2013 Fiscal Year Annual Research Report
ホウレンソウにおける性決定遺伝子コード候補領域の絞り込み
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23580001
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| Research Institution | Hokkaido University |
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Principal Investigator |
小野寺 康之 北海道大学, (連合)農学研究科(研究院), 講師 (80374619)
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| Keywords | 性決定遺伝子 |
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| Research Abstract |
ホウレンソウの雄特異的領域（MSY, Male Specific region of Y）の一部（約500 Kbp）をカバーするBACクローンの配列について再解析を試みた．その結果，この配列の約60%が反復性の配列（転移因子様配列，Simple repeat, Low complexityおよびMini-satellite）で占められることが判明したが，その大部分が2種類のレトロエレメント（SpRE1およびSpRE2と命名）であることが判明した．SpRE1はタンパク質コード配列の配置に基づいてTy1-copia型に分類されたが，そのLTR配列は既知のものとは相同性を示さない新規のLTRであった．一方，SpRE2のLTRはSpRE1のそれらと高い相同性を示した．しかしながら，SpRE2からはタンパク質コード配列が見出されないことから，非自立型のレトロエレメント（LARD, Large Retrotransposon Derivatives）であることが判明した．
ホウレンソウの間性（雌雄同株性）の発現にかかわる主働遺伝子Mのポジショナルクローニングに向けて，これに近接する2つのSCARマーカー（SP_0008およびSP_0022）を作成した．このマーカーに拠って，Mの座乗領域を6 cMの範囲に絞り込むことができた．このマーカーを用いて単離されたホウレンソウゲノムBACクローンを起点にクロモソームウォーキングを試みたが，SpRE1およびSpRE2などの散在性反復配列に阻まれてBACコンティグを拡張させることはできなかった．従って，さらにMに近接したマーカーを開発することが今後の課題である．その有効な方策の一つとして，筆者はSpRE1/SpRE2のLTR配列を利用したTD（トランスポゾンディスプレイ）解析によってマーカー開発を実施することを予定している．
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