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2023 Fiscal Year Research-status Report

Development of Platform for Crystal Structure Prediction of Organic Semiconductors

Research Project

Project/Area Number 22K18953
Research InstitutionKitasato University

Principal Investigator

渡辺 豪  北里大学, 未来工学部, 教授 (80547076)

Project Period (FY) 2022-06-30 – 2025-03-31
Keywords有機半導体 / 結晶構造予測 / 分子動力学シミュレーション / 機械学習
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、機械学習と分子動力学(MD)シミュレーションとを連携することで、有機材料、特に有機半導体単結晶について、分子構造のみから結晶構造を高精度に予測できる計算科学プラットフォームの構築に取り組んでいる。
2023年度では、前年度に作成した有機半導体単結晶において重要な情報であるパッキング構造を予測する機械学習の高精度化(約98%の正答率を実現)、そして複数の機械学習モデルの比較・検証を行った。最も適切な機械学習モデルにおいて、それぞれのパッキング構造に寄与する重要度の高い部分構造を明らかにするためにSHAP(SHapley Additive exPlanations)値を求めた。実際に、各パッキング構造への寄与が大きい部分構造を含んでいる有機半導体と、予測されるパッキング構造の相関関係が適切であることを確認できた。これは所望の結晶構造の有機半導体を設計する上での有意義な成果といえる。
また、結晶構造探索プログラムとMDシミュレーションを併用して、分子構造のみから有機半導体の集合体構造を予測する方法についても、n型有機半導体だけでなくp型有機半導体について適用可能であることを検証した。特にp型については、ヘリングボーン構造を取り、同一のコアで系統的に側鎖が異なる分子に対しても十分な精度での予測に成功した。その際、単純にバルクの構造についてのみMDシミュレーションを行うのではなく、薄膜構造に対しても実行することが有用であると分かった。さらには予測構造の絞り込みが可能な手法への発展も実現している。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

当初の予定通り、有機半導体単結晶のパッキング構造を予測可能な機械学習モデルを高精度化に成功した。さらには、特定のパッキング構造を実現するための分子設計指針の獲得もできている。
また、分子構造のみから有機半導体の集合体構造を予測する計算科学的手法についても複数種の分子について検証を行い、さらには精度の向上も実現している。
よって本研究は、計画通り順調に進んでいるといえる。

Strategy for Future Research Activity

これまでの研究では、有機半導体単結晶のパッキング構造を予測することができる機械学習モデルの構築を達成しているが、より詳細な結晶構造の情報である分子のコンフォーメーションやコア部分の配向度の予測に取り組む。予測精度が低い分子群については、その特徴を理解し、どのように機械学習モデルの精度向上に繋げるかを検討する。
また、引き続き、温度に依存した結晶多形が見られる有機半導体についてMDシミュレーションで再現可能なモデルの構築を目指す。

Causes of Carryover

購入予定であった計算機サーバーの一部の部材が大幅に高騰しており、十分な性能のサーバーの手配が困難で合ったために、次年度での購入を予定している。

  • Research Products

    (13 results)

All 2023 Other

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (10 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] The Missing Relationship between the Miscibility of Chiral Dopants and the Microscopic Dynamics of Solvent Liquid Crystals: A Molecular Dynamics Study2023

    • Author(s)
      Go Watanabe, Akane Yamazaki, Jun Yoshida
    • Journal Title

      Symmetry

      Volume: 15 Pages: 1092-1/10

    • DOI

      10.3390/sym15051092

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 計算化学によるソフトマテリアルの分子描像解明2023

    • Author(s)
      佐藤 俊輔, 渡辺 豪
    • Journal Title

      高分子

      Volume: 72 Pages: 448-450

  • [Presentation] Computational Prediction of Dynamics and Structure of Organic Semiconductor Crystals2023

    • Author(s)
      Go Watanabe, Ryosuke Ito, Shunsuke Sato, Takuya Seki, Jun Takeya, Toshihiro Okamoto
    • Organizer
      11th International Conference on Materials for Advanced Technologies
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Accurate Crystal Structure Prediction of Organic Semiconductors2023

    • Author(s)
      Ryosuke Ito, Shunsuke Sato, Takuya Seki, Jun Takeya, Toshihiro Okamoto, Go Watanabe
    • Organizer
      11th International Conference on Materials for Advanced Technologies
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Structure Prediction of Organic Crystals Using Molecular Dynamics Simulation2023

    • Author(s)
      Shunsuke Sato, Barun Dhara, Daigo Miyajima, Go Watanabe
    • Organizer
      11th International Conference on Materials for Advanced Technologies
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 有機結晶の構造予測に向けた分子動力学計算による構造安定性の評価2023

    • Author(s)
      佐藤 俊輔, Barun Dhara, 宮島 大吾, 渡辺 豪
    • Organizer
      第84回応用物理学会秋季学術講演会
  • [Presentation] 計算科学を基盤とした有機半導体結晶の高精度な構造予測手法の確立2023

    • Author(s)
      伊藤 良将, 佐藤 俊輔, 關 拓和, 竹谷 純一, 岡本 敏宏, 渡辺 豪
    • Organizer
      第84回応用物理学会秋季学術講演会
  • [Presentation] 分子シミュレーションを用いたp型有機半導体結晶の集合体構造予測2023

    • Author(s)
      篠崎 雄大, 佐藤 俊輔, 關 拓和 ,伊藤 良将, 竹谷 純一, 岡本 敏宏, 渡辺 豪
    • Organizer
      第84回応用物理学会秋季学術講演会
  • [Presentation] A Computational Approach for Predicting Dynamics and Structure of Organic Crystals2023

    • Author(s)
      Go Watanabe
    • Organizer
      The 6th International Conference on Molecular Simulation
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 計算科学を用いたp型有機半導体の集合体構造予測2023

    • Author(s)
      篠崎 雄大, 佐藤 俊輔, 關 拓和 ,伊藤 良将, 竹谷 純一, 岡本 敏宏, 渡辺 豪
    • Organizer
      第13回CSJ化学フェスタ
  • [Presentation] 分子動力学シミュレーションを用いた有機結晶の構造安定性評価2023

    • Author(s)
      佐藤 俊輔, Barun Dhara, 宮島 大吾, 渡辺 豪
    • Organizer
      第37回 分子シミュレーション討論会
  • [Presentation] 機能性ソフトマテリアルの構造・物性解明: 計算科学とデータ科学によるアプローチ2023

    • Author(s)
      渡辺 豪
    • Organizer
      日本化学会第104春季年会
    • Invited
  • [Remarks] researchmap

    • URL

      https://researchmap.jp/go_watanabe

URL: 

Published: 2024-12-25  

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