エクソンスキッピング誘導効率を規定するシス因子の解明

2013 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 23591496
• Research Institution: Kobe University
• Principal Investigator: 八木 麻理子 神戸大学, 医学(系)研究科(研究院), 研究員 (60362787)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 竹島 泰弘 神戸大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (40281141) ; 粟野 宏之 神戸大学, 医学(系)研究科(研究院), その他 (30437470)
• Keywords: スプライシング

Research Abstract

平成２５年度の研究では、平成２４年度に引き続き、アンチセンスオリゴヌクレオチドによるエクソンスキッピング効果について検討した、ジストロフィン遺伝子エクソン４６～５３の領域に欠失を有するデュシェンヌ型筋ジストロフィー（以下、DMD）患者由来の欠失断端解析を行った。その結果、以下のように合計１０例の欠失断端をイントロン４５内に同定した。
エクソン４６－４７欠失（２例）：(1)c.6614+20554、(2)c.6614+13448、エクソン４６ー４８欠失（１例）：(3)c.6614+22395、エクソン４６-４９欠失（２例）：(4)c.6614+23492、(5)c.6614+18560、エクソン４６－５１欠失（３例）：(6)c.6614+35997、(7)c.6614+7406、(8)c.6614+11854、エクソン４６-５３欠失（２例）：(9)c.6614+18658、(10)c.6614+5698
同じ欠失変異であっても断端は１０例すべてで異なっていることが明らかになった。欠失断端が比較的近傍に位置する例で比較した結果、(5)と(9)、(7)と(10)ではエクソン４５のスキッピング誘導効率が同程度であったのに対し、(1)と(3)、(2)と(8)ではエクソン４５のスキッピング誘導効率は明らかに異なっていることが判明し、断端の位置とエクソンスキッピング誘導効率との関連は明らかにならなかった。
さらに断端領域の配列について、解析ソフト（SpliceAid、RescueESE）を用いて解析したが、エクソンスキッピング誘導効率の違いを説明できる可能性を持つ配列を同定することはできなかった。

Research Products

• [Journal Article] A novel splicing silencer generated by DMD exon 45 deletion junction could explain upstream exon 44 skipping that modifies dystrophinopathy. (2014)
  • Author(s): Ery Kus Dwianingsih, Rusdy Malueka, Atsuhiro Nishida, Tomoko Lee, Mariko Yagi, Kazumoto Iijima, Yasuhiro Takeshima, Kyoko Ito, Masafumi Matsuo.
  • Journal Title: J Hum Genet. Volume: in press Pages: in press
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Differences in carrier frequency between mothers of Duchenne and Becker muscular dystrophy patients. (2013)
  • Author(s): Lee T, Takeshima Y, Kusunoki N, Awano H, Yagi M, Matsuo M, Iijima K.
  • Journal Title: J Hum Genet. Volume: 59 Pages: 46-51
  • DOI: 10.1038/jhg.2013.119. Epub 2013 Nov 14.
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] A prostaglandin D2 metabolite is elevated in the urine of Duchenne muscular dystrophy patients and increases further from 8 years old. (2013)
  • Author(s): Nakagawa T, Takeuchi A, Kakiuchi R, Lee T, Yagi M, Awano H, Iijima K, Takeshima Y, Urade Y, Matsuo M.
  • Journal Title: Clin Chim Acta. Volume: 423 Pages: 10-14
  • DOI: 10.1016/j.cca.2013.03.031. Epub 2013 Apr 19.
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Molecular characterization of an X(p21.2;q28) chromosomal inversion in a Duchenne muscular dystrophy patient with mental retardation reveals a novel long non-coding gene on Xq28. (2013)
  • Author(s): Tran TH, Zhang Z, Yagi M, Lee T, Awano H, Nishida A, Okinaga T, Takeshima Y, Matsuo M.
  • Journal Title: J Hum Genet. Volume: 58 Pages: 33-39
  • DOI: 10.1038/jhg.2012.131. Epub 2012 Dec 6.
  • Peer Reviewed
• [Presentation] ジストロフィン遺伝子スプライシングコンセンサス配列内変異によるスプライシング型の変化 に関わる因子の検討 (2013)
  • Author(s): 李知子、楠典子、八木麻理子、竹島泰弘、松尾雅文、飯島一誠、
  • Organizer: 日本人類遺伝学会第５８回大会
  • Place of Presentation: 宮城県仙台市
  • Year and Date: 20131120-20131123