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2015 Fiscal Year Annual Research Report

細胞間RNA干渉伝播のメカニズムの解析

Research Project

Project/Area Number 24390053
Research InstitutionTokyo Women's Medical University

Principal Investigator

三谷 昌平  東京女子医科大学, 医学部, 教授 (90192757)

Project Period (FY) 2012-04-01 – 2016-03-31
Keywords線虫 / RNA干渉 / 小胞輸送
Outline of Annual Research Achievements

遺伝子機能は基本的にはゲノムDNAからmRNAへ転写され、その後、蛋白質へ翻訳されて機能分子となることで達成されている。近年の研究では、非コードRNAの存在が注目され、その典型的な例としてRNA干渉という現象が良く知られており、また、生命科学実験で多用されるに至っている。RNA干渉は、二本鎖RNAが細胞に入ると、同じ配列のmRNAを分解する現象である。線虫を用いた研究で発見されたが、その当初から特定の細胞で起こると細胞間を伝播し、別の細胞の同じ遺伝子のmRNAを分解することで全身性の作用に至ることが知られていた。これをsystemic RNAiと呼んでいる。線虫では、特に顕著であるが、哺乳類細胞でも類似の現象が観察されている。我々は、線虫を用いてsystemic RNAiに異常が起こる遺伝子のスクリーニングを行った。小胞輸送関連の分子の変異体にfeeding RNAiを行い、RNAiに抵抗性の変異体を見出した。スクリーニングに使用した変異体遺伝子としては、ctbp-1と呼ばれる遺伝子であったが、レスキュー実験を行った結果、実際の表現型を呈しているのは別の変異であることが疑われた。そこで、該当ストレインよりゲノムDNAを抽出し、Ion Torrentという次世代シーケンサーで変異体の全ゲノムシーケンス解析を行った。その結果、rsd-3と呼ばれる遺伝子に欠失が入っていることが分かった。rsd-3の欠失変異体の追加の欠失変異体で同一の表現型を呈したこと、スクリーニングに使用した株の分離後、ctbp-1変異には表現型がなく、rsd-3変異には表現型があったこと、rsd-3のトランスジェニックによりこの変異の表現型が回復したことから、原因遺伝子はrsd-3である。RSD-3の局在は、TGNおよびエンドソームであることなどを記載し、論文を投稿中である。

Research Progress Status

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Causes of Carryover

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Expenditure Plan for Carryover Budget

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Research Products

(18 results)

All 2016 2015 Other

All Int'l Joint Research Journal Article Presentation Remarks Funded Workshop

  • [Int'l Joint Research] University of Colorado, Boulder(米国)

    • Country Name
      米国
    • Counterpart Institution
      University of Colorado, Boulder
  • [Int'l Joint Research] Chinese Academy of Sciences(中国)

    • Country Name
      中国
    • Counterpart Institution
      Chinese Academy of Sciences
  • [Journal Article] Negative regulation of phosphatidylinositol 3-phosphate levels in early-to-late endosome conversion2016

    • Author(s)
      Liu K et al.
    • Journal Title

      J. Cell Biol.

      Volume: 212 Pages: 181-198

    • DOI

      10.1083/jcb.201506081

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Characterization of HAF-4- and HAF-9-localizing organelles as distinct organelles in Caenorhabditis elegans intestinal cells2016

    • Author(s)
      Tanji T et al.
    • Journal Title

      BMC Cell Biol.

      Volume: 17 Pages: 4

    • DOI

      10.1186/s12860-015-0076-2

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Curcumin improves tau-induced neuronal dysfunction of nematodes2016

    • Author(s)
      Miyasaka T et al.
    • Journal Title

      Neurobiol Aging

      Volume: 39 Pages: 69-81

    • DOI

      10.1016/j.neurobiolaging

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Locus-specific integration of extrachromosomal transgenes in C. elegans with the CRISPR/Cas9 system2016

    • Author(s)
      Yoshina et al.
    • Journal Title

      BBRep

      Volume: 5 Pages: 70-76

    • DOI

      10.1016/j.bbrep.2015.11.017

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Impaired NFKBIE Gene Function decreases Cellular Uptake of Methotrexate by Down-regulating SLC19A1 Expression in a Human Rheumatoid Arthritis Cell Line2016

    • Author(s)
      Imamura et al
    • Journal Title

      Modern Rheumatology

      Volume: in press Pages: 1-10

    • DOI

      10.3109/14397595.2015.1112481

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] One-step homozygosity in gene editing by an improved CRISPR/Cas9 system2016

    • Author(s)
      Zhao P et al
    • Journal Title

      Cell Res

      Volume: in press Pages: 1-4

    • DOI

      10.1038/cr.2016

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Systematic Validation of RNF213 Coding Variants in Japanese Patients With Moyamoya Disease.2015

    • Author(s)
      Moteki Y et al.
    • Journal Title

      J Am Heart Assoc.

      Volume: 4 Pages: e001862

    • DOI

      10.1161/JAHA.115.001862

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Loss of C. elegans GON-1, an ADAMTS9 Homolog, Decreases Secretion Resulting in Altered Lifespan and Dauer Formation.2015

    • Author(s)
      Yoshina S and Mitani S
    • Journal Title

      PLoS One

      Volume: 10 Pages: e133966

    • DOI

      10.1371/journal.pone

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Longevity Genes Revealed by Integrative Analysis of Isoform-Specific daf-16/FoxO Mutants of Caenorhabditis elegans2015

    • Author(s)
      Chen AT et al.
    • Journal Title

      Genetics

      Volume: 201 Pages: 613-629

    • DOI

      10.1534/genetics

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Analysis of the mechanism of type 2 diabetes involving ADAMTS9/GON-12015

    • Author(s)
      Yoshina S and Mitani S
    • Organizer
      FAOPS
    • Place of Presentation
      Bangkok, Thailand
    • Year and Date
      2015-11-22 – 2015-11-25
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Transcription factor lin-32 is essential for synaptogenesis in AIB interneuron, sustained neck muscle contraction and aversive behavior.2015

    • Author(s)
      Hori et al
    • Organizer
      International C. elegans meeting
    • Place of Presentation
      UCLA, Los Angels
    • Year and Date
      2015-06-24 – 2015-06-28
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Systematic revere genetics approach to identify the molecules related to choice of behaviors using Caenorhabditis elegans2015

    • Author(s)
      Suehiro et al
    • Organizer
      International C. elegans meeting
    • Place of Presentation
      UCLA, Los Angels
    • Year and Date
      2015-06-24 – 2015-06-28
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Risk of gene deletion in worms with impaired DNA repair machinery.2015

    • Author(s)
      Suehiro et al
    • Organizer
      International C. elegans meeting
    • Place of Presentation
      UCLA, Los Angels
    • Year and Date
      2015-06-24 – 2015-06-28
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] 東京女子医科大学研究業績DB 三谷昌平

    • URL

      http://gyoseki.twmu.ac.jp/twmhp/KgApp?kyoinId=ymkbygoeggy

  • [Funded Workshop] FAOPS20152015

    • Place of Presentation
      Bangkok, Thailand
    • Year and Date
      2015-11-22 – 2015-11-25
  • [Funded Workshop] International C. elegans meeting2015

    • Place of Presentation
      UCLA, Los Angels, USA
    • Year and Date
      2015-06-24 – 2015-06-28

URL: 

Published: 2017-01-06  

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