• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2023 Fiscal Year Annual Research Report

概日リズムのヘテロ性と相互作用:数理的手法に基づく定量と機能の解明

Research Project

Project/Area Number 22KJ0706
Allocation TypeMulti-year Fund
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

渡邊 絵美理  東京大学, 新領域創成科学研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2023-03-08 – 2024-03-31
Keywords概日リズム / 数理モデリング / 結合振動子
Outline of Annual Research Achievements

本研究の目的は、細胞レベルでの概日リズムの実験データをもとに、数理モデリングや数値シミュレーションを通して、細胞ごとのヘテロ性や細胞間における相互作用を定量化する手法を確立し、ヘテロ性の意義を解明することである。最終年度である令和5年度においては、前年度からの続きとして、振動子集団の集団秩序度の時系列データからその振動子の固有振動数のばらつきと結合強度を推定する手法の開発を行った。これまで同様、リミットサイクル振動子集団の数値シミュレーションの結果から、結合強度と固有振動数のばらつきの2つのモデルパラメータの推定を試みた。位相振動子モデルの代表的なモデルである蔵本モデルで得られる秩序変数でのフィッティングによって推定を試みた。結合がないときの振動子数無限大での秩序変数の時系列をフィッティングし、そのときのフィッティングパラメータと誤差からモデルパラメータを推定する手法を開発した。この手法を用いることで、蔵本モデルにおいて振動子数無限大極限において解析解の得られないような固有振動数分布を仮定しているときでも、モデルパラメータの推定ができる。この研究成果を元に論文を執筆中である。

  • Research Products

    (2 results)

All 2023

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (1 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] A non-cell-autonomous circadian rhythm of bioluminescence reporter activities in individual cells in duckweed2023

    • Author(s)
      Emiri Watanabe, Tomoaki Muranaka, Shunji Nakamura, Minako Isoda, Yu Horikawa, Tsuyoshi Aiso, Shogo Ito, and Tokitaka Oyama
    • Journal Title

      Plant Physiology

      Volume: 193-1 Pages: 677-688

    • DOI

      10.1093/plphys/kiad218

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] ウキクサ植物でみられる細胞非自律的な概日リズム2023

    • Author(s)
      渡邊絵美理、村中智明、中村駿志、磯田珠奈子、堀川湧、相磯豪志、伊藤照悟、小山時隆
    • Organizer
      第61回 日本生物物理学会年会
    • Invited

URL: 

Published: 2024-12-25  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi