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2011 Fiscal Year Annual Research Report

二重遺伝暗号と分割遺伝暗号を用いた人工翻訳システムの創成

Research Project

Project/Area Number 22750145
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

後藤 佑樹  東京大学, 大学院・理学系研究科, 助教 (70570604)

Keywords遺伝暗号のリプログラミング / 翻訳合成 / ペプチド / ペプチドライブラリー / リボザイム / 非天然アミノ酸
Research Abstract

本研究は新機軸の人工遺伝暗号を用いた翻訳合成系の創成を目的とする。昨年度に達成した「二重遺伝暗号」を用いた合成系に加え、本年度には普遍遺伝暗号表において単一のアミノ酸によって占められたコドンボックスを人工的に分割することを行った。この概念を「分割遺伝暗号」と名付け、実際にこの分割遺伝暗号を用いる新規人工翻訳合成系の開発にも成功した。この分割遺伝暗号では、コドンボックスを二つに分割し、一方に元々の天然アミノ酸を指定し、他方には別の非天然アミノ酸を定義することが可能である。原理上、この翻訳システムでは、天然の20種類のアミノ酸に加えて、9種類までの非天然アミノ酸を伸長反応で同時に利用可能である。
さらに、二重遺伝暗号と分割遺伝暗号の両方を同時利用した新規人工翻訳合成系の実証も行った。これにより20種類の全天然アミノ酸+9種類以上の改変開始残基+9種類の非天然アミノ酸を同時に一つの翻訳系で利用することが原理的に可能となった。
本研究成果は、生命活動を支える遺伝暗号を根底から書き換えるという視点、及び翻訳の生化学的観点から学術的に非常に意義深い。さらに、本研究で開発した新規人工翻訳合成系をペプチドライブラリー合成に応用すれば、従来よりも幅広いシークエンススペースをカバーした化合物ライブラリーを容易に構築することができ、新規生理活性ペプチドを探索する上で大きなメリットが期待できる。

  • Research Products

    (20 results)

All 2012 2011 Other

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (8 results) Book (2 results) Remarks (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (2 results) (of which Overseas: 2 results)

  • [Journal Article] Flexizymes as a tRNA acylation tool facilitating genetic code reprogramming2012

    • Author(s)
      Y.Goto, et al.
    • Journal Title

      Methods in Molecular Biology

      Volume: 848 Pages: 465-478

    • DOI

      10.1007/978-1-61779-545-9_29

  • [Journal Article] Charging of tRNAs using ribozymes and selection of cyclic peptides containing thioethers2012

    • Author(s)
      P.C.Reid, et al.
    • Journal Title

      Methods in Molecular Biology

      Volume: 805 Pages: 335-348

    • DOI

      10.1007/978-1-61779-379-0_19

  • [Journal Article] Selective thioether macrocyclization of peptides having the N-terminal 2-chloroacetyl group and competing two or three cysteine residues in translation2012

    • Author(s)
      K.Iwasaki, et al.
    • Journal Title

      Organic & Biomolecular Chemistry

      Volume: (印刷中)

    • DOI

      10.1039/C2OB25306B

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Ribosomal Synthesis of Backbone-Macrocyclic Peptides Containing γ-Amino Acids2011

    • Author(s)
      Y.Ohshiro, et al.
    • Journal Title

      ChemBioChem

      Volume: 12 Pages: 1183-1187

    • DOI

      10.1002/cbic.201100104

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Flexizymes for genetic code reprogramming2011

    • Author(s)
      Y.Goto, et al.
    • Journal Title

      Nature Protocols

      Volume: 6 Pages: 779-790

    • DOI

      10.1038/nprot.2011.331

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Ribosomal synthesis of backbone macrocyclic peptides2011

    • Author(s)
      T.Katoh, et al.
    • Journal Title

      Chemical Communications

      Volume: 47 Pages: 9946-9958

    • DOI

      10.1039/C1CC12647D

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Natural product-like macrocyclic N-methyl-peptide inhibitors against a ubiquitin ligase uncovered from a ribosome-expressed de novo library2011

    • Author(s)
      Y.Yamagishi, et al.
    • Journal Title

      Chemistry & Biology

      Volume: 18 Pages: 1562-1570

    • DOI

      10.1016/j.chembiol.2011.09.013

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 翻訳後環化酵素:アソリン骨格含有分子の高汎用性合成ツール2012

    • Author(s)
      後藤佑樹・伊藤悠美・菅裕明
    • Organizer
      日本化学会第92春季年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2012-03-27
  • [Presentation] PatD:アソリン骨格含有分子の高汎用性合成ツール2012

    • Author(s)
      後藤佑樹, et al.
    • Organizer
      日本化学会第92春季年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2012-03-27
  • [Presentation] パテラミド合成酵素は幅広いペプチド配列にアゾリン骨格を導入する2011

    • Author(s)
      後藤佑樹・伊藤悠美・菅裕明
    • Organizer
      第14回生命化学研究会
    • Place of Presentation
      白浜
    • Year and Date
      2011-12-02
  • [Presentation] A posttranslational heterocyclase : a versatile synthetic tool for various azoline-containing compounds2011

    • Author(s)
      Yuki Goto, et al.
    • Organizer
      9^<th> Australian Peptide Conference
    • Place of Presentation
      Hamilton Is., Australia
    • Year and Date
      2011-11-19
  • [Presentation] PatD : a versatile synthetic tool for various azoline-containing compounds2011

    • Author(s)
      Yuki Goto, et al.
    • Organizer
      11^<th> Tateshina Conference on Organic Chemistry
    • Place of Presentation
      蓼科
    • Year and Date
      2011-11-12
  • [Presentation] 無細胞翻訳系と翻訳後修飾酵素を利用した特殊骨格含有ペプチドライブラリーの迅速構築2011

    • Author(s)
      後藤佑樹, et al.
    • Organizer
      BioJapan2011
    • Place of Presentation
      横浜(招待講演)
    • Year and Date
      2011-10-05
  • [Presentation] パテラミド合成酵素:アゾリン骨格含有化合物の高汎用性合成ツール2011

    • Author(s)
      後藤佑樹・伊藤悠美・菅裕明
    • Organizer
      第5回バイオ関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      つくば
    • Year and Date
      2011-09-14
  • [Presentation] ヘテロ環化修飾酵素を用いた化合物ライブラリー構築2011

    • Author(s)
      後藤佑樹
    • Organizer
      新世代の生物有機化学研究会2011
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2011-07-09
  • [Book] 最新ペプチド合成技術とその創薬研究への応用2012

    • Author(s)
      伊藤悠美, et al.
    • Total Pages
      125-130
    • Publisher
      メディカル ドウ
  • [Book] 核酸化学のニュートレンド2011

    • Author(s)
      後藤佑樹, et al.
    • Total Pages
      32-35
    • Publisher
      化学同人
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.chem.s.u-tokyo.ac.jp/users/bioorg/kenkyu/index.html

  • [Patent(Industrial Property Rights)] アゾリン化合物及びアゾール化合物のライブラリー、並びにその製造方法2012

    • Inventor(s)
      菅裕明・後藤佑樹・伊藤悠美
    • Industrial Property Rights Holder
      国立大学法人東京大学
    • Industrial Property Number
      PCT/JP2012/056181
    • Filing Date
      2012-03-09
    • Overseas
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 新規人工翻訳合成系2011

    • Inventor(s)
      菅裕明・村上裕・後藤佑樹
    • Industrial Property Rights Holder
      国立大学法人東京大学
    • Industrial Property Number
      PCT/JP2011/069261
    • Filing Date
      2011-08-27
    • Overseas

URL: 

Published: 2013-06-26  

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