2011 Fiscal Year Research-status Report
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23659674
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| Research Institution | Nagoya City University |
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Principal Investigator |
藤井 義敬 名古屋市立大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (40156831)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
佐々木 秀文 名古屋市立大学, 医学(系)研究科(研究院), 准教授 (00336695)
矢野 智紀 名古屋市立大学, 医学(系)研究科(研究院), 准教授 (40315883)
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| Project Period (FY) |
2011-04-28 – 2014-03-31
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| Keywords | 肺癌 / KIF5B/RET / RET / FISH / CISH |
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| Research Abstract |
Dana Farber Cancer Instituteとの共同研究により、肺腺癌において次世代シーケンスを用いて新たな遺伝子変異を検索したところ、KIF5BとRET遺伝子の転座融合遺伝子を新規に同定した。この転座遺伝子にはいくつかのバリアントが存在し、肺腺癌の１－２％程度に生じることがわかった。日本の他の二つのグループから同じ転座が報告されているが、非喫煙者や女性に多い、このKIF5B/RET転座融合遺伝子の全長を細胞に導入したところVandetanib, Sorafinib, SunitinibといったRET阻害剤に高感受性となった。現在、臨床検体を用いてこの融合遺伝子を検出する試みを行っている。５’KIF5Bや、３’RET遺伝子のBACクローンをいくつか組みあわせる事によってFISH用のプローブを作製した。この従来の蛍光 in situ ハイブリダイゼーション（FISH）法を用いて、転座の検出が可能となったため、CISH (chromogenic in situ hybridization)をもちいる方法が可能か、検討中である。さらにLightCyclerによるリアルタイムPCRを用いてRET遺伝子の５’側と３’側を分けて定量を行う試みも行っている。３’側を認識するとされる市販されている二種類の特異的抗RET抗体での免疫組織学的検討も行ったが、FISH法との十分な相関は得られず、条件設定に苦慮している。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
23年度には新たな遺伝子転座を証明できたが、この検出方法としては従来からのFISH法での検出のみが成功している。FISH法は比較的高価で、蛍光顕微鏡など特殊な装置を要する上に、蛍光が減退してしまうので永久保存ができない。CISHやリアルタイムPCR法などで、簡便に検出する方法を検索したい。
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| Strategy for Future Research Activity |
肺癌における新たな分子標的の可能性があるKIF5B/RET転座を検出する、新手法を用いた検出方法の確立を目指す。例えばCISH法は、発色色素を用いて可視化するため、通常の光学顕微鏡でも検出できるうえに、標本は永久保存可能で、きわめて短時間に判定できる。さらにリアルタイムPCR法やプローブ法による検出も試みたい。
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| Expenditure Plans for the Next FY Research Funding |
肺癌におけるKIF5B/RET遺伝子転座の状況をさらに多くの検体で検索する。KIF5B/RET遺伝子検出を行うFISH法を改良し、従来までに報告してきた方法との比較検討を行う。さらにCISH法の条件を変更して満足な結果が得られるよう試みる。
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[Journal Article] Identification of new ALK and RET gene fusions from colorectal and lung cancer biopsies2012
Author(s)
Lipson D, Capelletti M, Yelensky R, Otto G, Parker A, Jarosz M, Curran JA, Balasubramanian S, Bloom T, Brennan KW, Donahue A, Downing SR, Frampton GM, Garcia L, Juhn F, Mitchell KC, White E, White J, Zwirko Z, Peretz T, Nechushtan H, Soussan-Gutman L, Kim J, Sasaki H, Kim HR, Park SI, Ercan D, Sheehan CE, Ross JS, Cronin MT, Janne PA, Stephens PJ
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Journal Title
Nat Med
Volume: 18(3)
Pages: 382-384
DOI
Peer Reviewed
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