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2012 Fiscal Year Annual Research Report

ジェミナルに基づく量子化学理論の確立とそのナノ磁性デバイス材料への応用

Research Project

Project/Area Number 22750016
Research InstitutionWaseda University

Principal Investigator

小林 正人  早稲田大学, 高等研究所, 助教 (40514469)

Project Period (FY) 2010-04-01 – 2013-03-31
Keywords化学物理 / 計算物理 / ナノ材料 / 静的電子相関 / 分割統治法 / 抗ウィルス薬 / 励起状態理論
Research Abstract

量子化学理論では、一電子波動関数(オービタル)から全電子波動関数を構築するのが一般的であるが、本研究では二電子対波動関数(ジェミナル)を基本に用いることで、新しい高精度多配置量子化学計算の理論体系とプログラムを確立することを目的としている。
本研究ではジェミナル量子化学の基本理論として反対称化強直交ジェミナル積(APSG)法を採用している。本年度は、昨年度研究を開始した開殻系のAPSG波動関数に対する摂動的動的電子相関の補正法を完成させ、論文で発表した。30以上の開殻系小分子に対して行った性能評価により、本手法は分子構造パラメータをより正確に再現することが確かめられた。これにより、定量的解析が可能な開殻系のジェミナル理論が完成した。
また、ジェミナル理論をナノ材料などに適用するため、本年度は主に大規模量子化学計算理論である分割統治(DC)法の整備と拡張を行った。具体的にはまず、高精度量子化学計算に用いられる2次Moller-Plesset摂動(MP2)法に対して、DC法を用いたエネルギー勾配表式を提案し、量子化学計算に不可欠な構造最適化計算を可能とした。また、このDC-MP2法の有効性を検証するために、HIV-1及び西ナイルウィルスに対する新奇抗ウィルス薬の阻害機構の解析に本手法を応用した。さらに、これまでは基底状態理論の枠組みの中で開発を行ってきたDC法を励起状態理論へと拡張した。例として、本手法と高精度励起状態理論のSAC-CI法を組み合わせて用い、光活性イエロータンパク中の色素の励起波長シフトを再現した。ONIOM法のような既存の大規模励起状態理論とも比較を行い、本手法がより高い精度で励起エネルギーを再現することが確認された。
以上により、ジェミナルに基づく閉殻系及び開殻系の量子化学理論の確立と、それをナノ材料に適用する基盤の構築が行われた。

Current Status of Research Progress
Reason

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

24年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (25 results)

All 2013 2012 Other

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 8 results) Presentation (17 results) (of which Invited: 4 results)

  • [Journal Article] Accelerating Convergence in the Antisymmetric Product of Strongly Orthogonal Geminals Method2013

    • Author(s)
      M. Tarumi, M. Kobayashi, and H. Nakai
    • Journal Title

      Int. J. Quantum Chem.

      Volume: 113 Pages: 239-244

    • DOI

      10.1002/qua.24045

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Divide-and-Conquer-Based Symmetry Adapted Cluster Method: Synergistic Effect of Subsystem Fragmentation and Configuration Selection2013

    • Author(s)
      T. Yoshikawa, M. Kobayashi, and H. Nakai
    • Journal Title

      Int. J. Quantum Chem.

      Volume: 113 Pages: 218-223

    • DOI

      10.1002/qua.24093

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Divide-and-Conquer Based Quantum Chemical Study for Interaction between HIV-1 Reverse Transcriptase and MK-4965 Inhibitor2013

    • Author(s)
      P. Saparpakorn, M. Kobayashi, S. Hannongbua, and H. Nakai
    • Journal Title

      Int. J. Quantum Chem.

      Volume: 113 Pages: 510-517

    • DOI

      10.1002/qua.24164

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Divide-and-Conquer Electronic-Structure Study on the Mechanism of the West Nile Virus NS3 Protease Inhibitor2013

    • Author(s)
      P. Saparpakorn, M. Kobayashi, and H. Nakai
    • Journal Title

      Bull. Chem. Soc. Jpn.

      Volume: 86 Pages: 67-74

    • DOI

      10.1246/bcsj.20120165

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] An Effective Energy Gradient Expression for Divide-and-Conquer Second-Order Moller-Plesset Perturbation Theory2013

    • Author(s)
      M. Kobayashi and H. Nakai
    • Journal Title

      J. Chem. Phys.

      Volume: 138 Pages: 044102 1-11

    • DOI

      10.1063/1.4776228

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A Novel Approach to Excited-State Calculations of Large Molecules Based on Divide-and-Conquer Method: Application to Photoactive Yellow Protein2013

    • Author(s)
      T. Yoshikawa, M. Kobayashi, A. Fujii, and H. Nakai
    • Journal Title

      J. Phys. Chem. B

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1021/jp401819d

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Generalized Moller-Plesset Multiconfiguration Perturbation Theory Applied to an Open-Shell Antisymmetric Product of Strongly Orthogonal Geminals Reference Wave Function2012

    • Author(s)
      M. Tarumi, M. Kobayashi, and H. Nakai
    • Journal Title

      J. Chem. Theory Comput.

      Volume: 8 Pages: 4330-4335

    • DOI

      10.1021/ct300789a

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] How Does It Become Possible to Treat Delocalized and/or Open-Shell Systems in Fragmentation-Based Linear-Scaling Electronic Structure Calculation? The Case of the Divide-and-Conquer Method2012

    • Author(s)
      M. Kobayashi and H. Nakai
    • Journal Title

      Phys. Chem. Chem. Phys.

