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2013 Fiscal Year Final Research Report

The degradation pathway of plant N-glycans and functional analysis of the N-glycan degradation-deficient mutant

Research Project

  • PDF
Project/Area Number 23570163
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Research Field Functional biochemistry
Research InstitutionRitsumeikan University (2012-2013)
Osaka University (2011)

Principal Investigator

ISHIMIZU Takeshi  立命館大学, 生命科学部, 准教授 (30314355)

Project Period (FY) 2011 – 2013
Keywords糖タンパク質 / N型糖鎖 / 糖質関連酵素 / フコシダーゼ / フコース / 植物
Research Abstract

The degradation pathway of high-mannose type N-glycans in plant cells has been clarified. In this study, we identified a gene encoding (alpha)1,3-fucosidase acting on Fuc(alpha)1-3GlcNAc linkage in plant complex type N-glycans. Its substrate specificity analysis revealed the degradation pathway of plant complex type N-glycans. The (alpha)1,3-fucosidase-deficient mutant changed the composition of N-glycans in plant cells, showing that (alpha)1,3-fucosidase is an essential glycosidase in plant N-glycan degradation.

  • Research Products

    (45 results)

All 2014 2013 2012 2011 Other

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (32 results) (of which Invited: 8 results) Book (3 results) Remarks (3 results)

  • [Journal Article] 植物N 型糖鎖の分解とその生理機能2013

    • Author(s)
      石水毅
    • Journal Title

      バイオサイエンスとインダストリー

      Volume: 71 Pages: 220-223

    • URL

      http://www.jba.or.jp/pc/archive/bi_archive/

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] N 型糖鎖に作用する植物マンノシダーゼ2013

    • Author(s)
      石水毅
    • Journal Title

      応用糖質科学

      Volume: 3 Pages: 93-98

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The N-glycan degradation pathway in plants2012

    • Author(s)
      Ishimizu, T.
    • Journal Title

      Glycoscience 2008-2012

      Volume: 1 Pages: 68-69

  • [Journal Article] New strategy for the synthesis of glycoprotein: A single expression method of two peptide segments encoded as a tandem sequence in plasmid and its conversion to peptide-αthioester2012

    • Author(s)
      Kimura, M., Izumi, M., Okamoto, R., Ishimizu, T., and Kajihara, Y.
    • Journal Title

      Peptide Science 2012

      Volume: 48 Pages: 15-16

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 八方美人なアルギニン--アルギニンがタンパク質凝集抑制に効くワケ2011

    • Author(s)
      石水 毅
    • Journal Title

      化学

      Volume: 66 Pages: 60-61

  • [Journal Article] 植物N-結合型糖鎖の分解機構2011

    • Author(s)
      石水 毅
    • Journal Title

      生化学

      Volume: 83 Pages: 1087-1099

    • URL

      http://www.jbsoc.or.jp/seika/wp-content/uploads/2013/05/83-12-03.pdf

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Effects of L-arginine on solubilization and purification of plant membrane proteins2011

    • Author(s)
      Arakawa, J., Uegaki, M., and Ishimizu, T.
    • Journal Title

      Protein Expr. Purif.

      Volume: 80 Pages: 91-96

    • DOI

      10.1016/j.pep.2011.05.014

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 植物細胞壁多糖ラムノガラクツロナンI の主鎖の生合成に関与するラムノース転移酵素の生化学的解析2014

    • Author(s)
      上原洋平、田村峻佑、加藤大詞、牧 祐介、湯浅大史、石水 毅
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年度大会
    • Place of Presentation
      明治大学(神奈川)
    • Year and Date
      2014-03-29
  • [Presentation] 植物N 型糖鎖の分解経路2014

    • Author(s)
      石水 毅
    • Organizer
      立命館大学糖鎖工学研究センター10周年記念シンポジウム
    • Place of Presentation
      立命館大学(滋賀)
    • Year and Date
      2014-03-14
    • Invited
  • [Presentation] 植物細胞壁成分ペクチンの生合成酵素の解析2013

    • Author(s)
      石水 毅、上原洋平、田村峻佑、鶴浜和奈、牧 祐介、今井友也
    • Organizer
      第238回京都大学生存圏研究所シンポジウム
    • Place of Presentation
      京都大学生存圏研究所(京都
    • Year and Date
      2013-11-18
    • Invited
  • [Presentation] RG-II に含まれるアピオースの前駆体であるUDP-アピオースの単離法2013

    • Author(s)
      鈴木真未、石水 毅
    • Organizer
      第7回植物細胞壁ネットワーク研究会
    • Place of Presentation
      つくばグランドホテル(茨城)
    • Year and Date
      2013-11-13
  • [Presentation] ラムノガラクツロナンI の生合成に関与するラムノース転移酵素の同定2013

    • Author(s)
      鶴浜和奈、石水 毅
    • Organizer
      第7回植物細胞壁ネットワーク研究会
    • Place of Presentation
      つくばグランドホテル(茨城)
    • Year and Date
      2013-11-13
  • [Presentation] 植物N 型糖鎖に作用する糖質分解酵素の解析2013

    • Author(s)
      石水 毅
    • Organizer
      第86回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      横浜パシフィコ(神奈川)
    • Year and Date
      2013-09-12
    • Invited
  • [Presentation] 立命館大学生命科学部バイオエネルギー研 研究室紹介2013

    • Author(s)
      石水 毅
    • Organizer
      滋賀経済同友会「新・ものづくり」研究会
    • Place of Presentation
      ホテルニューオウミ(滋賀)
    • Year and Date
      2013-09-06
  • [Presentation] 植物細胞壁多糖ラムノガラクツロナンI ラムノース転移酵素の活性測定法の構築2013

    • Author(s)
      牧 祐介、上原洋平、田村峻佑、石井 忠、石水 毅
    • Organizer
      第32回日本糖質学会年会
    • Place of Presentation
      大阪国際交流センター(大阪)
    • Year and Date
      2013-08-07
  • [Presentation] 植物コンプレックス型糖鎖に作用するα1,3-フコシダーゼの同定2013

    • Author(s)
      北川真衣、加藤俊、林めぐみ、石水 毅
    • Organizer
      第32回日本糖質学会年会
    • Place of Presentation
      大阪国際交流センター(大阪)
    • Year and Date
      2013-08-07
  • [Presentation] 膜タンパク質の効率的可溶化法・精製法の開発2013

    • Author(s)
      石水 毅
    • Organizer
      サントリー生有研シンポジウム「生体膜における生命現象解明の新展開」
    • Place of Presentation
      サントリー生物有機科学研究所(大阪府)
    • Year and Date
      2013-07-17
    • Invited
  • [Presentation] Cloning, expression and characterization of polygalacturonase from Arabidopsis thaliana2013

    • Author(s)
      Mustafa, N.S., Ohashi, T., Ishimizu, T., Fujiyama, K.
    • Organizer
      日本農芸化学会2013年度大会
    • Place of Presentation
      東北大学(宮城)
    • Year and Date
      2013-03-25
  • [Presentation] ペクチンラムノガラクツロナンの合成に関与するラムノース転移酵素の活性測定法2013

    • Author(s)
      牧 祐介、俣木彩恵子、石井 忠、今井友也、長谷川友香、大橋貴生、藤山和仁、石水 毅
    • Organizer
      日本農芸化学会2013年度大会
    • Place of Presentation
      東北大学(宮城)
    • Year and Date
      2013-03-25
  • [Presentation] 食タンパク質技術の紹介2012

    • Author(s)
      石水 毅
    • Organizer
      アグリビジネス創出フェア
    • Place of Presentation
      東京ビッグサイト(東京)
    • Year and Date
      20121114-16
  • [Presentation] 植物細胞壁多糖ラムノガラクツロナンの合成に関わるラムノース転移酵素の活性測定法の構築2012

    • Author(s)
      牧 祐介、俣木彩恵子、石井 忠、長谷川友香、大橋貴生、藤山和仁、石水 毅
    • Organizer
      第85回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場(福岡)
    • Year and Date
      2012-12-16
  • [Presentation] 植物コンプレックス型糖鎖に作用するα1,3-フコシダーゼの同定2012

    • Author(s)
      北川真衣、村田 岳、五十嵐圭日子、鮫島正浩、石水 毅
    • Organizer
      第85回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場(福岡)
    • Year and Date
      2012-12-16
  • [Presentation] 植物細胞壁多糖ラムノガラクツロナン合成酵素の活性測定法2012

    • Author(s)
      牧 祐介、俣木彩恵子、石井 忠、長谷川友香、大橋貴生、藤山和仁、石水 毅
    • Organizer
      第6回植物細胞壁ネットワーク研究会
    • Place of Presentation
      ユンイチホテル南城(沖縄)
    • Year and Date
      2012-12-01
  • [Presentation] 微量膜タンパク質解析法2012

    • Author(s)
      石水 毅
    • Organizer
      産学官連携推進会議 第11回イノベーションジャパン2012
    • Place of Presentation
      東京国際フォーラム(東京)
    • Year and Date
      2012-09-27
  • [Presentation] ニホンナシ花柱組織の発育に伴う S-RNase の蓄積2012

    • Author(s)
      岡村彩葉、李 リ怡、石水 毅、安田(高崎)剛志
    • Organizer
      園芸学会平成24 年度秋季大会
    • Place of Presentation
      福井県立大学(福井)
    • Year and Date
      2012-09-23
  • [Presentation] JCGGDB の活動報告2012

    • Author(s)
      鹿内俊秀、梶 裕之、鈴木芳典、藤田典昭、前田真砂子、文 紅玲、石崎 円、澤木弘道、奥田修二郎、鴨さおり、中尾広美、石水 毅、川嵜伸子、川嵜敏祐、山田一作、本庄秀之、森 昌子、弘瀬友理子、水野真盛、加藤雅樹、菅 秋次、山口芳樹、木下聖子、河野 信、成松 久
    • Organizer
      第31回日本糖質学会年会
    • Place of Presentation
      鹿児島市民文化ホール(鹿児島)
    • Year and Date
      2012-09-18
  • [Presentation] 植物糖鎖の生合成・分解の分子機構2012

    • Author(s)
      石水 毅
    • Organizer
      鳥取県西部農業改良普及所セミナー
    • Place of Presentation
      鳥取県西部農業改良普及所大山普及所(鳥取)
    • Year and Date
      2012-08-27
    • Invited
  • [Presentation] Tobacco BY-2 cell-based induction system for xylem vessel element differentiation; useful tool to study molecular mechanisms for secondary cell wall biogenesis2012

    • Author(s)
      Nakano, Y., Fukamizu, Y., Ito, Y., Goue, N., Igarashi, H., Yamaguchi, M., Ishimizu, T., Demura, T.
    • Organizer
      第53回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      京都産業大学(京都)
    • Year and Date
      2012-03-18
  • [Presentation] VND7 による道管要素分化誘導系を用いたキシランキシロシルトランスフェラーゼの生化学的解析2012

    • Author(s)
      深水祐一郎、中野仁美、山口雅利、石水毅、出村 拓
    • Organizer
      第53回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      京都産業大学(京都)
    • Year and Date
      2012-03-18
  • [Presentation] Tobacco BY-2 Cell-Based Induction System for Xylem Vessel Element Differentiation; Useful Tool to Study Molecular Mechanisms for Secondary Cell Wall Biogenesis2011

    • Author(s)
      Nakano, Y., Fukamizu, Y., Ito, Y., Goue, N., Igarashi, H., Yamaguchi, M., Ishimizu, T., Demura, T.
    • Organizer
      The 4th Conference on Biosynthesis of Plant Cell Wall
    • Place of Presentation
      淡路島夢舞台(兵庫)
    • Year and Date
      2011-10-05
  • [Presentation] Effects of L-arginine on solubilization and purification of polygalacturonic acid synthase2011

    • Author(s)
      Arakawa, J., Uegaki, K., Ishimizu, T.
    • Organizer
      The 4th Conference on Biosynthesis of Plant Cell Wall
    • Place of Presentation
      淡路島夢舞台(兵庫)
    • Year and Date
      2011-10-05
  • [Presentation] Efficient solubilization and purification methods for polygalacturonic acid synthase2011

    • Author(s)
      Ishimizu, T., Yasui, K., Uegaki, K., Arakawa, J.
    • Organizer
      The 4th Conference on Biosynthesis of Plant Cell Wall
    • Place of Presentation
      淡路島夢舞台(兵庫)
    • Year and Date
      2011-10-04
  • [Presentation] 植物細胞壁生合成酵素の同定に向けた膜タンパク質の効率的調製法の開発2011

    • Author(s)
      石水 毅, 安井一敏, 上垣眞理, 荒川隼至
    • Organizer
      第84回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      京都国際会館(京都)
    • Year and Date
      2011-09-24
    • Invited
  • [Presentation] ペクチン生合成酵素の精製における塩基性アミノ酸の利用2011

    • Author(s)
      荒川隼至, 上垣眞理, 石水 毅
    • Organizer
      第84回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      京都国際会館(京都
    • Year and Date
      2011-09-24
  • [Presentation] 植物液胞・αマンノシダーゼ候補タンパク質の発現系構築2011

    • Author(s)
      前田紗希, 石水 毅
    • Organizer
      第84回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      京都国際会館(京都)
    • Year and Date
      2011-09-23
  • [Presentation] ペクン生合成酵素の精製における塩基性アミノ酸の利用2011

    • Author(s)
      荒川隼至, 上垣眞理, 石水 毅
    • Organizer
      第30回日本糖質学会年会
    • Place of Presentation
      長岡リリックホール(新潟)
    • Year and Date
      2011-07-13
  • [Presentation] 植物糖鎖関連酵素の解析と植物糖鎖分解システム2011

    • Author(s)
      石水 毅
    • Organizer
      食品安全工学科セミナー
    • Place of Presentation
      近畿大学生物理工学部(和歌山)
    • Year and Date
      2011-07-06
    • Invited
  • [Presentation] 膜タンパク質精製における塩基性アミノ酸の利用2011

    • Author(s)
      荒川隼至, 石水 毅
    • Organizer
      第11回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      ホテル阪急エキスポパーク(大阪)
    • Year and Date
      2011-06-08
  • [Presentation] 植物糖タンパク質糖鎖の分解機構2011

    • Author(s)
      石水 毅
    • Organizer
      第12回関西グライコサイエンスフォーラム
    • Place of Presentation
      大阪大学(大阪)
    • Year and Date
      2011-05-14
    • Invited
  • [Book] 生体高分子の基礎2014

    • Author(s)
      長谷川慎, 前田衣織, 有馬一成, 石水 毅
    • Total Pages
      188
    • Publisher
      実教出版(2014年刊行予定)
  • [Book] Plant N-glycans and their degrading enzymes. In Glycoscience : Biology and Medicine (Eds, Taniguchi, N., Endo, T., Hart, G., Seeberger P., Wong,C.H.)2014

    • Author(s)
      Ishimizu, T.
    • Publisher
      Springer-Verlag(2014年刊行予定)
  • [Book] 「蛍光標識糖鎖の分離定量」「N型糖鎖の構造解析」「酵素分解による構造解析」植物細胞壁(西谷和彦、梅澤俊明編)2013

    • Author(s)
      石水 毅
    • Total Pages
      304, 307-309
    • Publisher
      講談社
  • [Remarks] ホームページ立命館大学生命科学部石水研ホームページ

    • URL

      http://www.ismz.sk.ritsumei.ac.jp/

  • [Remarks] アウトリーチ活動酵素を見てみよう 立命館宇治中学校2013 年6 月7 日

  • [Remarks] アウトリーチ活動立命館大学生命科学部入学のススメ 滋賀県立石山高等学校 2013 年9 月20 日

URL: 

Published: 2015-07-16  

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