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2010 Fiscal Year Annual Research Report

コヒーレントX線回折を用いたクライオバイオイメージング

Research Project

Project/Area Number 22310075
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

西野 吉則  北海道大学, 電子科学研究所, 教授 (40392063)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 前島 一博  国立遺伝学研究所, 構造遺伝学研究センター, 教授 (00392118)
KeywordsコヒーレントX線 / 染色体 / X線回折顕微法 / ナノ構造解析 / 位相コントラストイメージング / オルガネラ / 高次構造 / 位相回復
Research Abstract

コヒーレントX線を利用したX線回折顕微法(XDM)は、透過電子顕微鏡など従来の顕微法では難しかった、マイクロメートル以上の厚みをもつ生体試料の内部を、高コントラスト、高分解能で観察でき、世界的に注目されている。本研究では、XDMによるクライオバイオイメージングに向けた研究開発を行う。これにより、ヒト染色体、細胞核、精子などにおけるヒトゲノムDNAの折り畳み構造の理解に貢献することを目的とする。
本年度は、ヒト精子を研究材料に用いて、XDM測定をおこなった。精子は、細胞核からなる頭部、運動のためのATPを合成するミトコンドリアを含む中片部、べん毛の尾部から構成される。頭部の精子核にはヒトゲノムDNAが非常にコンパクトに収納されている。その構造を調べることは、生物学的にも医学的にも非常に有意義である。ヒト精子を単離し、SiN薄膜に固定し、大型放射光施設SPring-8 BL29XULでコヒーレントX線を照射した。測定は、まず、電子密度が最も高い頭部の精子核に対して行った。7つの試料に対して、いずれも精度の高いコヒーレントX線回折パターンを測定することに成功した。試料像再構成にも成功し、現在、得られた補情報をもとに構造解析をおこなっている。また、1つの試料に対しては、長く伸びる尾部のイメージング行うために、異なる5つの照射領域でのコヒーレントX線回折パターンを取得した。照射領域がオーバーラップしているため、試料像の再構成にタイコグラフィーが適用可能である。

Research Products

(42 results)

All 2011 2010 Other

All Journal Article Presentation Remarks

  • [Journal Article] Coherent diffraction microscopy at SPring-8 : instrumentation, data acquisition and data analysis2011

    • Author(s)
      R.Xu
    • Journal Title

      Journal of Synchrotron Radiation

      Volume: 18 Pages: 293-298

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Role of Ti 3d Carriers in Mediating the Ferromagnetism of Co : TiO_2 Anatase Thin Films2011

    • Author(s)
      T.Ohtsuki
    • Journal Title

      Physical Review Letters

      Volume: 106 Pages: 047602

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Nuclear Size, Nuclear Pore Number, and Cell Cycle2011

    • Author(s)
      K.Maeshima
    • Journal Title

      Nucleus

      Volume: (In press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Irregular folding of nucleosomes in the cell (Comment).2011

    • Author(s)
      H.Takata
    • Journal Title

      Phys.Life Rev.

      Volume: 8 Pages: 51-52

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] New insight into the mitotic chromosome structure : irregular folding of nucleosome fibres?2011

    • Author(s)
      K.Maeshima
    • Journal Title

      Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology

      Volume: (In press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] High-resolution projection image reconstruction of thick objects by hard x-ray diffraction microscopy2010

    • Author(s)
      Y.Takahashi
    • Journal Title

      Physical Review B

      Volume: 82 Pages: 214102

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Wavefield characterization of nearly diffraction-limited focused hard x-ray beam with size less than 10nm2010

    • Author(s)
      T.Kimura
    • Journal Title

      Review of Scientific Instruments

      Volume: 81 Pages: 123704

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] One-dimensional Wolter optics with a sub-50nm spatial resolution2010

    • Author(s)
      S.Matsuyama
    • Journal Title

      Optics Letters

      Volume: 35 Pages: 3583-3585

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Femtosecond Snapshot Holography with Extended Reference Using Extreme Ultraviolet Free-Electron Laser2010

    • Author(s)
      Y.Nishino
    • Journal Title

      Applied Physics Express

      Volume: 3 Pages: 102701

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Development of a one-dimensional Wolter mirror for an advanced Kirkpatrick-Baez mirror2010

    • Author(s)
      S.Matsuyama
    • Journal Title

      Proceedings of SPIE

      Volume: 7802 Pages: 1780202

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Elemental mapping of frozen-hydrated cells with cryo-scanning X-ray fluorescence microscopy2010

    • Author(s)
      S.Matsuyama
    • Journal Title

      X-Ray Spectrometry

      Volume: 7 Pages: 260-266

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Development of Hard X-ray Imaging Optics with Two Pairs of Elliptical and Hyperbolic Mirrors2010

    • Author(s)
      S.Matsuyama
    • Journal Title

      AIP Conference Proceedings

      Volume: 1234 Pages: 267-270

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Strong Valence Fluctuation in the Quantum Critical Heavy Fermion Superconductor β-YbA1B_4 : A Hard X-Ray Photoemission Study2010

    • Author(s)
      M.Okawa
    • Journal Title

      Physical Review Letters

      Volume: 104 Pages: 247201

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Evidence for a Correlated Insulator to Antiferromagnetic Metal Transition in CrN2010

    • Author(s)
      P.A.Bhobe
    • Journal Title

      Physical Review Letters

      Volume: 104 Pages: 236404

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Three-Dimensional Electron Density Mapping of Shape-Controlled Nanoparticle by Focused Hard X-ray Diffraction Microscopy2010

    • Author(s)
      Y.Takahashi
    • Journal Title

      Nano Letters

      Volume: 10 Pages: 1922-1926

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Two-dimensional measurement of focused hard X-ray beam profile using coherent X-ray diffraction of isolated nanoparticle2010

    • Author(s)
      Y.Takahashi
    • Journal Title

      Nuclear Instruments and Methods in Physics Research Section A : Accelerators, Spectrometers, Detectors and Associated Equipment

      Volume: 616 Pages: 266-269

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Extended knife-edge method for characterizing sub-10-nm X-ray beams2010

    • Author(s)
      S.Handa
    • Journal Title

      Nuclear Instruments and Methods in Physics Research Section A : Accelerators, Spectrometers, Detectors and Associated Equipment

      Volume: 616 Pages: 246-250

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] FELを用いた材料科学現象の超高速イメージングに向けて2010

    • Author(s)
      西野吉則
    • Journal Title

      放射光

      Volume: 23 Pages: 322-324

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Nuclear pore formation but not nuclear growth is governed by cyclin-dependent kinases (Cdks) during interphase.2010

    • Author(s)
      K.Maeshima
    • Journal Title

      Nat.Struct.Mol.Biol.

      Volume: 17 Pages: 1065-1071

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Chromatin structure : does the 30-nm fibre exist in vivo2010

    • Author(s)
      K.Maeshima
    • Journal Title

      Curr.Opin.Cell Biol.

      Volume: 22 Pages: 291-297

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The structure of mitotic chromosomes : irregular folding of nucleosome fibers2010

    • Author(s)
      K.Maeshima
    • Journal Title

      Advances in Chromosome Science

      Volume: 3 Pages: 72-75

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Live imaging system for visualizing nuclear pore complex (NPC) formation during interphase in mammalian cells.2010

    • Author(s)
      H.Iino
    • Journal Title

      Genes Cells

      Volume: 15 Pages: 647-666

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] コヒーレントX線が拓く構造可視化の新手法2011

    • Author(s)
      西野吉則
    • Organizer
      第3回超高速時間分解光計測研究会
    • Place of Presentation
      ホテルクラウンパレス浜松(静岡県浜松市)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-03-08
  • [Presentation] Coherent Imaging using Synchrotron Radiation and FEL2011

    • Author(s)
      Y.Nishino
    • Organizer
      Biology with FELs : Toward the Molecular Movie
    • Place of Presentation
      Lawrence Berkeley National Laboratory, California, USA(招待講演)
    • Year and Date
      2011-01-18
  • [Presentation] XFELを用いた生体分子の溶液散乱2011

    • Author(s)
      西野吉則
    • Organizer
      「XFELを用いた生体分子の溶液散乱」ミニワークショップ
    • Place of Presentation
      SPring-8(兵庫県佐用郡佐用町)
    • Year and Date
      2011-01-11
  • [Presentation] コヒーレントイメージングの現状と展望2011

    • Author(s)
      西野吉則
    • Organizer
      第24回日本放射光学会年会放射光科学合同シンポジウム
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場(茨城県つくば市)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-01-09
  • [Presentation] コヒーレントX線が拓く構造可視化の新手法2011

    • Author(s)
      西野吉則
    • Organizer
      北海道大学電子科学研究所平成22年度研究交流会
    • Place of Presentation
      北海道大学電子科学研究所(北海道札幌市)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-01-07
  • [Presentation] Coherent Imaging using Synchrotron Radiation and FEL2010

    • Author(s)
      Y.Nishino
    • Organizer
      The 9th International Symposium on Ultrafast Intense Laser Science
    • Place of Presentation
      Hyatt Regency Maui Resort & Spa, Hawaii, USA(招待講演)
    • Year and Date
      2010-12-11
  • [Presentation] コヒーレントX線が拓く構造可視化の新手法2010

    • Author(s)
      西野吉則
    • Organizer
      東京大学物性研究所セミナー
    • Place of Presentation
      東京大学物性研究所(千葉県柏市)(招待講演)
    • Year and Date
      2010-12-02
  • [Presentation] How is a long strand of DNA compacted into a chromosome2010

    • Author(s)
      K.Maeshima
    • Organizer
      IUBS International workshop Structural and functional diversity of the eukaryotic genome
    • Place of Presentation
      Augustinian Abbey, Brno, Czech Republic(招待講演)
    • Year and Date
      2010-11-14
  • [Presentation] 放射光や自由電子レーザーを用いたコヒーレントイメージング2010

    • Author(s)
      西野吉則
    • Organizer
      原子分解能ホログラフィー研究会ワークショップ原子分解能ホログラフィーによる中距離局所構造のサイエンス
    • Place of Presentation
      東北大学金属材料研究所(宮城県仙台市)
    • Year and Date
      2010-11-13
  • [Presentation] コヒーレントX線が拓く新たなナノイメージング2010

    • Author(s)
      西野吉則
    • Organizer
      東北大学サイクロトロン・ラジオアイソトープセンターセミナー
    • Place of Presentation
      東北大学サイクロトロン・ラジオアイソトープセンター(宮城県仙台市)(招待講演)
    • Year and Date
      2010-11-11
  • [Presentation] Coherent Imaging with X-rays & EUV-FEL2010

    • Author(s)
      Y.Nishino
    • Organizer
      The 3rd Wbrkshop on FEL Science:"Emerging X-ray Applications in Biological Systems-II"
    • Place of Presentation
      湯元第二名水亭(北海道伊達市)(招待講演)
    • Year and Date
      2010-10-04
  • [Presentation] Phase-Contrast Coherent Imaging2010

    • Author(s)
      Y.Nishino
    • Organizer
      The 17th International Microscopy Congress (IMC17)
    • Place of Presentation
      Windsor Barra Convention Center, Rio de Janeiro, Brazil(招待講演)
    • Year and Date
      2010-09-21
  • [Presentation] 細胞の中の構造を観る2010

    • Author(s)
      西野吉則
    • Organizer
      KEK物構研サマーチャレンジ
    • Place of Presentation
      高エネルギー加速器研究機構(茨城県つくば市)(招待講演)
    • Year and Date
      2010-08-25
  • [Presentation] Development of Coherent Imaging Methods Using Synchrotron Radiation and FEL2010

    • Author(s)
      Y.Nishno
    • Organizer
      9th Annual Meeting of Structural-Biological Whole Cell Project of Thermus thermophilus HB8
    • Place of Presentation
      SPring-8(兵庫県佐用郡佐用町)(招待講演)
    • Year and Date
      2010-08-21
  • [Presentation] コヒーレントイメージングの現状と展望2010

    • Author(s)
      西野吉則
    • Organizer
      日本放射光学会第二回若手研究会「顕微分光のフロンティア」
    • Place of Presentation
      東京大学本郷キャンパス(東京都文京区)(招待講演)
    • Year and Date
      2010-08-03
  • [Presentation] Nanostructure Analysis utilizing Coherent X-rays2010

    • Author(s)
      Y,Nishino
    • Organizer
      RIES-CIS Symposium
    • Place of Presentation
      北海道大学電子科学研究所(北海道札幌市)(招待講演)
    • Year and Date
      2010-07-23
  • [Presentation] コヒーレントX線を用いたイメージング2010

    • Author(s)
      西野吉則
    • Organizer
      5研究所アライアンス「医療材料・デバイス」グループキックオフミーティング
    • Place of Presentation
      北海道大学電子科学研究所(北海道札幌市)
    • Year and Date
      2010-07-16
  • [Presentation] 放射光や自由電子レーザーを用いたコヒーレント光イメージング2010

    • Author(s)
      西野吉則
    • Organizer
      日本顕微鏡学会第66回学術講演会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場(愛知県名古屋市)(招待講演)
    • Year and Date
      2010-05-25
  • [Presentation] X-ray Diffraction Microscopy for Cellular Organelles2010

    • Author(s)
      Y.Nishino
    • Organizer
      Coherent Diffractive Imaging (CDI) for Biological Applications at NSLS-II
    • Place of Presentation
      Brookhaven National Laboratory, New York, USA(招待講演)
    • Year and Date
      2010-05-17
  • [Remarks]

    • URL

      http://cxo-www.es.hokudai.ac.jp/

URL: 

Published: 2012-07-19  

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