2015 Fiscal Year Annual Research Report
遺伝子破壊細胞を使った、化学物質の生物効果をハイスループットに解析するシステム
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23221005
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| Research Institution | Kyoto University |
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Principal Investigator |
武田 俊一 京都大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (60188191)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
廣田 耕志 首都大学東京, 理工学研究科, 教授 (00342840)
山田 亮 京都大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (50301106)
岡田 徹也 京都大学, 理学(系)研究科(研究院), 助教 (70378529)
笹沼 博之 京都大学, 医学(系)研究科(研究院), 准教授 (00531691)
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| Project Period (FY) |
2011-04-01 – 2016-03-31
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| Keywords | 有害化学物質 / 化審法 / 遺伝毒物学 / 発がん物質 / 変異原 / 小核試験 / はいスループットスクリーニング / レギュラトリーサイエンス |
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| Outline of Annual Research Achievements |
（１）我々が開発した変異原性試験の妥当性を検定
変異原性化学物質をハイスループットに検出するバイオアッセイを、ニワトリDT40細胞を使って創った。開発した試験の妥当性を以下のように検証した。大学院生を2014年度から1.5年間米国NIHに派遣し、本バイオアッセイを使い米国National Toxicology Program (NTP) の化学物質ライブラリー（約10,000種類、10Kライブラリー）を解析した。感度および特異性ともに高いことが示された。10Kライブラリーのなかで、これまで変異原性が知られていなかった化学物質の変異原性を新たに検出できた。
（２）変異原性化学物質の作用機序を包括的に解明するシステムの開発
社会のニーズは、化学構造からin silicoに変異原性を予測することにある。in silicoの予測には、質の高い学習データが要る。学習データを構築するには、変異原性化学物質を、その変異誘導の作用機序（＝化学物質が作るDNA損傷）毎に分類する必要がある。我々の研究目的は、変異原性化学物質がどんなDNA損傷を作るかを正確に調べるバイオアッセイを開発することである。細胞はDNA損傷の種類毎に別々の修復酵素を持つ。ゆえに、各修復酵素の欠損細胞をゲノム編集で作れば、それらの欠損細胞群の、化学物質への応答性を調べることにより、変異原性化学物質がどんなDNA損傷を作るかを正確に解明できる。我々は、OECD諸国政府が変異原性化学物質検出に使う標準ヒト細胞株（TK6）から約20種類のDNA修復酵素の各ミュータントを既に創った。
（３）小胞体ストレス誘導化学物質を検出するバイオアッセイの開発
小胞体ストレスをおこす薬剤を高感度に解析するバイオアッセイを創った。米国NIHで解析したところ、このバイオアッセイは、高感度であり、かつ米国企業が創ったバイオアッセイの感度と遜色ないことが解った。
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| Research Progress Status |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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Research Products
(40 results)
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[Journal Article] The role of HERC2 and RNF8 ubiquitin E3 ligases in the promotion of translesion DNA synthesis in the chicken DT40 cell line.2016
Author(s)
Mohiuddin, Kobayashi S, Keka IS, Guilbaud G, Sale J, Narita T, Abdel-Aziz HI, Wang X, Ogawa S, Sasanuma H, Chiu R, Oestergaard VH, Lisby M, Takeda S.
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Journal Title
DNA Repair (Amst)
Volume: 40
Pages: 64-76
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Synergistic association of elevated serum free fatty acid and glucose levels with large arterial stiffness in a general population: The Nagahama Study.2016
Author(s)
Tabara Y, Takahashi Y, Setoh K, Kawaguchi T, Gotoh N, Terao C, Yamada R, Kosugi S, Sekine A, Nakayama T, Matsuda F; Nagahama Study group.
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Journal Title
Metabolism
Volume: 65
Pages: 66-72
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Abacavir, an anti-HIV-1 drug, targets TDP1 deficient adult T-cell leukemia.2015
Author(s)
Tada K, Kobayashi M, Takiuchi Y, Iwai F, Sakamoto T, Nagata K, Shinohara M, Io K, Shirakawa K, Hishizawa M, Shindo K, Kadowaki N, Hirota K, Yamamoto J, Iwai S, Sasanuma H, Takeda S, Takaori-Kondo A.
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Journal Title
Sci Adv.
Volume: 1
Pages: e1400203
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Forcible destruction of severely misfolded mammalian glycoproteins by the non-glycoprotein ERAD pathway.2015
Author(s)
Ninagawa S, Okada T, Sumitomo Y, Horimoto S, Sugimoto T, Ishikawa T, Takeda S, Yamamoto T, Suzuki T, Kamiya Y, Kato K, Mori K.
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Journal Title
J Cell Biol.
Volume: 211
Pages: 775-784
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Relative contribution of four nucleases, CtIP, Dna2, Exo1 and Mre11 to the initial step of double-strand break repair by homologous DNA recombination in the chicken DT40 cell line.2015
Author(s)
Hoa NN, Akagawa R, Yamasaki T, Hirota K, Sasa K, Natsume T, Kobayashi J, Sakuma T, Yamamoto T, Komatsu K, Kanemaki MT, Pommier Y, Takeda S, Sasanuma H.
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Journal Title
Genes Cells
Volume: 20
Pages: 1059-1076
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
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[Presentation] Collaboration of BRCA1, CtIP, and Dna2 is required to initiate double-strand break repair by homologous recombination2015
Author(s)
Hoa NN, Kobayashi J, Omura M, Tsuda M, Hirota K, Hirakawa M, Yang SH, Paull TT, Komatsu K, Takeda S, Sasanuma H
Organizer
FASEB Science Research Conferences, Genetic Recombination and Genome Rearrangements
Place of Presentation
Steamboat Springs, Colorado, USA
Year and Date
2015-07-19 – 2015-07-24
Int'l Joint Research
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