2013 Fiscal Year Annual Research Report
小児固形腫瘍の発がん機構とがん幹細胞の体系的解析と新規治療法の開発
Project/Area Number |
23390269
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Research Institution | The University of Tokyo |
Principal Investigator |
滝田 順子 東京大学, 医学部附属病院, 准教授 (00359621)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
真田 昌 京都大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (20529044)
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Project Period (FY) |
2011-04-01 – 2014-03-31
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Keywords | 医療・福祉 / 遺伝子 / 癌 / ゲノム / マイクロアレイ |
Research Abstract |
小児の代表的な難治性固形腫瘍である横紋筋肉腫、肝芽腫および肺芽腫の臨床検体を用いて、次世代シークエンサーを用いたエクソーム解析および全ゲノム解析を行い腫瘍の発症およびがん幹細胞を制御する標的分子の同定を試みた。また、神経芽腫において、がん幹細胞の制御に重要な役割を果たしていると推定されるポリコーム群遺伝子80個のdeep sequencingを行い、発症・進展への関与を検討した。横紋筋肉腫におけるエクソーム解析および全ゲノム解析では、FGFR4 pathwayに重複変異が見出された。そこで、60例のvalidation cohortを用いて、FGFR4 pathwayに見出された標的分子計8遺伝子、全長500kbの領域のdeep sequencingを行った。その結果、FGFR4 pathway変異は約30%の症例に検出され、特に胎児型横紋筋肉腫に多い傾向が見られた。従って、胎児型横紋筋肉腫の発がんにFGFR4 pathway変異が関与している可能性が示唆された。また、肝芽腫10例および肺芽腫7例のエクソーム解析では、肝芽腫におけるCTNNB、APC遺伝子の重複変異、肺芽腫におけるDICER1の高頻度は両アレル変異が見出された。これらの遺伝子は、肝芽腫や肺芽腫の発症に関与していることが示された。さらに、神経芽腫96検体におけるポリコーム群遺伝子80個のdeep sequencingでは、12例(13%)の例で、変異が検出された。これらの変異の大部分は排他的に起こっていることから、神経芽腫の一部では、ポリコーム群遺伝子の異常が発症に関与していることが示唆された。
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Current Status of Research Progress |
Reason
25年度が最終年度であるため、記入しない。
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Strategy for Future Research Activity |
25年度が最終年度であるため、記入しない。
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[Journal Article] Genome-wide approach to identify second gene targets for malignant rhabdoid tumors using high-density oligonucleotide microarrays.2014
Author(s)
Takita J, Chen Y, Kato M, Ohki K, Sato Y, Ohta S, Sugita K, Nishimura R, Hoshino N, Seki M, Sanada M, Oka A, Hayashi Y, Ogaw S.
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Journal Title
Cancer Sci.
Volume: 105
Pages: 258-64
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Biallelic DICER1 mutations in sporadic pleuropulmonary blastoma.2013
Author(s)
Seki M, Yoshida K, Shiraishi Y, Shimamura T, Sato Y, Nishimura R, Okuno Y, Chiba K, Tanaka H, Kato K, Kato M, Hanada R, Nomura Y, Park MJ, Ishida T, Oka A, Igarashi T, Miyano S, Hayashi Y, Ogawa S, Takita J
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Journal Title
Cancer Res.
Volume: in press
Pages: Epub
Peer Reviewed
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[Journal Article] Comparison of intravenous with oral busulfan in allogeneic hematopoietic stem cell transplantation with myeloablative conditioning regimens for pediatric acute leukemia.2013
Author(s)
Kato M, Takahashi Y, Tomizawa D, Okamoto Y, Inagaki J, Koh K, Ogawa A, Okada K, Cho Y, Takita J, Goto H, Sakamaki H, Yabe H, Kawa K, Suzuki R, Kudo K, Kato K.
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Journal Title
Biol Blood Marrow Transplant.
Volume: 19
Pages: 1690-1694
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Mutational analyses of the ATP6V1B1 and ATP6V0A4 genes * in patients with primary distal renal tubular acidosis.2013
Author(s)
Miura K, Sekine T, Takahashi K, Takita J, Harita Y, Ohki K, Park M-J, Hayashi Y, Tajima A, Ishihara M, Hisano M, Murai M, Igarashi T.
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Journal Title
Nephrol Dial Transplant.
Volume: 28
Pages: 2123-2130
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Characterization of genetic lesions in rhabdomyosarcoma using a high-density single nucleotide polymorphism array.2013
Author(s)
Nishimura R, Takita J, Sato-Otsubo A, Kato M Koh K, Hanada R, Tanaka Y, Kato K, Maeda D, Fukayama M, Sanada M, Hayashi Y, Ogawa S.
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Journal Title
Cancer Sci.
Volume: 104
Pages: 856-864
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] ADORA2A polymorphism predisposes children to encephalopathy with febrile status epilepticus.2013
Author(s)
Shinohara M, Saitoh M, Nishizawa D, Ikeda K, Hirose S, Takanashi J, Takita J, Kikuchi K, Kubota M, Yamanaka G, Shiihara T, Kumakura A, Kikuchi M, Toyoshima M, Goto T, Yamanouchi H, Mizuguchi M.
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Journal Title
Neurology
Volume: 80
Pages: 1571-1576
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Aggressive transformation of juvenile myelomonocytic leukemia associated with duplication of oncogenic KRAS in consequence of acquired uniparental disomy.2013
Author(s)
Kato M, Yasui N, Seki M, Kishimoto H, Sato-Otsubo A, Hasegawa D, Kiyokawa N, Hanada R. Ogawa S, Manabe A, Takita J, Koh K.
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Journal Title
J Pediatr.
Volume: 162
Pages: 1285-1288
DOI
Peer Reviewed
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[Presentation] Genetic Landscapes Of Childhood T-Cell Acute Lymphoblastic Leukemia.2013
Author(s)
Seki M, Nishimura R, Hoshino N, Okuno Y, Yoshida K, Shiraishi Y, Sanada M, Miyano S, Hayashi Y, Ogawa S, Takita J
Organizer
American Society of Hematology 2013
Place of Presentation
New Orleans, U.S.A.
Year and Date
20131207-20131210
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[Presentation] Genome-wide analysis of relapsed T cell acute lymphoblastic leukemia.2013
Author(s)
Seki M, Hoshino N, Nishimura R, Okuno Y, Shiraishi Y, Yoshida K, Kato M, Koh K, Hanada R, Miyano S, Hayashi Y, Ogawa S, Takita J
Organizer
The 75th Annual Meeting of the Japanese Society of Hematology
Place of Presentation
Sapporo
Year and Date
20131011-20131013
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[Presentation] Whole-exome resequencing reveals novel pathogenetic gene mutations in pediatric AML.2013
Author(s)
Shiba N, Yoshida K, Okuno Y, Shiraishi Y, Nagata Y, Kon A, Chiba K, Tanaka H, Ohki K, Kato M, Terui K, Park MJ, Kanazawa T, Takita J, Kudo K, Arakawa H, Ito E, Sanada M, Miyano S, Ogawa S, Hayashi Y:
Organizer
The 75th Annual Meeting of the Japanese Society of Hematology
Place of Presentation
Sapporo
Year and Date
20131011-20131013
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[Presentation] Identification of Somatic and Germline Mutations using Whole exome sequencing of hepatoblastoma.2013
Author(s)
Hoshino N, Nishimura R, Seki M, Okuno Y, Shiraishi Y, Sato Y, Yoshida K, Miyano S, Hahashi Y, Iwanaka T, Ogawa S, Takita J
Organizer
The 45th Congress of the International Society of Paediatric Oncology
Place of Presentation
Hong Kong
Year and Date
20130925-20130928
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[Presentation] The Genetic landscapes of rhabdomyosarcoma.2013
Author(s)
Nishimura R, Yoshida K, Shiraishi Y, Okuno Y, Seki M, Hoshimo N, Sanada M, Hayashi Y, Miyano S, Ogawa S, Takita J
Organizer
The 45th Congress of the International Society of Paediatric Oncology
Place of Presentation
Hong Kong
Year and Date
20130925-20130928
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[Presentation] ターゲットキャプチャーを用いた神経芽腫におけるエピジェネティック関連遺伝子の網羅的ゲノム解析.2013
Author(s)
星野論子, 西村力, 関正史, 奥野友介, 吉田健一, 白石友一, 宮野悟, 林泰秀, 小川誠司, 岩中督, 滝田順子
Organizer
第50回 日本小児外科学会学術集会
Place of Presentation
東京
Year and Date
20130530-20130611
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[Presentation] Exome sequencing analysis in rhabdomyosarcoma including metastatic or relapsed tumors.2013
Author(s)
Nishimura R, Yoshida K, Shiraishi Y, Okuno Y, Seki M, Hoshino N, Sanada M, Hayashi Y, Miyano S, Ogawa S, Takita J
Organizer
9th ASPR Congress
Place of Presentation
Malaysia
Year and Date
20130509-20130512
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[Presentation] Genome-wide analyses of pleuropulmonary blastoma.2013
Author(s)
Seki M, Nishimiura R, Hoshino N, Okuno Y, Yoshida K, Shiraishi Y, Sanada M, Kato K, Miyano S, Hayashi Y, Ogawa S, Takita J
Organizer
9th ASPR Congress
Place of Presentation
Malaysia
Year and Date
20130509-20130512
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[Presentation] Genome-wide approach to identify gene targets of pleuropulmonary blastoma.2013
Author(s)
Seki M, Nishimura R, Okuno Y, Yoshida K, Shiraishi Y, Sanada M, Kato K, Hayashi Y, Miyano S, Ogawa S, Takita J
Organizer
American Association for Cancer Research 2013
Place of Presentation
Washington DC, U.S.A
Year and Date
20130406-20130410
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[Presentation] T細胞性ALLにおける網羅的ゲノム解析
Author(s)
樋渡光輝, 関正史, 西村力, 星野論子, 奥野雄介, 白石悠一, 吉田健一, 林泰秀, 加藤元博, 康勝好, 花田良二, 宮野悟, 小川誠司, 滝田順子
Organizer
北関東小児がん学会
Place of Presentation
群馬
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