• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2013 Fiscal Year Annual Research Report

細胞と組織の関係を明らかにする新規数理モデルの開発

Research Project

Project/Area Number 24657145
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

石原 秀至  東京大学, 総合文化研究科, 助教 (10401217)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 杉村 薫  京都大学, 物質-細胞統合システム拠点(iCeMS), 助教 (50466033)
Keywords組織力学 / ベイズ推定 / 発生学 / 国際情報交換 フランス
Research Abstract

個体発生中に起こる組織の変形の背後にある力学過程を、これまで我々が開発してきたベイズを用いた力推定法を用いて、主にショウジョウバエの翅等の上皮系に用いて調べてきた。まず、推定手法についてその確度の検証や実験との比較、手法間の比較などについて行い、また、翅細胞の六角格子への配置メカニズムを、数値シミュレーションや、ミオシン分布との比較を行った上で同定し、論文として発表した。石原と杉村で、翅、背板、成虫原基、初期胚体軸伸張期のデータを取得し、それぞれのシステムに特徴的な変形のタイムスケールや異方性について、力の推定を行い、力学特性の違いを明らかにしている。対応するシミュレーションを行い、論文にまとめる予定である。
一方で、細胞形態内部自由度を取り込んだ連続体の定式化を試みたが、仏パリ第7大学とCurie研グループの同テーマの論文発表があり、研究方針の変更を余儀なくされた。現在、そのグループと密な連携をとりながら、我々の力推定手法と組み合わせ、ショウジョウバエの翅と背板について広視野大規模データを取得し、個々の細胞レベルのダイナミクスとそこから現れるマクロスケールの変形の関係のシステマティックな解析を進めている。翅は石原と杉村(研究分担者)が、背板はCurie研のBellaiche博士らが行っている。また、同グループと連携し、推定手法の拡張として、細胞膜の曲率を考慮する事で推定精度を改良する事や、培養細胞のモノレイヤー中での細胞の力の推定手法も検討している。前者については、ショウジョウバエ個眼ommatidiaを対象に、実データの解析を進めている。

  • Research Products

    (8 results)

All 2014 2013

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (4 results) (of which Invited: 3 results)

  • [Journal Article] The mechanical anisotropy in a tissue promotes ordering in hexagonal cell packing2013

    • Author(s)
      K. Sugimura and S. Ishihara
    • Journal Title

      Development

      Volume: 140 Pages: 4091-4101

    • DOI

      10.1242/dev.094060

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Comparative study of non-invasive force and stress inference in tissue2013

    • Author(s)
      S. Ishihara, K. Sugimura, S.J. Cox, I. Bonnet, Y. Bellaïche and F. Graner
    • Journal Title

      Eur. Phys. J. E

      Volume: 36 Pages: 45

    • DOI

      10.1140/epje/i2013-13045-8

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Robustness of force and stress inference in an epithelial tissue.2013

    • Author(s)
      K. Sugimura, Y. Bellaïche, F. Graner, P. Marcq, and S. Ishihara.
    • Journal Title

      IEEE Eng Med Biol Soc 2013

      Volume: 2013 Pages: 2712-2715

    • DOI

      10.1109/EMBC.2013.6610100.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 細胞のかたちから推定する“力”の場2013

    • Author(s)
      石原秀至, 杉村薫
    • Journal Title

      実験医学

      Volume: 31 Pages: 1232-1238

  • [Presentation] Bayesian inference of forces in epithelial tissues2014

    • Author(s)
      石原秀至
    • Organizer
      Workshop on Mechanics and Growth of Tissues: Development and Cancer:
    • Place of Presentation
      Curie 研究所. (フランス、パリ)
    • Year and Date
      20140113-20140116
  • [Presentation] Bayesian inference of force dynamics during morphogenesis2013

    • Author(s)
      石原秀至
    • Organizer
      Seminar at Paris 7 University
    • Place of Presentation
      パリ第7大学(フランス、パリ)
    • Year and Date
      20130904-20130904
    • Invited
  • [Presentation] Mechanical control of hexagonal cell packing in Drosophila wing2013

    • Author(s)
      石原秀至
    • Organizer
      東大物性研セミナー
    • Place of Presentation
      東京大学物性研セミナー(千葉県柏市)
    • Year and Date
      20130514-20130514
    • Invited
  • [Presentation] 形態形成の力学制御2013

    • Author(s)
      石原秀至,杉村薫
    • Organizer
      京都駅前セミナー
    • Place of Presentation
      京都キャンパスプラザ(京都市下京区)
    • Year and Date
      2013-05-17
    • Invited

URL: 

Published: 2015-05-28  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi