2015 Fiscal Year Annual Research Report
文字列集合からの逐次データ同化によるインフルエンザウイルスの抗原変異予測
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25280080
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| Research Institution | Hokkaido University |
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Principal Investigator |
伊藤 公人 北海道大学, 人獣共通感染症リサーチセンター, 教授 (60396314)
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| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2016-03-31
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| Keywords | インフルエンザ / ワクチン / データ同化 / 変異予測 / ベイズ推定 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究では，インフルエンザに対するワクチンを先回りして準備するために，人の集団免疫と感染およびウイルスの遺伝子変異の過程の状態空間モデルを構築し，文字列の集合に対する逐次データ同化により，ウイルス遺伝子配列の実データから，近い将来におこるウイルス遺伝子上の変異を予測する手法を開発することを目的とする。
(1) 理論生物学のQuasi-species理論と感染症数理疫学の感染症流行モデルを融合し，これらを統一的に扱う数理モデルを構築した。
(2) 非線形状態空間モデルに基づき、感染・免疫・変異のシミュレーションシステムを実装した。
(3) 観測されるウイルスの塩基配列から集団遺伝学的手法を用いて，人および自然宿主におけるインフルエン
(4) 観測されるウイルスの塩基配列の文字列統計量から，疫学的パラメータをベイズ推定する手法を考案，実装した。
(5) 上記(4)の手法を用いて，パンデミック時のインフルエンザウイルスの疫学的パラメータを推定した。
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| Research Progress Status |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Causes of Carryover |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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Research Products
(8 results)
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[Journal Article] Seroepidemiological Prevalence of Multiple Species of Filoviruses in Fruit Bats (Eidolon helvum) Migrating in Africa2015
Author(s)
Ogawa H, Miyamoto H, Nakayama E, Yoshida R, Nakamura I, Sawa H, Ishii A, Thomas Y, Nakagawa E, Matsuno K, Kajihara M, Maruyama J, Nao N, Muramatsu M, Kuroda M, Simulundu E, Changula K, Hang'ombe B, Namangala B, Nambota A, Katampi J, Igarashi M, Ito K, Feldmann H, Sugimoto C, Moonga L, Mweene A, Takada A
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Journal Title
J Infect Dis
Volume: 212 Suppl 2
Pages: S101-108
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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