2017 Fiscal Year Annual Research Report
Analysis of the relationship between Jomon and immigrant Yayoi people using whole genome sequencing data
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25251043
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| Research Institution | National Museum of Nature and Science, Tokyo |
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Principal Investigator |
篠田 謙一 独立行政法人国立科学博物館, その他部局等, 研究調整役 (30131923)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
井ノ上 逸朗 国立遺伝学研究所, 総合遺伝研究系, 教授 (00192500)
飯塚 勝 福岡女子大学, 国際文理学部, 学術研究員 (20202830)
斎藤 成也 国立遺伝学研究所, 集団遺伝研究系, 教授 (30192587)
富崎 松代 奈良女子大学, その他部局等, 名誉教授 (50093977)
安達 登 山梨大学, 大学院総合研究部, 教授 (60282125)
神澤 秀明 独立行政法人国立科学博物館, 人類研究部, 研究員 (80734912)
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| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2018-03-31
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| Keywords | 古代ゲノム解析 / ハプログループ / 縄文人 / 核ゲノム / 渡来系弥生人 / ミトコンドリアDNA |
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| Outline of Annual Research Achievements |
平成29年度は，特に弥生人のゲノム解析を中心に解析を進めた。北部九州の渡来系弥生人である福岡県那珂川町にある安徳台遺跡から出土した人骨からDNAを抽出し，次世代シークエンサを用いたゲノムの解析を行った。その結果，渡来系弥生人のSNPは現代日本人の範疇に入ることが示された。解析した個体は弥生時代中期のものではあったが，縄文人のゲノムが１割ほど含まれていることが判明し，渡来系弥生人は既に在来の縄文人と混血していることが示唆された。また，縄文人の直系と考えられていた西北九州弥生人もSNP解析によって，相当程度の渡来系弥生人のゲノムを受け継いでいることも明らかになった。更に，東北の弥生人であるアバクチ洞窟出土の幼児骨からもDNAを抽出し，全ゲノム解析を行ったが，この個体の持つゲノムは，東北の縄文人の範疇に入っていた。弥生時代には，様々な遺伝的なバックグラウンドを持った集団が，列島の内部に混在していたことになり，このことは従来の弥生人観を訂正する必要があることを示している。
縄文人に関しても，過去４年間と同様に全国各地から出土した人骨からDNA抽出と次世代シークエンサを用いた解析を継続した。北海道の礼文島の船泊遺跡出土縄文人では，現代人と同じ精度で全ゲノムを決定しており，SNP解析によってその系統的な位置と共に，様々な表現型に関する情報を取得した。一方、これまでの解析で縄文人のミトコンドリアDNAの系統では、西日本のものがより現代に伝わっていることが明らかになっている。これは渡来系弥生人が九州の縄文人と混血し，数を増やしながら東進して，関東・東北に到達したときには在来集団を人口で圧倒していたと考えると説明が付く。収集したデータをもとに，その状況をシミュレーションする数学モデルを構築した。いくつかのパラメータを変えて計算した結果，渡来系集団の人口が数十倍であったという結論を得た。
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| Research Progress Status |
29年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
29年度が最終年度であるため、記入しない。
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Research Products
(10 results)
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[Journal Article] Discerning the Origins of the Negritos, First Sundaland People: Deep Divergence and Archaic Admixture.2017
Author(s)
Jinam T. A., Phipps M. E., Aghakhanian F., Majumder P. P., Datar F., Stoneking M., Sawai H., Nishida N., Tokunaga K., Kawamura S., Omoto K., and Saitou N.
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Journal Title
Genome Biology and Evolution
Volume: 9
Pages: 2013-2022
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Comprehensive genetic exploration of selective tooth agenesis of mandibular incisors by exome sequencing.2017
Author(s)
Yamaguchi T, Hosomichi K, Yano K, Kim YI, Nakaoka H, Kimura R, Otsuka H, Nonaka N, Haga S, Takahashi M, Shirota T, Kikkawa Y, Yamada A, Kamijo R, Park SB, Nakamura M, Maki K, Inoue I.
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Journal Title
Hum Genome Var.
Volume: 4
Pages: -
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Rapid and cost effective high-throughput sequencing for identification of germline mutations of BRCA1 and BRCA2.2017
Author(s)
Ahmadloo S, Nakaoka H, Hayano T, Hosomichi K, You H, Utsuno E, Sangai T, Nishimura M, Matsushita K, Hata A, Nomura F, Inoue I.
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Journal Title
J Hum Genet
Volume: 62
Pages: 561-567
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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