2023 Fiscal Year Annual Research Report
血栓性微小血管症の病因診断の試みー腎生検組織の空間的トランスクリプトーム解析ー
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22K20908
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| Research Institution | Hokkaido University |
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Principal Investigator |
岩崎 沙理 北海道大学, 医学研究院, 助教 (60455631)
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| Project Period (FY) |
2022-08-31 – 2024-03-31
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| Keywords | 空間的トランスクリプトーム / IgA腎症 / 血栓性微小血管症 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究では、様々な病因で発症する血栓性微小血管症（thrombotic microangiopathy: TMA）の症例について、腎生検組織を用いて、空間的transcriptome解析を行い、病因により差異が見いだされるかを検討する。GeoMX(NanoString社)のプラットフォームを用いて、腎生検組織上の内皮細胞のみからmRNAを抽出し、網羅的な whole transcriptome解析を行う予定である。
1. ヒト腎生検組織ホルマリン固定パラフィン包埋切片を用いて、 GeoMx(NanoString 社)をプラットフォームとする 空間的 transcriptome 解析、および網羅的な蛋白解析を行うための予備実験を開始した。まず、パラフィンブロック品質を確認した。特殊スライドガラスを入手した。予備実験用に、固定条件等の異なる腎生検症例（IgA腎症等）を10例ほど抽出の上、パラフィン切片を接着させ、外注先に提出した。NanoString社の技術者とミーティングの上、遺伝子抽出や蛋白解析を行う関心領域を設定した。
2．関心領域ごとに得られたtranscriptomic dataについて、遺伝子の品質の確認、IgA腎症症例と非IgA腎症症例に分けてクラスター解析を行い、活性化あるいは不活性化しているPasswayを解析し、十分な検討ができることを確認した。
3. 病理学的TMAのうち比較的急性期の内皮細胞傷害像を示す①造血幹細胞移植後TMA、②薬剤性TMA(抗VEGF阻害剤)、③膠原病関連TMA（抗リン脂質抗体症候群等）、④コントロール を2-3例ずつ抽出した。病理組織学的因子、血液検査所見、尿所見、臨床経過や治療反応性について解析し、典型例を抽出した。
4．3の症例について、GeoMxの検討を行い、現在得られたTranscriptomic dataについて解析を行っている。
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[Journal Article] CD47 blockade ameliorates autoimmune vasculitis via efferocytosis of neutrophil extracellular traps2023
Author(s)
Satoka Shiratori-Aso, Daigo Nakazawa, Takashi Kudo, Masatoshi Kanda, Yusho Ueda, Kanako Watanabe-Kusunoki, Saori Nishio, Sari Iwasaki, Takahiro Tsuji, Sakiko Masuda, Utano Tomaru, Akihiro Ishizu, Tatsuya Atsumi
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Journal Title
JCI insight
Volume: 8
Pages: e167486
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Regulation of NETosis and Inflammation by Cyclophilin D in Myeloperoxidase-Positive Antineutrophil Cytoplasmic Antibody-Associated Vasculitis2023
Author(s)
Takashi Kudo, Daigo Nakazawa, Kanako Watanabe-Kusunoki, Masatoshi Kanda, Satoka Shiratori-Aso, Nobuya Abe, Saori Nishio, Jun-Ichiro Koga, Sari Iwasaki, Takahiro Tsuji, Yuichiro Fukasawa, Miwako Yamasaki, Masahiko Watanabe, Sakiko Masuda, Utano Tomaru, Masaaki Murakami, Yasuaki Aratani, Akihiro Ishizu, Tatsuya Atsumi
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Journal Title
Arthritis Reumatol
Volume: 75
Pages: 71-83
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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