• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2022 Fiscal Year Research-status Report

Phylogeography of dipterocarp species based on whole chloroplast genome sequencing

Research Project

Project/Area Number 22K06374
Research InstitutionEhime University

Principal Investigator

上谷 浩一  愛媛大学, 農学研究科, 准教授 (80638792)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2025-03-31
Keywordsフタバガキ科 / 東南アジア / 熱帯雨林 / 葉緑体ゲノム / 遺伝的多様性
Outline of Annual Research Achievements

本研究では,従来の短いDNA配列解析からは不明瞭であったフタバガキ科樹木の分布域形成の歴史を解明するために,フタバガキ科主要3種の葉緑体全ゲノムデータを解析することで,遺伝的多様性の地理的分布を明らかにする。初年度は,これまでに採取したDNAサンプルの精製および乾燥標本からのDNAの再調整をおこなった。次世代シーケンシング用サンプルの調整に十分なDNA量を満たしていないサンプルが多数あったが,当初の予定していたフタバガキ科主要3種以外の種を含む複数種のDNAサンプルの準備が完了した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

次世代シーケンシング用サンプルの調整に時間がかかったことにより進捗が遅れたが,目的を達成するのにほぼ十分なサンプルを得ることができた。不足するサンプルについては,今年度内に新たな葉サンプルを採取する予定である。

Strategy for Future Research Activity

次世代シーケンシング解析によって,フタバガキ科5種の葉緑体全塩基配列を決定する。

Causes of Carryover

本年度は予定していた次世代シーケンシング解析を受託しなかったため,経費の一部を翌年度に繰り越した。

  • Research Products

    (5 results)

All 2023 2022

All Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results) Presentation (2 results)

  • [Journal Article] Genetic structure and population history of a peat swamp forest tree species, Shorea albida (Dipterocarpaceae), in Brunei Darussalam2023

    • Author(s)
      Misato Ogasahara, Alexander R. Cobb, Rahayu Sukmaria Sukri, Faizah Metali, Koichi Kamiya
    • Journal Title

      Genes & Genetic Systems

      Volume: In Press Pages: -

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Leaf morphological traits of nine major tropical trees of Shorea species (Dipterocarpaceae)2023

    • Author(s)
      MUFARHATUN NUR、SUSILOWATI ARIDA、HILWAN IWAN、ARROFAHA NAWWALL、YULITA KUSUMADEWI SRI、DWIYANTI FIFI GUS、HIDAYAT ASEP、KAMIYA KOICHI、RACHMAT HENTI HENDALASTUTI
    • Journal Title

      Biodiversitas Journal of Biological Diversity

      Volume: 24 Pages: 1704-1712

    • DOI

      10.13057/biodiv/d240344

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Community phylogeny and spatial scale affect phylogenetic diversity metrics in a species‐rich rainforest in Borneo2022

    • Author(s)
      Okuno Seiya、Yin Tingting、Nanami Satoshi、Matsuyama Shuhei、Kamiya Koichi、Tan Sylvester、Davies Stuart J.、Mohamad Mohizah、Yamakura Takuo、Itoh Akira
    • Journal Title

      Ecology and Evolution

      Volume: 12 Pages: e9536

    • DOI

      10.1002/ece3.9536

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] MIG-seq法を用いたフタバガキ科樹木セラヤの遺伝的変異と集団構造の評価2023

    • Author(s)
      小笠原実里・Cobb AR・Sukri RS・Metali F・田中憲蔵・米田令仁・Azani MA・Lum SKY・上谷浩一
    • Organizer
      第134回日本森林学会大会
  • [Presentation] Morphological and molecular evidence of natural interspecific hybridization between Dyera polyphylla and D. costulata in Sumatra and Kalimantan2022

    • Author(s)
      Aulianisa EN, Siregar UJ, Siregar IZ, Hamzah H, Ogasahara M, Kamiya K
    • Organizer
      第32回日本熱帯生態学会大会

URL: 

Published: 2023-12-25  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi