2012 Fiscal Year Annual Research Report
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22700141
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| Research Institution | University of Yamanashi |
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Principal Investigator |
山本 泰生 山梨大学, 医学工学総合研究部, 助教 (30550793)
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| Project Period (FY) |
2010-04-01 – 2013-03-31
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| Keywords | 仮説枚挙 / システム生物学 / 帰納推論 / グルコース抑制 / CF帰納法 / パスウェイ補完 |
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| Research Abstract |
当初計画した研究計画に基づき，以下に示す２つの研究課題に取り組んだ．
１．CF帰納法に基づく仮説枚挙システムの実現とその高度化:
ヒューリスティクスを導入した逆包摂法を提案し，昨年度に開発したCF帰納法に基づく仮説推論システムに導入した．また従来の代表的なシステムであるProgolと生成される仮説の予測精度に関する比較を行いその性能を実証的に評価した．さらにCF帰納法の手続きの中で必要となる非単調双対化処理について理論的な考察を進め，非単調双対化問題が2つの単調双対化問題に変換できることを明らかにした．本研究の成果は当該分野の国際会議の一つであるInt. Conf. on Inductive Logic Programming (2012) において発表し，前者の研究成果については，Revised and selected papersの一つとして採録された．
２．帰納推論技術による酵母菌のグルコース抑制に関する知識発見:
酵母菌のグルコース抑制に関する論理モデルについて，観測データである各変異株における遺伝子発現データを用いて，論理的に可能性のある未知のインタラクションを推定・補完する手法を構築した．またその結果について生物学の専門家からヒアリングおよび専門ﾃﾞｰﾀﾍﾞｰｽとの照合を通して検証を行った．その結果，ﾃﾞｰﾀﾍﾞｰｽ上ですでに存在が確認されていたものを含め実際に有用な複数のインタラクションを抽出することに成功した．また，モデルの定性的検証方法について再検討を行い，４値論理の枠組みを用いて遺伝子発現の変化量データを定性的に扱うモデル検査手法を提案した．またこの結果は，情報処理学会バイオ情報学第29回研究会において発表した．
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| Current Status of Research Progress |
Reason
24年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
24年度が最終年度であるため、記入しない。
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