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2010 Fiscal Year Annual Research Report

がんのゲノム・エピゲノム解析に基づく個性診断法の開発

Research Project

Project/Area Number 22240090
Research InstitutionTokyo Medical and Dental University

Principal Investigator

稲澤 譲治  東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 教授 (30193551)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 井本 逸勢  徳島大学, 大学院・ヘルスバイオサイエンス研究部, 教授 (30258610)
小崎 健一  東京医科歯科大学, 硬組織疾患ゲノムセンター, 特任准教授 (50270715)
井上 純  東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 助教 (50568326)
Keywords難治がん / 癌遺伝子 / 癌抑制遺伝子 / ゲノム / エピゲノム / マイクロRNA / DNAメチル化
Research Abstract

ゲノム情報を基盤に疾患の新しい診断、治療、予防法の開発、ならびに基礎研究で得られた成果を臨床医学に展開する「トランスレーションリサーチ」に多大な期待が寄せられている。ゲノム構造変化、エピゲノム遺伝子制御機構、体系的遺伝子発現解析など統合的ゲノム解析研究を推進し、がんの様々な特性(悪性形質)に関与する遺伝子探索と病態解明に取り組み、さらにこれら難治がんにおける画期的な診断、治療、予防法の開発を目指した。食道扁平上皮がんにおいてESCC細胞株から検出した13q21.2ホモ欠失領域の標的がん抑制遺伝子候補PCDH17を同定した。PCDH17はプロモーター領域のDNAメチル化により機能サイレンシングされることを見出した。PCDH17の臨床検体における発現低下が潜在的リンパ節転移に関連している。さらに、ESCC細胞株で見出された1q32-q41増幅の新規標的遺伝子としてSMYD2を同定した。SMYD2はH3K36やp53K370をメチル化し転写活性調節やp53の不活性化作用を持つことが報告されており、治療標的分子としても注目されている。またp53が正常の例で予後の像悪に関与することを明らかにした。加えて、ESCCで見られる11q22増幅の標的遺伝子YAP1に4種類のアイソフォームがあることを明らかにした。また、種々のがん種において機能解析に基づくがん関連マイクロRNAのスクリーニングを進めている。今回の研究で見出されたがん関連遺伝子は、難治がんのバイオマーカーや治療の標的分子として期待できる。

Research Products

(54 results)

All 2011 2010 Other

All Journal Article Presentation Book Remarks Patent(Industrial Property Rights)

  • [Journal Article] Diagnosis and prognostication of ductal adenocarcinomas of the pancreas based on genome-wide DNA methylation profiling by bacterial artificial chromosome array-based methylated CpG island amplification.2011

    • Author(s)
      Gotoh M, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      Biomed Biotechnol.

      Volume: (Epub ahead of print)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Copy number alterations in urothelial carcinomas : Their clinicopathological significance and correlation with DNA methylation alterations.2010

    • Author(s)
      Nishiyama N, Inazawa J , et al
    • Journal Title

      Carcinogenesis.

      Volume: (Epub aheadof print)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] YAP is a candidate oncogene for esophageal squamous-cell carcinoma.2010

    • Author(s)
      Muramatsu T, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      Carcinogenesis.

      Volume: (Epub aheadof print)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Clinical application of array-based comparative genomic hybridization by two-stage screening for 536 patients with mental retardation and multiple congenital anomalies.2010

    • Author(s)
      Hayashi S, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      J Hum Genet.

      Volume: (Epub ahead of print)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Transplantation of neuronal cells induced from human mesenchymal stem cells improves neurological functions after stroke without cell fusion.2010

    • Author(s)
      Xu H, Inazawa J, et a]
    • Journal Title

      J Neurosci Res.

      Volume: 88 Pages: 3598-3609

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Variation in TP63 is associated with lung adenocarcinoma susceptibility in Japanese and Korean populations.2010

    • Author(s)
      Miki D, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      Nat Genet.

      Volume: 42 Pages: 893-896

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genome-wide association study identifies five new susceptibility loci for prostate cancer in the Japanese population.2010

    • Author(s)
      Takata R, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      Nat Genet.

      Volume: 42 Pages: 751-754

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Dermokine as a novel biomarker for early-stage colorectal cancer.2010

    • Author(s)
      Tagi T, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      J Gastroenterol.

      Volume: 45 Pages: 1201-1211

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Copy-number variations on the X chromosome in Japanese patients with mental retardation detected by array-based comparative genomic hybridization analysis.2010

    • Author(s)
      Honda S, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      J Hum Genet.

