2013 Fiscal Year Annual Research Report
大規模ゲノム情報と自殖Ｆ２集団を利用したナシ育種の効率化と新規優良品種の育成
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24380022
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| Research Institution | Tottori University |
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Principal Investigator |
板井 章浩 鳥取大学, 農学部, 准教授 (10252876)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
児玉 基一朗 鳥取大学, 農学部, 教授 (00183343)
山本 俊哉 独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構, 果樹研究所, 上席研究員 (60355360)
村山 秀樹 山形大学, 農学部, 教授 (40230015)
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| Project Period (FY) |
2012-04-01 – 2016-03-31
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| Keywords | ナシ / ＳＳＲ / 単為結果 / 黒星病 / 連鎖地図 |
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| Research Abstract |
本研究は、ナシ自殖F2集団を材料にして、リンゴゲノム情報および次世代シーケンサーにより取得したニホンナシおよびセイヨウナシのＥＳＴおよびゲノム配列の大規模ゲノム情報を統合し、果実サイズ、単為結果、追熟性、などの有用形質に関するマーカー開発を行い、育種現場で実際に適用し、新品種開発に役立てることを目的として実験を行った。まず、‘おさ二十世紀’Ｘ‘マックスレッドバートレット’のＦ２集団においては、集団で適応可能なＳＳＲマーカーを選抜し，新たに200以上のＳＳＲマーカーが選抜された。これら200のマーカーは、17の染色体に偏ることなく存在しており、連鎖地図作成およびＱＴＬ解析に利用可能となっている。また新たに黒星病抵抗性および赤色果色集団育成の為に‘おさ二十世紀’Ｘ‘紅梨’のＦ2集団作成に取り組んだ。さらに、ニホンナシには単為結果性を持つ品種はほぼ見当たらないが、一方、セイヨウナシは植物ホルモンを処理しなくとも高い単為結果性を持つ品種が存在する。この単為結果性の機能解明と新品種育成の為のマーカー開発を目的とし実験を行った。ナシ果実単為結果処理において、次世代シークエンス解析を行い、単為結果関連の転写因子をコードする遺伝子を選抜し、単為結果性との関係を調査した。またニホンナシ及びセイヨウナシ品種より次世代シーケンサーを用いたＲＮＡ-seq解析からＥＳＴ-ＳＳＲおよび多数のＳＮＰを見いだし、マッピングした。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
単為結果に関する研究が進みつつあり、かつ選抜のマーカーの規模を拡張することができた。さらに新たに多数ＳＮＰなどのマーカーが得られ、より高密度な連鎖地図作成が可能になっており、これらは今後の研究に役立つと思われ概ね順調に進展している。
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| Strategy for Future Research Activity |
新たな集団を拡張するとともに、順調にすすんでいるマーカー開発については今後も精力的に進めて行く。単為結実性以外の形質についても，順次進めて行く予定である。
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| Expenditure Plans for the Next FY Research Funding |
分析に使用する液体クロマトグラフの既存検出器が壊れたため、新たに購入する必要が生じたが、今年度の予算では購入が出来ず、次年度と合わせて購入する必要が生じた為。
液体クロマトグラフ用ＥＣＤ検出器の購入（計169万円）
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