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2014 Fiscal Year Annual Research Report

光情報伝達のサブÅ・ピコ秒分解能での全経路詳細解析

Research Project

Project/Area Number 23687019
Research InstitutionOkayama University

Principal Investigator

須藤 雄気  岡山大学, 医歯(薬)学総合研究科, 教授 (10452202)

Project Period (FY) 2011-04-01 – 2015-03-31
Keywordsレチナールタンパク質 / 光情報伝達 / 構造変化 / 生物物理学 / 発色団
Outline of Annual Research Achievements

タンパク質分子は、時々刻々とその形を変化させることで、様々な生理機能を担う。したがって、その本質的な理解には、"時間"・"空間"領域での理解が重要となる。本研究では、光受容体であるレチナールタンパク質による情報伝達を、ピコ秒"時間"分解能、および原子レベルの"空間"分解能で理解することを目的とした。

【時間:30桁】ペタ秒(10の15乗秒):分子進化機構の解析 [J. Biol. Chem., 2011a, 2011b, 2013a]。秒:新規機能・中間体の同定 [J. Biol. Chem., 2012, J. Phys. Chem. B, 2011]。ミリ秒:水素結合の組み換え [Biochemistry, 2012]。マイクロ~ナノ秒:二次構造変化 [J. Phys. Chem., B, 2013] 。ピコ秒:芳香族アミノ酸の変化 [Biochemistry, 2011a]。フェムト秒(10の-15乗秒):発色団の電子状態変化 [J. Phys. Chem. B, 2014a]。
【空間:8桁】センチメートル(10の-2乗メートル):線形動物の光による神経抑制に成功 [PLoS ONE, 2012, J. Biol. Chem., 2013a]。マイクロメートル:改変タンパク質により、微生物の運動の光制御に成功 [J. Biol. Chem., 2011a]。サブナノメートル(10の-10乗メートル):発色団構造を決定 [Biophys. J., 2011, J. Phys. Chem. B., 2012, Angew. Chem. Int. Ed., 2014]。結合の速度論的解析に成功 [Chem. Phys., 2013]。三量体-->単量体への構造転移を発見 [J. Phys. Chem., 2014b]。水素結合変化を同定 [Biochemistry, 2011b, 2012]。高分解能構造決定 [論文準備中]。

上記の精密解析は、19報の原著論文(14報の筆頭/責任著者論文を含む)に結び付くとともに、新しい光開閉型イオンチャネルの創成 [J. Am. Chem. Soc., 2015]につながった。このように、当初の想定を越える分解能で光応答の詳細を理解することができたと総括している。

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (18 results)

All 2015 2014 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Acknowledgement Compliant: 3 results) Presentation (8 results) (of which Invited: 8 results) Book (5 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Converting a light-driven proton pump into a light-gated proton channel2015

    • Author(s)
      Inoue, K., Tsukamoto, T., Shimono, K., Suzuki, Y., Miyauchi, S., Hayashi, S., Kandori, H., & *Sudo, Y.
    • Journal Title

      J. Am. Chem. Soc.

      Volume: 137 Pages: 3291-3299

    • DOI

      10.1021/ja511788f

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Atomistic design of microbial opsin-based blue-Shifted optogenetics tools2015

    • Author(s)
      Kato, H. E., Kamiya, M., Sugo, S., Ito, J., Taniguchi, R., Orito, A., Hirata, K., Inutsuka, A., Yamanaka, A., Maturana, A., Ishitani, R., Sudo, Y., *Hayashi, S., & *Nureki, O.
    • Journal Title

      Nat. Commun.

      Volume: 印刷中 Pages: 未定

    • DOI

      n.d.

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Factors affecting the stability and performance of ionic liquid-based planar transient photodetectors2015

    • Author(s)
      *Dalgleish, S., Reissig, L., Hu, L., Matsushita, M.M., Sudo, Y., & *Awaga, K.
    • Journal Title

      Langmuir

      Volume: 印刷中 Pages: 未定

    • DOI

      10.1021/la504972q

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Irreversible trimer to monomer transition of thermophilic rhodopsin upon thermal stimulation2014

    • Author(s)
      Tsukamoto, T., Demura, M., & *Sudo, Y.
    • Journal Title

      J. Phys. Chem. B

      Volume: 118 Pages: 12383-12394

    • DOI

      10.1021/jp507374q

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 光受容レチナールタンパク質の構造・機能解析:光 + タンパク質 = 薬!?2015

    • Author(s)
      須藤雄気
    • Organizer
      日本薬学会第135年会・シンポジウム 「受容体とトランスポーターの構造薬理学」
    • Place of Presentation
      神戸市, 兵庫県
    • Year and Date
      2015-03-27
    • Invited
  • [Presentation] ビタミンAアルデヒドを発色団とする光受容タンパク質の多様性と可能性が拓く光創薬科学2015

    • Author(s)
      須藤雄気
    • Organizer
      神戸薬科大学特別研究セミナー
    • Place of Presentation
      神戸市, 兵庫県
    • Year and Date
      2015-02-20
    • Invited
  • [Presentation] レチナールタンパク質が拓くフォトクロミックバイオマテリアル2015

    • Author(s)
      須藤雄気
    • Organizer
      第3回 日本バイオマテリアル学会中四国シンポジウム
    • Place of Presentation
      岡山市, 岡山県
    • Year and Date
      2015-01-28
    • Invited
  • [Presentation] 高い安定性を示す新規レチナールタンパク質TRの機能・構造と光操作への展開2015

    • Author(s)
      須藤雄気
    • Organizer
      新学術領域研究 『柔らかな分子系』 第8回ワークショップ
    • Place of Presentation
      瀬戸内市, 岡山県
    • Year and Date
      2015-01-25
    • Invited
  • [Presentation] レチナールタンパク質による光合成モドキが 世界を救う!?2014

    • Author(s)
      須藤雄気
    • Organizer
      自然科学研究機構 分間連携ワークショップ
    • Place of Presentation
      蒲郡市, 愛知県
    • Year and Date
      2014-10-25
    • Invited
  • [Presentation] Molecular-based rational design and engineering of microbial retinal proteins for optogenetics2014

    • Author(s)
      Sudo, Y.
    • Organizer
      The 16th International Conference on Retinal Proteins
    • Place of Presentation
      Nagahama, Shiga, Japan
    • Year and Date
      2014-10-09
    • Invited
  • [Presentation] 光駆動イオンポンプから光開閉性イオンチャネルへの機能変換2014

    • Author(s)
      須藤雄気
    • Organizer
      第52回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      札幌市, 北海道
    • Year and Date
      2014-09-26
    • Invited
  • [Presentation] Rational Design and Engineering of Photoactive Retinal Proteins2014

    • Author(s)
      Sudo, Y.
    • Organizer
      The 2nd Awaji International Workshop on “Electron Spin Science & Technology: Biological and Materials Science Oriented Applications (2nd AWEST 2014)
    • Place of Presentation
      淡路島, 兵庫県
    • Year and Date
      2014-06-17
    • Invited
  • [Book] Optogenetics, Chapter 7, Color tuning in retinylidene proteins2015

    • Author(s)
      Katayama, K., Sekharan, S., & *Sudo, Y.
    • Total Pages
      印刷中
    • Publisher
      Springer Verlag Tokyo
  • [Book] 好熱性細菌のレチナールタンパク質2015

    • Author(s)
      塚本卓、須藤雄気
    • Total Pages
      3
    • Publisher
      生物物理
  • [Book] ビタミンAアルデヒドを発色団とするレチナールタンパク質の多様性と可能性2015

    • Author(s)
      土井聡子、須藤雄気
    • Total Pages
      4
    • Publisher
      ビタミン学会誌
  • [Book] オプトジェネティクス(光遺伝学)の原理と基礎2015

    • Author(s)
      須藤雄気、神取秀樹
    • Total Pages
      5
    • Publisher
      ファルマシア
  • [Book] 膜タンパク質の可溶化(抽出)(2)2014

    • Author(s)
      須藤雄気、塚本卓
    • Total Pages
      10
    • Publisher
      蛋白質科学会・アーカイブ
  • [Remarks] 須藤研究室ホームページ

    • URL

      http://www.pharm.okayama-u.ac.jp/lab/bukka/page3.html

URL: 

Published: 2016-06-01  

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