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2023 Fiscal Year Research-status Report

病原性細菌の加速度進化モデルを用いた未来予測

Research Project

Project/Area Number 22K19416
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

佐藤 豊孝  北海道大学, 獣医学研究院, 准教授 (30756474)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 横田 伸一  札幌医科大学, 医学部, 教授 (10325863)
Project Period (FY) 2022-06-30 – 2025-03-31
Keywords薬剤耐性 / 適応進化 / 肺炎桿菌 / 生体内適応 / 病原性
Outline of Annual Research Achievements

細菌感染症は世界共通の問題である。医療現場で問題となっている細菌の病原性や薬剤耐性因子の詳細な解析は進んでいるが、『本病原性細菌は今後どのように進化し医療上の問題を引き起こす可能性があるのか?』といった未来予測に対する科学的検証は行われておらず、本評価系も存在しない。これらの学術的問いに応えるべき、本研究では遺伝子変異スピードを加速度的に増加させた病原性細菌の生体内適応進化モデルを構築し、病原性細菌の病原性や多剤耐性化の進化様式を明らかにすることを目的とする。
今年度は生体内(血清または抗菌薬存在下)を模擬した環境系を構築した。本環境下で肺炎桿菌親株および昨年度作製したmutS変異株の20日間の連続継代培養を行なった。本培養においては、親株では20日後も血清または抗菌薬(シプロフロキサシン、アミカシン、メロペネム)に耐性を獲得するような変異株は出現しなかった。一方で、mutS変異株では血清および各抗菌薬共に7日以内に耐性を獲得した変異株が出現した。これら変異株の全ゲノム解析を実施した。親株から派生した継代株は血清および各抗菌薬共に数個から数十の遺伝子変異を蓄積していた。一方で、mutS変異株から派生した継代株では、血清および各抗菌薬共に数十から数百の遺伝子変異が蓄積していた。変異した遺伝子は各生体内模擬環境下で異なっており、肺炎桿菌の進化速度とベクトルは各生体内環境で異なることが示唆された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

今年度は当初の計画通りの遂行を完了したため。

Strategy for Future Research Activity

当初の計画通り、2023年度と同様に肺炎桿菌の遺伝子進化の評価を継続する。また、マウス感染モデルを構築する。マウス感染モデルにDNA修復遺伝子機能欠損株または遺伝子進化後の肺炎桿菌を感染させ、親株または遺伝子進化前の菌株とそれぞれ比較することにより、生体内での肺炎桿菌の病原性進化予測を行う。評価項目は各臓器(肺および血液)での生菌数、マウス生存率、血清耐性獲得率、薬剤耐性獲得率とする。

Causes of Carryover

無し。

  • Research Products

    (12 results)

All 2024 2023

All Journal Article (6 results) Presentation (6 results)

  • [Journal Article] Human pathogenic bacteria on high-touch dry surfaces can be controlled by warming to human-skin temperature under moderate humidity2023

    • Author(s)
      Konno Ayano、Okubo Torahiko、Enoeda Yoshiaki、Uno Tomoko、Sato Toyotaka、Yokota Shin-ichi、Yano Rika、Yamaguchi Hiroyuki
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 18 Pages: 0291765~0291765

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0291765

  • [Journal Article] Serotype replacement and an increase in non-encapsulated isolates among community-acquired infections of Streptococcus pneumoniae during post-vaccine era in Japan2023

    • Author(s)
      Yokota Shin-ichi、Tsukamoto Naoyuki、Sato Toyotaka、Ohkoshi Yasuo、Yamamoto Soh、Ogasawara Noriko
    • Journal Title

      IJID Regions

      Volume: 8 Pages: 105~110

    • DOI

      10.1016/j.ijregi.2023.07.002

  • [Journal Article] High prevalence of colistin heteroresistance in specific species and lineages of Enterobacter cloacae complex derived from human clinical specimens2023

    • Author(s)
      Fukuzawa Shota、Sato Toyotaka、Aoki Kotaro、Yamamoto Soh、Ogasawara Noriko、Nakajima Chie、Suzuki Yasuhiko、Horiuchi Motohiro、Takahashi Satoshi、Yokota Shin-ichi
    • Journal Title