      Volume: 14 Pages: 7629-7639

    • DOI

      10.1039/C2CP40153C

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 量子化学計算を用いた有機電子材料の電荷移動特性の解析

    • Author(s)
      高田雄太,小林正人,中井浩巳
    • Organizer
      日本コンピュータ化学会2012春季年会
    • Place of Presentation
      東京
  • [Presentation] DC-SAC-CI法~大規模励起状態理論の構築~

    • Author(s)
      吉川武司,小林正人,中井浩巳
    • Organizer
      日本コンピュータ化学会2012春季年会
    • Place of Presentation
      東京
  • [Presentation] 開殻APSG波動関数を参照とした多体摂動計算

    • Author(s)
      樽見望都,小林正人,中井浩巳
    • Organizer
      第15回理論化学討論会
    • Place of Presentation
      仙台
  • [Presentation] DC-SAC-CI法による光活性タンパクの励起状態計算

    • Author(s)
      吉川武司,小林正人,中井浩巳
    • Organizer
      第15回理論化学討論会
    • Place of Presentation
      仙台
  • [Presentation] 分割統治(DC)法に基づく大規模量子化学計算プログラムの開発と『京』での実装

    • Author(s)
      小林正人
    • Organizer
      第4回HPCI戦略プログラム合同研究交流会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Invited
  • [Presentation] Excited-state calculation of photoactive yellow protein using divide-and-conquer SAC-CI theory

    • Author(s)
      T. Yoshikawa, M. Kobayashi, and H. Nakai
    • Organizer
      XVIIth International Workshop on Quantum Systems in Chemistry and Physics (QSCP-XVII)
    • Place of Presentation
      Turku, Finland
  • [Presentation] APSG and its perturbative correction: Application to open-shell systems

    • Author(s)
      M. Kobayashi, M. Tarumi, and H. Nakai
    • Organizer
      Theory and Applications of Computational Chemistry 2012 (TACC2012)
    • Place of Presentation
      Pavia, Italy
  • [Presentation] GAMESSに実装された分割統治(DC)量子化学計算法のハイブリッド並列化

    • Author(s)
      小林正人,中井浩巳
    • Organizer
      第6回分子科学討論会
    • Place of Presentation
      東京
  • [Presentation] Development of divide-and-conquer quantum chemical code for biomolecules and nano materials

    • Author(s)
      M. Kobayashi, P. Saparpakorn, and H. Nakai
    • Organizer
      JSST 2012 International Conference on Simulation Technology
    • Place of Presentation
      Kobe, Japan
  • [Presentation] 大規模系の量子化学計算:化学理論と計算機の発展が開いた世界とその近未来

    • Author(s)
      小林正人
    • Organizer
      第26期CAMMフォーラム例会
    • Place of Presentation
      東京
    • Invited
  • [Presentation] 分割統治MP2プログラムの最近の展開と性能評価

    • Author(s)
      小林正人,中井浩巳
    • Organizer
      第3回CMSI研究会
    • Place of Presentation
      岡崎
  • [Presentation] 分割統治MP2法: エネルギー勾配法の開発と抗ウィルス薬への適用

    • Author(s)
      小林正人,P. Saparpakorn,中井浩巳
    • Organizer
      スーパーコンピューターワークショップ2013「理論と計算科学による新たな展開と可能性を探る」
    • Place of Presentation
      岡崎
  • [Presentation] Divide-and-conquer quantum chemistry program in GAMESS: Implementation and application

    • Author(s)
      M. Kobayashi
    • Organizer
      International Workshop on Massively Parallel Programming Now in Molecular Science
    • Place of Presentation
      Tokyo, Japan
    • Invited
  • [Presentation] Divide-and-Conquer Program in GAMESS: 開発と最近の成果

    • Author(s)
      小林正人,赤間知子,當眞嗣貴,吉川武司,P. Saparpakorn,中井浩巳
    • Organizer
      グランドチャレンジ・アプリケーションの研究開発 公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京
  • [Presentation] Quantum chemical calculations of large delocalized molecules with the divide-and-conquer method

    • Author(s)
      M. Kobayashi
    • Organizer
      日本化学会第93春季年会 アジア国際シンポジウム
    • Place of Presentation
      草津
    • Invited
  • [Presentation] Binding investigation of the West Nile Virus NS3 Protease Inhibitor using Divide-and-Conquer method

    • Author(s)
      P. Saparpakorn, M. Kobayashi, and H. Nakai
    • Organizer
      17th International Annual Symposium on Computational Science and Engineering (ANSCSE17)
    • Place of Presentation
      Khon Kaen, Thailand
  • [Presentation] Excited-state calculations based on divide-and-conquer method for large systems

    • Author(s)
      T. Yoshikawa, M. Kobayashi, Y. Nonaka, and H. Nakai
    • Organizer
      17th International Annual Symposium on Computational Science and Engineering (ANSCSE17)
    • Place of Presentation
      Khon Kaen, Thailand

URL: 

Published: 2014-07-24  

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