2015 Fiscal Year Annual Research Report
ワークスティーリングを用いた分散並列環境における遺伝子制御ネットワーク推定手法
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24700295
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| Research Institution | Institute of Physical and Chemical Research |
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Principal Investigator |
木戸 善之 国立研究開発法人理化学研究所, 生命システム研究センター, 客員研究員 (70506310)
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| Project Period (FY) |
2012-04-01 – 2016-03-31
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| Keywords | 分散コンピューティング / 遺伝子発現ネットワーク推定 / ジョブスケジューラ / 可視化 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究は，遺伝子発現プロファイルによる大規模な遺伝子制御ネットワーク推定のための分散並列手法ならびにその周辺技術の研究開発を行ってきた．平成27年度では前年度までに開発したスケジューラフレームワークならびにプロトタイプスケジューラの改良および，大規模な遺伝子制御ネットワーク推定の結果を出力するため，可視化アプリケーションの開発を行い，国際会議にて報告を行い，本研究の一部の成果について論文にまとめた．またネットワーク解析には遺伝子のアノテーション情報も必要とされ，課題から派生した遺伝子制御ネットワーク解析に関連するメタデータ／オントロジー構築についても一部成果として報告を行った．
[1] A High Resolution Graph Viewer for Multi-monitor Visualization Environment, Ryoichi Jingai, Yoshiyuki Kido, Susumu Date, Shinji Shimojo, The Review of Socionetwork Strategies，Volume 9, Issue 1, pp.19-27, Jun. 2015
[2] An Ontology-Based Model Search Extended to Deal with Accessibility Issues of Neuroinformatics Metadata with Multidirectional Attributes , Yoshiyuki ASAI, Yoshiyuki KIDO, Kyota KAMIYOSHI, Taishin NOMURA, Hiroaki WAGATSUMA , INCF Japan Node International Workshop: Advances in Neuroinformatics 2015, Nov. 2015.
[3] Improvement of Scalability in Sharing Visualization Contents for Heterogeneous Display Environments, Arata Endo, Yoshiyuki Kido, Susumu Date, Yasuhiro Watashiba, Kiyoshi Kiyokawa, Haruo Takemura, Shinji Shimojo，International Symposium on Grids & Clouds 2016 (ISGC2016), May 2016.
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