2023 Fiscal Year Research-status Report
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22K10223
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| Research Institution | Kumamoto University |
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Principal Investigator |
中元 雅史 熊本大学, 病院, 医員 (90779175)
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| Project Period (FY) |
2022-04-01 – 2025-03-31
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| Keywords | 口腔がん / エピジェネティクス |
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| Outline of Annual Research Achievements |
口腔がん細胞株であるHSC-2、Ca9-22、SASの3種類でTGF-β1刺激下での細胞形態の変化および浸潤能について解析を行った。培養環境およびTGF-βの濃度設定の検討をおこない、細胞形態の変化を確認している。SAS細胞にて形態変化が得られやすい傾向をつかんでおり、各種EMT関連遺伝子の発現について解析をおこなっている。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
4: Progress in research has been delayed.
Reason
当初の予定では、EMTが確認された細胞株を用いてATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin Sequencing）を行い、オープンクロマチン領域を同定している予定であったが、実験設定の段階のEMT誘導で時間を要したために、遅れている。
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| Strategy for Future Research Activity |
EMT誘導と非EMT誘導OSCC細胞株でのエピゲノム状態の比較解析を行う。具体的には、ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin Sequencing)にて転写活性状態の指標の一つであるオープンクロマチン領域を解析し、EMTで特に変化の見られるクロマチン領域を同定する。同定されれば、結合モチーフ解析によりその領域のDNA配列から予想されるDNA結合性転写因子の候補を検索する。過去にEMTとの関連で知られていない転写因子が同定されれば、その転写因子についての機能解析を予定する。
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| Causes of Carryover |
想定よりも研究が遅れており、実験に必要な試薬等の購入が先送りとなったため。
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