      Volume: 55 Pages: 590-599

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Neuroradiologic Features of CASK Mutations.2010

    • Author(s)
      Takanashi J, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      AJNR Am J Neuroradiol.

      Volume: 31 Pages: 1619-1622

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] DEK oncoprotein regulates transcriptional modifiers and sustains tumor initiation activity in high-grade neuroendocrine carcinoma of the lung.2010

    • Author(s)
      Shibata T, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      Oncogene.

      Volume: 29 Pages: 4671-4681

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Novel deletion at Xq24 including the UBE2A gene in a patient with X-linked mental retardation.2010

    • Author(s)
      Honda S, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      J Hum Genet.

      Volume: 55 Pages: 244-247

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Overexpression of NF-kappaB inducing kinase underlies constitutive NF-kappaB activation in lung cancer cells.2010

    • Author(s)
      Saitoh Y, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      Lung Cancer.

      Volume: 70 Pages: 263-270

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] requent silencing of protocadherin 17, a candidate tumour suppressor for esophageal squamous-cell carcinoma.2010

    • Author(s)
      Haruki S, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      Carcinogenesis.

      Volume: 31 Pages: 1027-1036

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] DNA amplification and expression of FADD in oral squamous cell carcinoma.2010

    • Author(s)
      Prapinjumrune C, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      J Oral Pathol Med.

      Volume: 39 Pages: 525-532

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] miR-124 and miR-203 are epigenetically silenced tumor-suppressivemicroRNAs in hepatocellular carcinoma2010

    • Author(s)
      古田繭子、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      101th annual meeting of American Association for Cancer Research 2010
    • Place of Presentation
      Washington, DC, USA
    • Year and Date
      20100417-20100421
  • [Presentation] Lysosomal-associated protein multispanning transmembrane 5 gene(LAPTM5) is associated with spontaneous regression of neuroblastomas2010

    • Author(s)
      井上純、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      101th annual meeting of American Association for Cancer Research 2010
    • Place of Presentation
      Washington, DC, USA
    • Year and Date
      20100417-20100421
  • [Presentation] ITCH is a putative target for a novel 20q11.22 amplification detected in anaplastic thyroid carcinoma cells by array-based comparative genomic hybridization2010

    • Author(s)
      石原孝也、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      101th annual meeting of American Association for Cancer Research 2010
    • Place of Presentation
      Washington, DC, USA
    • Year and Date
      20100417-20100421
  • [Presentation] Gene expression signature of the non cancerous liver tissue associated with the early recurrence of hepatocellular carcinoma2010

    • Author(s)
      田中真二、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      101th annual meeting of American Association for Cancer Research 2010
    • Place of Presentation
      Washington, DC, USA
    • Year and Date
      20100417-20100421
  • [Presentation] Functional significance of potential oncogene YAP and its isoforms in esophageal squamouse cell carcinoma(ESCC)2010

    • Author(s)
      村松智輝、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      101th annual meeting of American Association for Cancer Research 2010
    • Place of Presentation
      Washington, DC, USA
    • Year and Date
      20100417-20100421
  • [Presentation] Functional screening of tumor suppressive microRNAs sienced by DNA hypermethylation in oral squamous cell carcinoma2010

    • Author(s)
      小崎健一、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      101th annual meeting of American Association for Cancer Research 2010
    • Place of Presentation
      Washington, DC, US
    • Year and Date
      20100417-20100421
  • [Presentation] Frequent silencing of protocadherin 17, a candidate tumour suppressor for esophageal squamous-cell carcinoma2010

    • Author(s)
      井本逸勢、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      101th annual meeting of America Association for Cancer Research 2010
    • Place of Presentation
      Washington, DC, USA
    • Year and Date
      20100417-20100421
  • [Presentation] アレイCGHの臨床応用とCNVデータベースの構築.2010

    • Author(s)
      林深、稲澤譲治
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第55回大会
    • Place of Presentation
      大宮ソニックシティ(埼玉)
    • Year and Date
      2010-10-29
  • [Presentation] 食道扁平上皮癌において高頻度に発現抑制を受ける新規癌抑制遺伝子候補Protocadherin 17(PCDH17).2010

    • Author(s)
      井本逸勢、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第55回大会
    • Place of Presentation
      大宮ソニックシティ(埼玉)
    • Year and Date
      2010-10-29
  • [Presentation] BAC-based X-tiling arrayを用いたX連鎖性精神発達遅滞(XLMR)の原因遺伝子探索2010

    • Author(s)
      本田尚三、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第55回大会
    • Place of Presentation
      大宮ソニックシティ(埼玉)
    • Year and Date
      2010-10-29
  • [Presentation] Xp 11.2微細重複症候群の1例2010

    • Author(s)
      岡本伸彦、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第55回大会
    • Place of Presentation
      大宮ソニックシティ(埼玉)
    • Year and Date
      2010-10-28
  • [Presentation] 新規症候群の可能性がある10p12.1-p11.23欠失の2症例2010

    • Author(s)
      岡本奈那、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第55回大会
    • Place of Presentation
      大宮ソニックシティ(埼玉)
    • Year and Date
      2010-10-28
  • [Presentation] UBE2Aを含むXq24のゲノム欠失により特徴的な臨床症状を示した男児例2010

    • Author(s)
      小林淳也、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第55回大会
    • Place of Presentation
      大宮ソニックシティ(埼玉)
    • Year and Date
      2010-10-28
  • [Presentation] 複数のゲノムアレイによる先天異常疾患におけるゲノム評価2010

    • Author(s)
      林深、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第55回大会
    • Place of Presentation
      大宮ソニックシティ(埼玉)
    • Year and Date
      2010-10-28
  • [Presentation] 肝細胞癌の肉眼形態が示す特異的遺伝子発現パターンと分子標的EpCAMの意義2010

    • Author(s)
      田中真二、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      第69回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      大阪国際会議場・リーガロイヤルホテル(大阪)
    • Year and Date
      2010-09-24
  • [Presentation] 癌細胞においてDNAメチル化異常により発現抑制されるEMT関連分子の探索2010

    • Author(s)
      倉沢泰浩、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      第69回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      大阪国際会議場・リーガロイヤルホテル(大阪)
    • Year and Date
      2010-09-24
  • [Presentation] 子宮体癌細胞株の機能的スクリーニングを用いたエピゲノム異常により発現抑制される癌抑制遺伝子型microRNAの同定2010

    • Author(s)
      鶴田智彦、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      第69回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      大阪国際会議場・リーガロイヤルホテル(大阪)
    • Year and Date
      2010-09-24
  • [Presentation] 口腔癌細胞株の機能的スクリーニングを用いたDNAメチル化異常により発現抑制される癌抑制遺伝子型microRNAの探索2010

    • Author(s)
      上杉篤史、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      第69回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      大阪国際会議場・リーガロイヤルホテル(大阪)
    • Year and Date
      2010-09-24
  • [Presentation] Functionalスクリーニングを用いた肝細胞癌抑制性microRNAの同定2010

    • Author(s)
      古田繭子、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      第69回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      大阪国際会議場・リーガロイヤルホテル(大阪)
    • Year and Date
      2010-09-24
  • [Presentation] 腫瘍特異的DNA過剰メチル化によって発現抑制される口腔扁平上皮癌関連癌抑制遺伝子型microRNAの探索2010

    • Author(s)
      遠藤寛則、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      第69回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      大阪国際会議場・リーガロイヤルホテル(大阪)
    • Year and Date
      2010-09-24
  • [Presentation] 癌細胞におけるオートファジー経路の障害.第69回日本癌学会学術総会2010

    • Author(s)
      井上純、稲澤譲治
    • Organizer
      第69回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      大阪国際会議場・リーガロイヤルホテル(大阪)
    • Year and Date
      2010-09-23
  • [Presentation] 発現アレイを用いた大腸癌におけるEMT関連遺伝子の探索2010

    • Author(s)
      小野宏晃、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      第69回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      大阪国際会議場・リーガロイヤルホテル(大阪)
    • Year and Date
      2010-09-23
  • [Presentation] 肝細胞癌におけるCpGアイランドの過剰メチル化により発現制御される新規がん抑制遺伝子の同定2010

    • Author(s)
      松村聡、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      第69回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      大阪国際会議場・リーガロイヤルホテル(大阪)
    • Year and Date
      2010-09-23
  • [Presentation] 食道扁平上皮癌で高頻度に発現消失する新規癌抑制遺伝子候補protocadherin172010

    • Author(s)
      井本逸勢、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      第69回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      大阪国際会議場・リーガロイヤルホテル(大阪)
    • Year and Date
      2010-09-23
  • [Presentation] 食道扁平上皮がんにおけるYes associated protein(YAP)のがん遺伝子としての可能性2010

    • Author(s)
      村松智輝、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      第69回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      大阪国際会議場・リーガロイヤルホテル(大阪)
    • Year and Date
      2010-09-23
  • [Presentation] 食道癌(ESCC)細胞株におけるhomo欠失領域から同定された癌抑制遺伝子候補の検討2010

    • Author(s)
      小西博貴、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      第69回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      大阪国際会議場・リーガロイヤルホテル(大阪)
    • Year and Date
      2010-09-23
  • [Presentation] 食道扁平上皮癌において高頻度に発現抑制される癌関連抑制遺伝子PCDH-X, Yの同定2010

    • Author(s)
      宮脇豊、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      第69回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      大阪国際会議場・リーガロイヤルホテル(大阪)
    • Year and Date
      2010-09-23
  • [Presentation] LAPTM5はHECT型ユビキチンリガーゼITCHの基質である2010

    • Author(s)
      石原孝也、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      第69回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      大阪国際会議場・リーガロイヤルホテル(大阪)
    • Year and Date
      2010-09-23
  • [Presentation] 卵巣癌細胞におけるNF-kB inducing kinaseによる恒常的NF-kB活性化調節2010

    • Author(s)
      宇野雅哉、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      第69回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      大阪国際会議場・リーガロイヤルホテル(大阪)
    • Year and Date
      2010-09-23
  • [Presentation] がん細胞においてDNA過剰メチル化により発現抑制される癌抑制遺伝子型microRNA2010

    • Author(s)
      小崎健一、稲澤譲治
    • Organizer
      第69回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      大阪国際会議場・リーガロイヤルホテル(大阪)
    • Year and Date
      2010-09-22
  • [Presentation] ヒト癌におけるLC3A variant-1の発現低下の意義2010

    • Author(s)
      白樺、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      第69回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      大阪国際会議場・リーガロイヤルホテル(大阪)
    • Year and Date
      2010-09-22
  • [Presentation] DNAメチル化プロファイルに基づいた膵がんの存在診断・病態診断指標の確率2010

    • Author(s)
      後藤政広、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      第69回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      大阪国際会議場・リーガロイヤルホテル(大阪)
    • Year and Date
      2010-09-22
  • [Presentation] 神経芽腫自然退縮におけるImpaired autophagyを伴うLAPTM5依存性細胞死2010

    • Author(s)
      稲澤譲治
    • Organizer
      第19回日本Cell Death学会学術集会
    • Place of Presentation
      愛知県産業労働センター(愛知)
    • Year and Date
      2010-07-31
  • [Book] 日本医師会雑誌 第139第3号 染色体異常-検査の進歩、結果の解釈2010

    • Author(s)
      稲澤譲治
    • Total Pages
      5
    • Publisher
      日本医師会
  • [Book] 大腸癌FRONTIER.遺伝子・ゲノム変異と大腸癌発癌~全ゲノムを研究対象としてみえてきたこと2010

    • Author(s)
      小野宏晃、稲澤譲治, 他
    • Total Pages
      6
    • Publisher
      メディカルレビュー社
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.tmd.ac.jp/mri/cgen/framepage.htm

  • [Patent(Industrial Property Rights)] 核酸マイクロアレイの異常スポットを検出する方法2010

    • Inventor(s)
      金原秀行・吉田淳哉・氏原大・稲澤譲治・井本逸勢
    • Industrial Property Rights Holder
      東京医科歯科大学・富士写真フィルム株式会社
    • Industrial Property Number
      12/787,953 特願2009-128162
    • Filing Date
      2010-05-26
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 核酸マイクロアレイの異常スポヅトを検出する方法2010

    • Inventor(s)
      金原秀行・吉田淳哉・氏原大・稲澤譲治・井本逸勢
    • Industrial Property Rights Holder
      東京医科歯科大学・富士写真フィルム株式会社
    • Industrial Property Number
      10164051.4 特願2009-128162
    • Filing Date
      2010-05-27
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 核酸マイクロアレイの異常スポットを検出する方法2010

    • Inventor(s)
      金原秀行・吉田淳哉・氏原大・稲澤譲治・井本逸勢
    • Industrial Property Rights Holder
      東京医科歯科大学・富士写真フィルム株式会社
    • Industrial Property Number
      201010193364.8 特願2009・128162
    • Filing Date
      2010-05-27

URL: 

Published: 2012-07-19  

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