• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2015 Fiscal Year Annual Research Report

ABCトランスポーターの多剤認識排出メカニズムの解明と新規阻害剤の開発

Research Project

Project/Area Number 25251006
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

加藤 博章  京都大学, 薬学研究科(研究院), 教授 (90204487)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 渡辺 文太  京都大学, 化学研究所, 助教 (10544637)
中津 亨  京都大学, 薬学研究科(研究院), 准教授 (50293949)
Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
Keywords生体膜 / 構造機能相関 / 受容体 / X線結晶構造解析
Outline of Annual Research Achievements

1.ABCトランスポーターの多剤認識メカニズムの解明:ドッキングシミュレーションを用いることにより、基質の結合部位と輸送経路を探索したところ、内向型構造のトランスポーターに侵入した基質は分子中央の基質結合部位へと至り、トランスポーターの内向型状態から外向型状態への構造変化に伴い、基質結合部位の上部に開いた細胞外側への出口から外へ排出されようとすることが見いだされた。
2.ABCトランスポーターの基質排出輸送の仕組みの解明:内向型状態の立体構造を安定化しているアミノ酸残基を改変することにより、相対的に外向型状態への構造変化を促進したことで得られた結晶を用いてX線結晶構造解析を実施した。その結果、期待通り外向型状態の結晶構造の決定に成功した。また、同じ変異型を用いて内向型状態の結晶化にも成功し、その結晶構造も決定できた。これは、同一分子の基質排出型ABCトランスポーターにおいて内向型と外向型両状態の結晶構造を解析した世界初の例である。
3.ABCトランスポーターのメカニズムに基づいた新規阻害剤の設計と合成:野生型CmABCB1に分子の外側から特異的に結合する新規阻害剤が、外向型状態を取りやすい変異型にも結合するかどうかを検討した。その結果、その変異型への結合力は大きく低下しており、その阻害剤は、内向型状態の構造が安定に存在していることで強力に結合するメカニズムであることが判明した。一方、基質ローダミンの誘導体を合成し構造活性相関を実施した。その結果、当該トランスポーターによって輸送されなくなった化合物が得られた。今後、その化合物がアンタゴニストかどうかを検討することにより、多剤排出メカニズムの一端が明らかになると期待される。

Research Progress Status

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

27年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (10 results)

All 2016 2015

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 4 results) Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results)

  • [Journal Article] 受容体とトランスポーターの構造薬理学2016

    • Author(s)
      清水敏之、加藤博章
    • Journal Title

      薬学雑誌

      Volume: 136 Pages: 171 - 172

    • DOI

      10.1248/yakushi.15-00229-F

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Motion Tree Delineates Hierarchical Structure of Protein Dynamics Observed in Molecular Dynamics Simulation2015

    • Author(s)
      Moritsugu Kei, Koike Ryotaro, Yamada Kouki, Kato Hiroaki, Kidera Akinori
    • Journal Title

      PLoS One

      Volume: 10 Pages: e0131583

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0131583

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Structure-Activity Relationship Studies of Insect and Plant Steroid Hormones2015

    • Author(s)
      Watanabe, B.
    • Journal Title

      J. Pestic. Sci.

      Volume: 40 Pages: 146 - 151

    • DOI

      10.1584/jpestics.J15-04

    • Open Access
  • [Journal Article] Stereospecific Inhibitory Effects of CCG-1423 on the Cellular Events Mediated by Myocardin-Related Transcription Factor A2015

    • Author(s)
      Watanabe, B.; Minami, S.; Ishida, H.; Yoshioka, R.; Nakagawa, Y.; Morita, T.; Hayashi, K.
    • Journal Title

      PLoS One

      Volume: 10 Pages: e0136242

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0136242

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Synthesis and Inhibitory Activity of Substrate-Analog Fructosyl Peptide Oxidase Inhibitors2015

    • Author(s)
      Watanabe, B.; Ichiyanagi, A.; Hirokawa, K.; Gomi, K.; Nakatsu, T.; Kato, H.; Kajiyama, N.
    • Journal Title

      Bioorg. Med. Chem. Lett.

      Volume: 25 Pages: 3910 - 3913

    • DOI

      10.1016/j.bmcl.2015.07.045

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] グルタチオン代謝とチオールケミストリー2015

    • Author(s)
      渡辺文太;平竹潤
    • Journal Title

      化学と生物

      Volume: 53 Pages: 354 - 361

  • [Presentation] Serial Femtosecond Crystallography of ABC Transporter2016

    • Author(s)
      Oyama Ryo, Pan Dongqing, Nakatsu Toru, Sato Tomomi, Yamaguchi Tomohiro, Kodan Atsushi, Ueda Kazumitsu, Iwata So, Kato Hiroaki
    • Organizer
      6th Special Meeting, ATP-Binding Cassette (ABC) Proteins: From Multidrug Resistance to Genetic Diseases
    • Place of Presentation
      Innsbruck (Austria)
    • Year and Date
      2016-03-05 – 2016-03-11
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Crystallographic study of the ABC transporter CmABCB1 covalently bound to substrate derivatives2016

    • Author(s)
      Matsuoka Keita, Hirokane Ryo, Kodan Atsushi, Yamaguchi Tomohiro, Nakatsu Toru, Ueda Kazumitsu, Kato Hiroaki
    • Organizer
      6th Special Meeting, ATP-Binding Cassette (ABC) Proteins: From Multidrug Resistance to Genetic Diseases
    • Place of Presentation
      Innsbruck (Austria)
    • Year and Date
      2016-03-05 – 2016-03-11
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Altering stability of a transmembrane protein, MsbA by structural comparison with its thermophilic homolog2015

    • Author(s)
      Ka Lu, Yamaguchi Tomohiro, Nakatsu Toru, Kato Hiroaki
    • Organizer
      The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies 2015
    • Place of Presentation
      Honolulu, Hawaii (USA)
    • Year and Date
      2015-12-15 – 2015-12-20
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] NMR解析を目指したABCトランスポーターの大腸菌高密度培養による安定同位体標識系の確立2015

    • Author(s)
      小田健人、山口知宏、宮ノ入洋平、中津 亨、甲斐荘正恒、加藤博章
    • Organizer
      日本薬学会近畿支部総会・大会
    • Place of Presentation
      大阪大谷大学(大阪府富田林市)
    • Year and Date
      2015-10-17 – 2015-10-17

URL: 

Published: 2017-01-06  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi