2013
Author(s)
Tachibana K, Takeuchi K, Inada H, Sugimoto K, Ishimoto K, Yamashita M, Maegawa T, Yamasaki D, Osada S, Tanaka T, Rakug H, Hamakubo T, Sakai J, Kodama T, Doi T
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Journal Title
The Journal of Biochemistry
Volume: 154 (3)
Pages: 265-73
DOI
Peer Reviewed
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