2014 Fiscal Year Research-status Report
時空間変動遺伝子の網羅的解析：ゲノム解読から個体群動態まで
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24770014
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| Research Institution | Nihon University |
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Principal Investigator |
森長 真一 日本大学, 生物資源科学部, 助教 (80568262)
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| Project Period (FY) |
2012-04-01 – 2016-03-31
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| Keywords | ゲノム / 植物標本 / 適応遺伝子 / シロイヌナズナ近縁種 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
シロイヌナズナ属野生植物のハクサンハタザオ・イブキハタザオを対象に、現生個体と博物館由来の標本個体のゲノム比較から、時空間変動遺伝子を網羅的に解析することを試みた。
昨年度までにおこなった滋賀県伊吹山および三重県藤原岳のハクサンハタザオ・イブキハタザオに加え、大阪府箕面のハクサンハタザオを対象に次世代シーケンサーイルミナHiseq2000を用いた全ゲノム解析をおこなった。そして、これまで通り、大阪府箕面でも1900年代前期・中期・後期および現在の４時点での解析を行い、時間的に変動している遺伝子を網羅的に探索した。
その結果、これまでの解析集団とは異なり、時間的に変動している遺伝子がほとんど見られなかった。もっとも変動していたのは、酸化酵素遺伝子の一種であり、この遺伝子は滋賀県伊吹山および三重県藤原岳の集団では見られず、集団が異なると時間的に変動する遺伝子の種類や数も大きく異なることが明らかとなった。このことから、大阪府箕面では、これまで解析した２集団と比較して、空間的な環境変異や時間的な環境変化が緩やかであった可能性が考えられる。一方の滋賀県伊吹山および三重県藤原岳では、環境の異なる隣接した集団間での遺伝子流動やこの100年の環境変化が、対立遺伝子頻度の変動に寄与していたかもしれない。これらの結果は野生植物集団における短期的な進化が集団ごとに大きく異なることを示唆している。今後はさらに解析集団を増やして、これらの傾向の一般性について検証する。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
今年度は、昨年度に加えてさらに複数の集団を対象に解析をおこなう予定であったが、天候不順などにより野外調査を十分におこなえず、その結果としてゲノム解析も十分におこなうことができなかった。
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| Strategy for Future Research Activity |
さらに解析集団を追加することにより、これまでに明らかになっている時空間変動遺伝子をより多くの集団で比較する。加えて、環境変化に対する進化的応答について考察する。
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| Causes of Carryover |
天候不順などにより野外調査を十分におこなえず、その結果として予定していたゲノム解析を十分におこなうことができなかったため。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
ゲノム解析のための実験試薬費とそのデータ解析に伴う消耗品費、また野外調査および成果発表のための旅費等に使用する。
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