• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2010 Fiscal Year Annual Research Report

二重遺伝暗号と分割遺伝暗号を用いた人工翻訳システムの創成

Research Project

Project/Area Number 22750145
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

後藤 佑樹  東京大学, 大学院・理学系研究科, 助教 (70570604)

Keywords遺伝暗号のリプログラミング / 翻訳合成 / ペプチド / ペプチドライブラリー / リボザイム / 非天然アミノ酸
Research Abstract

本研究は新機軸の人工遺伝暗号を用いた翻訳合成系の創成を目的とする。具体的に本年度は、天然では単一の遺伝暗号が翻訳反応において機能するのに対し、人工的に作成した開始反応専用・伸長反応専用の独立した二つの遺伝暗号表を利用する、遺伝暗号のリプログラミングにおける新規概念を実証した。これにより、開始反応に利用できる改変開始残基のバリエーションを増やすことが可能になった。この概念を「二重遺伝暗号」と名付け、実際にこの二重遺伝暗号を用いる新規人工翻訳合成系の開発にも成功した。
この二重遺伝暗号は、1.AUGコドン以外にも複数のコドンが直交的に開始コドンとして機能できる(人工開始コドンが利用可能)、2.それらコドンが開始と伸長で別々のアミノ酸残基を指定可能(dual sense codonが成立する)、という特筆すべき事象を実験的に証明することで実証された。これらの科学的知見はこれまでに報告されておらず、生命活動を支える遺伝暗号を根底から書き換えるという視点、及び翻訳の生化学的観点から学術的に非常に意義深い。本翻訳系は一度に複数の翻訳開始剤を利用する事で、多様性なN末端骨格を持つペプチドを一気に合成する事が可能である。この特性のため、本研究で開発した新規人工翻訳合成系をペプチドライブラリー合成に応用すれば、従来よりも幅広いシークエンススペースをカバーした化合物ライブラリーを容易に構築することができ、新規生理活性ペプチドを探索する上で大きなメリットが期待できる。

  • Research Products

    (19 results)

All 2011 2010

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (9 results) Patent(Industrial Property Rights) (2 results)

  • [Journal Article] Mechanistic studies of Ser/Thr dehydration catalyzed by a member of the LanL lanthionine synthetase family2011

    • Author(s)
      Goto, Y.; Okesli, A.; van der Donk, W. A.
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 50 Pages: 891-898

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] New strategies for genetic code reprogramming ; dual genetic code and artificial division of codon boxes2011

    • Author(s)
      Yuki Goto, et al.
    • Journal Title

      Peptide Science

      Volume: 47(in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Ribosomal synthesis of cyclic peptides containing various γ-amino acids2011

    • Author(s)
      Yukinori Ohshiro, et al.
    • Journal Title

      Peptide Science

      Volume: 47(in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Discovery of isoform-specific cyclophilin binders powered by the RaPID system2011

    • Author(s)
      Risa Itoh, et al.
    • Journal Title

      Peptide Science

      Volume: 47(in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A platform technology for the discovery of novel peptide drug leads, RaPID system2011

    • Author(s)
      Dai Shimomai, et al.
    • Journal Title

      化学工業

      Volume: 62 Pages: 109-115

  • [Journal Article] A new drug discovery strategy powered by RaPID system2010

    • Author(s)
      Goto, Y.; Ito, R.; Suga, H.
    • Journal Title

      MEDCHEM NEWS

      Volume: 20 Pages: 26-31

  • [Journal Article] Discovery of unique lanthionine synthetases reveals mechanistic and evolutionary insights2010

    • Author(s)
      Yuki Goto, et al.
    • Journal Title

      PLoS Biol.

      Volume: 8 Pages: e1000339

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Ribosome evolution for two artificial amino acids in E.coli2010

    • Author(s)
      Gosuke Hayashi, et al.
    • Journal Title

      Chem.Biol.

      Volume: 17 Pages: 320-321

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 二重遺伝暗号を用いて翻訳合成系をリプログラミングする2011

    • Author(s)
      後藤佑樹, et al.
    • Organizer
      第13回生命化学研究会シンポジウム
    • Place of Presentation
      東北大学多元研(仙台)
    • Year and Date
      2011-01-07
  • [Presentation] Discovery and characterization of unique lanthionine synthetases reveals mechanistic and evolutionary insights2010

    • Author(s)
      Yuki Goto, Bo Li, Yanxiang Shi, Ayse Okesli, Wilfred A. vanderDonk
    • Organizer
      Pacifichem 2010
    • Place of Presentation
      Waikiki, USA
    • Year and Date
      2010-12-17
  • [Presentation] Discovery of isoform-specific cyclophilin binders powered by the RaPID system2010

    • Author(s)
      Risa Itoh, et al.
    • Organizer
      5th International Peptide Symposium
    • Place of Presentation
      KICC, Kyoto
    • Year and Date
      2010-12-08
  • [Presentation] Ribosomal synthesis of cyclic peptides containing various γ-amino acids2010

    • Author(s)
      Yukinori Ohshiro, et al.
    • Organizer
      5th International Peptide Symposium
    • Place of Presentation
      KICC, Kyoto
    • Year and Date
      2010-12-07
  • [Presentation] New strategies for genetic code reprogramming ; dual genetic code and artificial division of codon boxes2010

    • Author(s)
      Yuki Goto, et al.
    • Organizer
      5th International Peptide Symposium
    • Place of Presentation
      KICC, Kyoto
    • Year and Date
      2010-12-04
  • [Presentation] 二重遺伝暗号を用いた翻訳合成系のリプログラミング2010

    • Author(s)
      後藤佑樹, et al.
    • Organizer
      理研若手研究会・新規材料創製を目指した合成生物学
    • Place of Presentation
      理化学研究所(和光)
    • Year and Date
      2010-11-19
  • [Presentation] New artificial translation system ; dual genetic code and artificial division of codon boxes2010

    • Author(s)
      後藤佑樹
    • Organizer
      7th Japanese-German Frontiers of Science Symposium
    • Place of Presentation
      Potsdam, Germany
    • Year and Date
      2010-11-13
  • [Presentation] Reprogramming genetic code and its application for drug discovery2010

    • Author(s)
      後藤佑樹
    • Organizer
      International Symposium on Nano-bio Molecular Assembly
    • Place of Presentation
      Seoul, South Korea
    • Year and Date
      2010-06-15
  • [Presentation] 短鎖ペプチドイニシエーターを用いた特殊ペプチドの翻訳合成2010

    • Author(s)
      後藤佑樹, et al.
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会第5回年会
    • Place of Presentation
      慶應義塾大学日吉キャンパス(横浜)
    • Year and Date
      2010-05-18
  • [Patent(Industrial Property Rights)] アゾリン化合物及びアゾール化合物のライブラリー、並びにその製造方法2011

    • Inventor(s)
      菅裕明・後藤佑樹・伊藤悠美
    • Industrial Property Rights Holder
      国立大学法人東京大学
    • Industrial Property Number
      特願2011-52219
    • Filing Date
      2011-03-09
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 新規人工翻訳合成系2010

    • Inventor(s)
      菅裕明・村上裕・後藤佑樹
    • Industrial Property Rights Holder
      国立大学法人東京大学
    • Industrial Property Number
      特願2010-190315
    • Filing Date
      2010-08-27

URL: 

Published: 2012-07-19  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi