2013 Fiscal Year Research-status Report
肥満関連遺伝子および糖尿病関連遺伝子と大腸腺腫との関連を検討する分子疫学研究
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24590830
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Research Institution | National Center of Neurology and Psychiatry |
Principal Investigator |
山地 太樹 独立行政法人国立がん研究センター, がん予防・検診研究センター, 室長 (10466203)
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Keywords | 大腸腺腫 / 糖尿病関連遺伝子 / ハプロタイプ |
Research Abstract |
平成25年度は、申請した研究計画に則り、糖尿病関連遺伝子TCF7L2 およびKCNQ1の詳細な検討を行った。糖尿病関連遺伝子TCF7L2 は、10番染色体のq25.2-q25.3上に存在する大きさ約220 kbpの遺伝子である。GWASカタログによれば、2013年末時点で糖尿病に関連する表現型との相関が報告されているTag SNPはTCF7L2遺伝子上に4つ(rs12243326, rs4506565, rs7901695, rs7903146)あり、このうち複数の研究で確認されているのは2つのTag SNP(rs4506565, rs7903146)であった。また、GWASカタログに掲載されている4つのTag SNPは、TCF7L2遺伝子の概ね114,740 kbpから114,780 kbpの範囲にまとまって存在していた。ハプロタイプ解析を行ったところ、4つのTag SNPがブロック1(rs4506565, rs7901695, rs7903146)、ブロック2(rs12243326)に分類されることが分かった。糖尿病関連遺伝子KCNQ1 は、11番染色体のp15.5上に存在する大きさ約400 kbpの遺伝子である。GWASカタログによれば、2013年末時点で糖尿病に関連する表現型との相関が報告されているTag SNPはKCNQ1遺伝子上に4(rs163182, rs2237892, rs2237895, rs2237897)あり、このうち複数の研究で確認されているのは1つのTag SNP(rs2237892)であった。また、GWASカタログに掲載されている4つのTag SNPは、KCNQ1遺伝子の概ね2,796 kbpから2,816 kbpの範囲にまとまって存在していた。ハプロタイプ解析を行ったところ、4つのTag SNPが同じブロックに存在することが分かった。同じブロックに存在するTag SNPから得られる遺伝的情報はほぼ同一であるので、大腸腺腫との関連解析を行うにあたり、TCF7L2遺伝子から2つのTag SNP(rs7903146, rs12243326)、KCNQ1遺伝子から1つのTag SNP(rs2237892)を選択することとした。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
肥満関連遺伝子FTO と糖尿病関連遺伝子TCF7L2 およびKCNQ1 のTag SNP選択が終了し、遺伝子多型解析を開始するまでに至っている。
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Strategy for Future Research Activity |
肥満関連遺伝子FTO と糖尿病関連遺伝子TCF7L2 およびKCNQ1 の遺伝子多型解析が終了後、大腸腺腫との関連解析を行う計画である。
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Expenditure Plans for the Next FY Research Funding |
遺伝子多型解析を行う器材・試薬等の使用期限を考慮し、一部の購入を平成26年度に分けて行った方が望ましいと判断したため。 平成26年度に購入するのが望ましいと判断した器材・試薬等を調達し、計画通り遺伝子多型解析を行う。
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Research Products
(1 results)