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2012 Fiscal Year Annual Research Report

アジア霊長類と病原体の宿主寄生体関係史の探索

Research Project

Project/Area Number 24255009
Section海外学術
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

平井 啓久  京都大学, 霊長類研究所, 教授 (10128308)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 宮部 貴子  京都大学, 霊長類研究所, 助教 (10437288)
岡本 宗裕  京都大学, 霊長類研究所, 教授 (70177096)
古賀 章彦  京都大学, 霊長類研究所, 教授 (80192574)
安波 道郎  長崎大学, 熱帯医学研究所, 教授 (80244127)
早川 敏之  京都大学, 霊長類研究所, 助教 (80418681)
松井 淳  京都大学, 霊長類研究所, 研究員 (70455476)
Project Period (FY) 2012-04-01 – 2016-03-31
Keywords宿主寄生体関係
Research Abstract

平成24年度はタイ、マレーシア、インドネシア、台湾の研究機関と本研究課題の共同研究とその調査の依頼の会議を各当該国でおこなった。いずれの国とも共同研究・調査の実施が承諾された。現在、最終的な調査許可手続き、ならびに調査地の選定をおこなっている段階である。今年度おこなった予備的な研究成果は以下のとおりである。
(1)日本に輸入された個体や調査地で収集された血液サンプルを用いてサルレトロウイルス(SRV)4 型(SRV4)およびSRV5のELISAによる抗体検査、ならびにウイルスのDNAとRNAのPCRによる検出を試みた。カニクイザル44頭(フィリピン産、イナリサーチが輸入し飼育している)はELISA抗体検査陰性。PCR検査陰性。カニクイザル7頭(インドネシアのフィールドで採集した血液サンプル)において、ELISA抗体検査陰性、PCR検査陰性。ブタオザル13頭(インドネシアのフィールドで採集した血液サンプル)において、ELISA抗体検査陰性、PCR検査陰性。
(2)ニホンザルとカニクイザルの2種間に見られるSRVやサルマラリア原虫感染に対する感受性の差を、宿主感染抵抗因子の産生制御で説明できるかを検証するため、Millopore社Milliplex multiple cytokine assay kitをもちいて、パイロット的に23種のサイトカインの血漿中濃度の基礎値を各々2個体について測定した。測定項目の多くは2種間に差を認めなかったが、IFNγと、IL-17aは、より感染抵抗性を示すカニクイザルにおいて高値を示した(未発表)。
(3)テナガザルのexomeの解読を開始した。解析した個体は、シロテテナガザルのオス、アジルテナガザルのメス、ならびにフクロテナガザルのメスである。
(4)テナガザルから検出したヘリコバクターの分子系統解析をやり直し、新たなデータを追加した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

平成24年度は本研究課題の開始年度であるため、今後の調査協力を依頼することが主な取組であった。まずは、タイ、マレーシア、インドネシア、台湾を主調査地として、調査を開始する。その手筈が整いつつある。いずれの国からも共同研究の依頼に対して快諾が得られた。これら4カ国から調査を開始し、適宜他の国へも共同研究調査を広げていく。
SRVに関しては、今回既に調査方法を確立したので、現地調査の実施によってサンプル(糞、血液)を入手することで、研究の進捗を期待できる。マラリアならびにヘリコバクターの検出も、これまでの研究のなかで既に方法を確立している。例えば、テナガザルの血液からマラリアの、糞からヘリコバクターの特異的配列を検出し、系統解析をおこなった。すなわち、糞や血液から新たな感染個体やDNA配列を検出できれば、ただちに分子系統解析をおこなうことができる。以前からおこなっていた、テナガザルの生物地理学的な海外調査の経験が今回の課題にも有効に働くことが多く、ただちに調査および実験が開始できる状況にある。病原体の解析と並行して、宿主霊長類の免疫応答機構や分子進化の解析は、これまでにも遂行してきたので日本国内で宿主の解析をおこなう準備は万全である。
今年度調査依頼をお願いした各国とは既に共同研究協定書の覚書を取り交わしているところが多く、今後の調査が円滑におこなえる状況にある。上にも記したように、調査や実験手法もかなり確立しているので、平成24年度は初年度であるにも関わらず、今後の計画が立てやすく、おおむね順調に進展しているという達成度評価をおこなった。

Strategy for Future Research Activity

平成25年度はタイ、マレーシア、インドネシア、台湾の4カ国を中心に調査を実施する。タイはタイ動物園協会、マレーシアは野生動物保護局、インドネシアはボゴール農科大学、ガジャマダ大学、バリ大学、および台湾はPingtung大学が協力機関である。実施にあたって、調査要員と手薄な研究項目の研究者を補充する意味で、2人の研究分担者を追加する。マラリア担当のRichard Culleton(長崎大学熱帯医学研究所)と蠕虫担当のAndrew Macintosh(京都大学霊長類研究所)である。調査対象国の共同研究者とは、既にサンプリング方法(糞採集)等の話し合いはできている。対応研究者が機会を見て、独自に試料収集を実施してくれる国もあり、試料がたまった時点で京都大学霊長類研究所に招聘し、共同研究として各種病原体の検出および解析をおこなう。試料を持ち出せない国に対しては、こちらから赴きそれぞれの国の研究機関で検出、解析を共同研究としておこなう。糞や血液からの検出はそれぞれ特異的な塩基配列に対応するプライマーを設計しており、PCRを用いて検出が可能となっている。検出できたサンプルについては、シーケンサーを用いて配列解析をおこない系統的な位置を決定する。SRV4ならびにSRV5は国内でニホンザルに血小板減少症を引き起こした系統の配列と比較し、両病原体のオリジンの検索をおこなう。その他の病原体は系統解析によって、生物地理学的な分析等をおこなう。病原体の解析と並行して、宿主の免疫応答機構や分子進化の解析を、サイトカインやレトロトランスポゾンやミトコンドリアを用いて、日本国内でおこなう。それらの準備は既にできている。