      Annals of Clinical Microbiology and Antimicrobials

      Volume: 22 Pages: 60

    • DOI

      10.1186/s12941-023-00610-1

  • [Journal Article] Pseudo-outbreak of Mycobacterium lentiflavum at a general hospital in Japan2023

    • Author(s)
      Nagano Yutaro、Kuronuma Koji、Kitamura Yasuo、Nagano Kanami、Yabe Hayato、Kudo Sayaka、Sato Toyotaka、Nirasawa Shinya、Nakae Mami、Horiuchi Motohiro、Yokota Shin-ichi、Fujiya Yoshihiro、Saito Atsushi、Takahashi Satoshi、Chiba Hirofumi
    • Journal Title

      Infection Control & Hospital Epidemiology

      Volume: 44 Pages: 1809~1815

    • DOI

      10.1017/ice.2023.68

  • [Journal Article] Corrigendum to ‘Clonal/subclonal changes and accumulation of CTX-M-type β-lactamase genes in fluoroquinolone-resistant Escherichia coli ST131 and ST1193 strains isolated during the past 12 years, Japan’ [Journal of Global Antimicrobial Resistance 27 (2021) 150-155]2023

    • Author(s)
      Fukushima Yukari、Sato Toyotaka、Tsukamoto Naoyuki、Nakajima Chie、Suzuki Yasuhiko、Takahashi Satoshi、Yokota Shin-ichi
    • Journal Title

      Journal of Global Antimicrobial Resistance

      Volume: 32 Pages: 195~195

    • DOI

      10.1016/j.jgar.2022.12.008

  • [Journal Article] Discovery of Biologically Optimized Polymyxin Derivatives Facilitated by Peptide Scanning and In Situ Screening Chemistry2023

    • Author(s)
      Kaguchi Rintaro、Katsuyama Akira、Sato Toyotaka、Takahashi Satoshi、Horiuchi Motohiro、Yokota Shin-ichi、Ichikawa Satoshi
    • Journal Title

      Journal of the American Chemical Society

      Volume: 145 Pages: 3665~3681

    • DOI

      10.1021/jacs.2c12971

  • [Presentation] 伴侶動物由来の薬剤耐性菌について2024

    • Author(s)
      佐藤 豊孝
    • Organizer
      第35回日本臨床微生物学会総会・学術集会
  • [Presentation] DNA修復機構欠損変異株を用いた Klebsiella pneumoniaeの薬剤耐性および病原性進化予測2023

    • Author(s)
      佐藤 豊孝, 上村 幸二朗, 小笠原 徳子, 山本 聡, 齋藤 充, 黒沼 幸治, 堀内 基広, 髙橋 聡, 千葉 弘文, 横田 伸一
    • Organizer
      第52回 薬剤耐性菌研究会
  • [Presentation] 病原性細菌の加速度進化モデルを用いた未来予測2023

    • Author(s)
      佐藤 豊孝, 上村 幸二朗, 小笠原 徳子, 山本 聡, 齋藤 充史, 黒沼 幸治, 堀内 基広, 髙橋 聡, 千葉 弘文, 横田 伸一
    • Organizer
      第 88 回 日本細菌学会北海道支部学術総会
  • [Presentation] One Health Approachに基づく人と伴侶動物由来薬剤耐性菌の解析とその対策2023

    • Author(s)
      佐藤 豊孝
    • Organizer
      第10回One World One Health 研究会
  • [Presentation] 薬剤耐性菌の 国際的なトレンドを把握する2023

    • Author(s)
      佐藤 豊孝、上村幸二郎、髙橋 聡、横田 伸一
    • Organizer
      札幌医科大学附属病院 感染症医療教育・支援センター 主催 WEBセミナー
  • [Presentation] 伴侶動物由来フルオロキノロン耐性大腸菌の特徴とヒトとの伝播の可能性の評価2023

    • Author(s)
      佐藤 豊孝, 上村幸二郎, 髙橋 聡, 横田 伸一
    • Organizer
      第97回日本感染症学会総会・学術講演会 第71回日本化学療法学会学術集会 合同学会

URL: 

Published: 2024-12-25  

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