2023 Fiscal Year Research-status Report
分子標的薬アファチニブの薬効予測を実現するシミュレーション解析と数理モデル
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22K12261
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| Research Institution | University of Toyama |
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Principal Investigator |
菅野 亜紀 富山大学, 学術研究部医学系, 特命助教 (20457039)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
高岡 裕 富山大学, 学術研究部医学系, 教授 (20332281)
大田 美香 富山大学, 学術研究部医学系, 特命助教 (20274706)
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| Project Period (FY) |
2022-04-01 – 2025-03-31
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| Keywords | 分子シミュレーション / 薬効予測 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究の目的は、肺がん細胞で新規変異体の発見が続く上皮成長因子受容体（EGFR）に対し、肺がん分子標的薬であるEGFRチロシンキナーゼ阻害剤（EGFR-TKI）の第2世代、アファチニブを対象に変異型EGFRへの薬効予測を実現する分子シミュレーション解析手法と数理モデルを確立することである。我々がこれまでに分子標的薬第1世代ゲフィチニブでの解析を参考に、アファチニブによるチロシンキナーゼ活性阻害を再現可能な解析条件を決定し、数理モデル作成に用いる特徴量を解明する。そして、薬効不明の変異型EGFRを有する非小細胞肺がん細胞へのアファチニブの薬効を予測可能にする。
令和5年度は、アファチニブの立体構造を入手し、EGFRとのドッキング解析を進めた。EGFRの正常型および変異型の立体構造は、いずれも二量体で作成済であるが、先行研究でゲフィチニブとアファチニブとで薬効が異なる変異型が報告されており、今回、未解析であったことから、当該の変異型の立体構造解析を追加した。また、我々の最近の分子シミュレーション研究においては、解析結果の解釈や判定の基準を、解析対象の分子に適した設定に微調整することで精度を高める可能性が示唆されている。そこで、本研究においても、必要に応じて複数のシミュレーションプログラムでの解析や基準項目の重み付けなどを解析系に含めることを検討する。なお、既報の分子標的薬の変異型への薬効に関して、臨床研究によっては、対象とした遺伝子変異の有無のみを検査している場合があり、必ずしも１変異の薬効を示しているとは限らない点を考慮し解析系を検証する。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
分子シミュレーション解析を進めているが、解析対象の変異型の追加等、研究計画の一部に変更が生じたことから、「やや遅れている」を選択した。
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| Strategy for Future Research Activity |
引き続き、アファチニブとEGFRの分子シミュレーションを実施し、変異型毎に薬効を算出すると共に解析系を検証する。
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| Causes of Carryover |
解析対象変異型の追加や分子シミュレーションの解釈・評価の検討など、研究計画の一部に変更があったため、使用計画も変更となり、次年度使用額が生じた。次年度に解析機器の購入等に使用する。
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[Journal Article] In silico binding affinity of the spike protein with ACE2 and the relative evolutionary distance of S gene may be potential factors rapidly obtained for the initial risk of SARS-CoV-22023
Author(s)
Sugano A, Murakami J, Kataguchi H, Ohta M, Someya Y, Kimura S, Kanno A, Maniwa Y, Tabata T, Tobe K, Takaoka Y
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Journal Title
Microbial Risk Analysis
Volume: 25
Pages: 100278
DOI
Peer Reviewed
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