  • Research Products

    (15 results)

All 2013 2012

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (9 results)

  • [Journal Article] Two Types of Alpha Satellite DNA in Distinct Chromosomal Locations in Azara's Owl Monkey.2013

    • Author(s)
      Prakhongcheep O, Hirai Y, Hara T, Srikulnath K, Hirai H, Koga A
    • Journal Title

      DNA Research

      Volume: 20 Pages: -

    • DOI

      10.1093/dnares/dst004

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Repetitive sequence originating from the centromere constitute large-scale heterochromatin in the telomere region in the siamang, a small ape.2012

    • Author(s)
      Koga A, Hirai Y, Hara T, and Hirai H
    • Journal Title

      Heredity

      Volume: 109 Pages: 180-187

    • DOI

      10.1038/hdy.2012.28

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Tandem repeat sequences evolutionarily related to SVA-type retrotransposons are expanded in the centromere region of the western hoolock gibbon, a small ape.2012

    • Author(s)
      Hara T, Hirai Y, Jahan I, Hirai H, Koga A
    • Journal Title

      Journal of Human Genetics

      Volume: 57 Pages: 760-765

    • DOI

      10.1038/jhg.2012.107

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A novel composite retrotransposon derived from or generated independently of the SVA (SINE/VNTR/Alu) transposon has undergone proliferation in gibbon genomes.2012

    • Author(s)
      Hara T, Hirai Y, Baicharoen S, Hayakawa T, Hirai H, Koga A
    • Journal Title

      Genes & Genetic Systems

      Volume: 87 Pages: 181-190

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] In situ hybridization analysis of gibbon chromosomes suggests that amplification of alpha satellite DNA in the telomere region is confined to two of the four genera.2012

    • Author(s)
      Baicharoen S, Arsaithamkul V, Hirai Y, Hara T, Koga A, Hirai H
    • Journal Title

      Genome

      Volume: 55 Pages: 809-812

    • DOI

      10.1139/gen-2012-0123

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Age of the last common ancestor of extant Plasmodium parasite lineages.2012

    • Author(s)
      Hayakawa T, Tachibana S-I, Hikosaka K, Arisue N, Matsui A, Horii T, Tanabe K
    • Journal Title

      Gene

      Volume: 502 Pages: 36-39

    • DOI

      10.1016/j.gene.2012.04.037

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Possible genomic impact of SVA retrotransposon in humans similar to that in gibbons2012

    • Author(s)
      Hara T, Hirai Y, Hirai H, Koga A
    • Organizer
      Annulal Meeting of the American Society of Human Genetics
    • Place of Presentation
      San Francisco, CA, USA
    • Year and Date
      20121108-20121108
  • [Presentation] アジアに棲息するMacaca属霊長類におけるToll様受容体TLR9の種特異的な多様性形成2012

    • Author(s)
      安波道郎
    • Organizer
      第21回日本組織適合性学会大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20120915-20120917
  • [Presentation] SRV in macaques: Japanese macaques, long-tailed macaques and rhesus macaques2012

    • Author(s)
      Hirohisa Hirai
    • Organizer
      The 3rd International Symposium on Southeast Asian Primates
    • Place of Presentation
      Bangkok, Thaikand
    • Year and Date
      20120827-20120829
  • [Presentation] Molecular phylogeny and evolution of gibbons2012

    • Author(s)
      Matsui, A., Jahan, I., Islam, Md. A., Rahman, ZMM, Hirai, H.
    • Organizer
      The 3rd International Symposium on Southeast Asian Primates
    • Place of Presentation
      Bangkok, Thaikand
    • Year and Date
      20120827-20120829
  • [Presentation] 反復配列の増減を指標としたテナガザル科4属の系統関係推定の試み2012

    • Author(s)
      寺田祥子・平井百合子・平井啓久・古賀章彦
    • Organizer
      日本進化学会第14回大会
    • Place of Presentation
      八王子市
    • Year and Date
      20120821-20120821
  • [Presentation] テナガザルにみられるトランスポゾンのゲノムへの影響:セントロメアへのヘテロクロマチンの供給2012

    • Author(s)
      古賀章彦(京都大・霊長研),原暢(京都大・霊長研),Israt Jahan(京都大・霊長研),平井百合子(京都大・霊長研),平井啓久(京都大・霊長研)
    • Organizer
      第28回日本霊長類学会大会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      20120707-20120707
  • [Presentation] テナガザルの染色体端部にある大規模ヘテロクロマチンの主成分2012

    • Author(s)
      平井啓久(京都大・霊長研),原暢(京都大・霊長研),平井百合子(京都大・霊長研),古賀章彦(京都大・霊長研)
    • Organizer
      第28回日本霊長類学会大会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      20120707-20120707
  • [Presentation] テナガザルにみられるトランスポゾンのゲノムへの影響:新規因子の形 成と増幅2012

    • Author(s)
      原暢・古賀章彦・スダラ バイシャルン・平井百合子・平井啓久
    • Organizer
      第28回日本霊長類学会大会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      20120707-20120707
  • [Presentation] 霊長類の野外調査とゲノム研究2012

    • Author(s)
      平井啓久
    • Organizer
      京都大学品川セミナー
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20120406-20120406

URL: 

Published: 2014-07-24  

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