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2013 Fiscal Year Annual Research Report

超小型人工ペプチダーゼドメインの創成

Research Project

Project/Area Number 24655146
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

後藤 佑樹  東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 助教 (70570604)

Keywordsペプチド / 人工酵素 / 試験管内分子進化
Research Abstract

本研究では、純科学的・工学的、両方の観点から高い意義を持つ、自己切断型の新規人工ペプチダーゼ(プロテアーゼ)の創成を目指している。これまでに、人工の新規プロテアーゼドメインをde novoに作成する試みは多くなされているものの、成功した事例は全く存在しない。本研究では、ランダムペプチドライブラリーから自己切断活性を持つ配列を試験管内で人工進化させる、潜在的に切断さ れやすいことが期待されるCys-Pro配列を活用する、といった独自の工夫を施すことで、新規人工触媒ドメインの発見が可能であると考えた。
本研究で創成を目指すペプチダーゼは、以下の特筆すべき特色を併せ持つ。(1)ペプチド切断活性に必要なドメインの全長が、20-40残基程度の「超小型人工ペプチダーゼ」である、(2)自身のN末端側を切断するcis活性型である、(3)触媒ドメインのN末端に位置するCys-Proの前で正確に切断され、切断産物の末端構造が均一である、(4)特定の外部刺激(pH変化・金属イオンの添加)により、その切断活性のON/OFFを制御できる。本研究が完成すれば、「天然由来の配列に頼らず、人工のペプチダーゼをde novoに創成できうるか?」、「安定なアミド結合の切断を、どれだけ小さなドメインで行うことができるか?」といった命題に知見を与えられることから、学術的な意義は非常に高い。また、工学的な応用の面からは、組換えタンパク質の精製への応用が期待される。
当該年度においては、前年度に最適化した試験管内分子進化の系を用いて、20-40残基程度の短いランダムペプチドライブラリーの中から目的のペプチド切断活性を有する配列の探索実験を行った。最終的に22種類の超小型人工ペプチダーゼ候補の同定に成功した。

  • Research Products

    (5 results)

All 2014 2013

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (3 results) (of which Invited: 2 results)

  • [Journal Article] Selection-Based Discovery of Druglike Macrocyclic Peptides.2014

    • Author(s)
      Passioura T, Katoh T, Goto Y, Suga H.
    • Journal Title

      Annu Rev Biochem.

      Volume: in press Pages: in press

  • [Journal Article] Nonstandard peptide expression under the genetic code consisting of reprogrammed dual sense codons.2013

    • Author(s)
      Goto Y, Iseki M, Hitomi A, Murakami H, Suga H.
    • Journal Title

      ACS Chem Biol.

      Volume: 8 Pages: 2630-4

    • DOI

      doi: 10.1021/cb400549p.

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 改変翻訳反応を用いた特殊環状ペプチドの合成2014

    • Author(s)
      後藤佑樹・山岸祐介・加藤敬行・菅裕明
    • Organizer
      日本化学会第94春季年会
    • Place of Presentation
      愛知県名古屋市
    • Year and Date
      20140327-20140330
    • Invited
  • [Presentation] 人工環状ペプチドは核内増殖抗原PCNAを細胞内で阻害する2014

    • Author(s)
      村上直央、後藤佑樹、加藤敬行、Kun Yang、William Bozza、Zhihao Zhuang、菅裕明
    • Organizer
      第16回生命化学研究会
    • Place of Presentation
      静岡県熱海市
    • Year and Date
      20140109-20140110
  • [Presentation] 人工生合成系による特殊ペプチドの合成2013

    • Author(s)
      後藤 佑樹
    • Organizer
      第45回若手ペプチド夏の勉強会
    • Place of Presentation
      東京都八王子市
    • Year and Date
      20130728-20130730
    • Invited

URL: 

Published: 2015-05-28  

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