Genetic diversity analyses of mangroves for their conservation and reforestation on five major component groups

2016 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 25290080
• Research Institution: University of the Ryukyus
• Principal Investigator: 梶田 忠 琉球大学, 熱帯生物圏研究センター, 教授 (80301117)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 高山 浩司 ふじのくに地球環境史ミュージアム, その他部局等, 准教授 (60647478)
• Project Period (FY): 2013-04-01 – 2017-03-31
• Keywords: 保全遺伝学 / マングローブ / 系統地理学 / 広域分布種

Outline of Annual Research Achievements

■概要: H28年度は本研究課題の最終年度であった。出版計画にはやや遅れが見られるが、交付申請書に記述した研究計画に従って、概ね順調に進んだ。H28年度の遺伝子解析実験については、次世代シーケンシング技術用いる方法を主に用いた。
■研究組織: 研究代表者の梶田と分担者の高山は、海外共同研究者の協力を受けて、対象とする5群の植物の研究計画全般を推進した。海外からは、広西大学のAlison Wee KimShan博士、ブラジルUNESP大のGusutavo Mori博士、メキシコ自治大学のJuan Nunez Farfan博士らとの共同研究をさらに強化した。10月には国際ワークショップを開催し、上記3名の他に中山大学のShi Suhua博士、および、国内の主要研究者を招き、本研究課題の今後の発展の方向性について協議した。
■実施内容:Sonneratia属、Xylocarpus属、Bruguiera属、Acrostichum属について、葉緑体DNA、核のSSR解析で得られたデータを解析し、論文作成した。年度内の出版までには至らなかった。7月にはマングローブに関する最大の国際学会であるMMM4において、本事業に関する研究発表を行った。10月からは琉球大学の経費で広西大学のAlison Wee Kim Shanが3ヶ月間招聘され、研究代表者のもとで本事業の研究と論文作成を担当した。Rhizophora属の核のローコピー遺伝子を用いた解析、Sonneratia属、Xylocarpus属、また、これらに関連して同様の分布パターンを持つVigna属の解析についての結果を論文を作成した。昨年度から開始した、次世代シーケンシング技術を用いた実験とデータ解析をさらに進めた。

Research Progress Status

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Causes of Carryover

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Expenditure Plan for Carryover Budget

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Research Products

• [Int'l Joint Research] Guanxi University/San Yatsen University(中国)
  • Country Name: CHINA
  • Counterpart Institution: Guanxi University/San Yatsen University
• [Int'l Joint Research] UNESP/UNICAMP(ブラジル)
  • Country Name: BRAZIL
  • Counterpart Institution: UNESP/UNICAMP
• [Int'l Joint Research] UNAM(メキシコ)
  • Country Name: MEXICO
  • Counterpart Institution: UNAM
• [Int'l Joint Research] Universiti Malaysia Sabah/Universiti Putra Malaysia(マレーシア)
  • Country Name: MALAYSIA
  • Counterpart Institution: Universiti Malaysia Sabah/Universiti Putra Malaysia
• [Int'l Joint Research] National University of Singapore(シンガポール)
  • Country Name: SINGAPORE
  • Counterpart Institution: National University of Singapore
• [Int'l Joint Research]
  • # of Other Countries: 3
• [Journal Article] Development and characterization of 27 microsatellite markers for the mangrove fern, Acrostichum aureum (Pteridaceae) (2016)
  • Author(s): Takashi Yamamoto, Yoshiaki Tsuda, Gustavo Maruyama Mori, Mariana Vargas Cruz, Yoshimi Shinmura, Alison K. S. Wee, Koji Takayama, Takeshi Asakawa, Takeru Yamakawa, Monicad Suleiman, Juan Nunez-Farfan, Edward L. Webb, Yasuyuki Watano and Tadashi Kajita
  • Journal Title: Applications in Plant Sciences Volume: 4 Pages: 1600042
  • DOI: 10.3732/apps.1600042.
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Bruguiera hainesii , a critically endangered mangrove species, is a hybrid between B. cylindrica and B. gymnorhiza (Rhizophoraceae) (2016)
  • Author(s): Ono J., Yong J.W.H., Takayama K., Saleh M.H., Wee A.K.S., Asakawa T., Yllano O.B., Salmo S.G. III., Suleiman M., Tung N.X., Soe K.K., Meenakshisundaram S.H., Watano Y., Webb E.L., Kajita T.
  • Journal Title: Conservation Genetyics Volume: 17 Pages: 1137-1144
  • DOI: 10.1007/s10592-016-0849-y
  • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
• [Presentation] 汎熱帯海流散布植物ハマアズキの個体群動態解 (2017)
  • Author(s): 山本崇・津田吉晃・高山浩司・永嶋礼子・立石庸一・梶田忠
  • Organizer: 日本植物分類学会第16回大会
  • Place of Presentation: 京都大学吉田キャンパス（京都府・京都市）
  • Year and Date: 2017-03-09 – 2017-03-12
• [Presentation] Tadashi Kajita, Koji Takayama, Gustavo Maruyama Mori,, Alison Kim Shan Wee, Junya Ono and Takashi Yamamoto (2016)
  • Author(s): TOWARD THE CONSERVATION GENETICS OF MANGROVES ON A GLOBAL SCALE
  • Organizer: MMM4, Mangrove & Macrobenthos Meeting
  • Place of Presentation: Flagler College, St. Augustine, Florida, USA
  • Year and Date: 2016-07-18 – 2016-07-22
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] MANGROVES IN A CHANGING WORLD: FROM POPULATION GENETICS TO ECOLOGICAL GENOMICS (2016)
  • Author(s): Alison K.S. Wee, Kunfang Cao, Tadashi Kajita, Edward L. Webb
  • Organizer: MMM4, Mangrove & Macrobenthos Meeting
  • Place of Presentation: Flagler College, St. Augustine, Florida, USA
  • Year and Date: 2016-07-18 – 2016-07-22
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] GENETIC STRUCTURE AND POPULATION DEMOGRAPHY OF WIDESPREAD SEA- DISPERSAL PLANTS VIGNA MARINA IN THE PACIFIC (2016)
  • Author(s): Takashi Yamamoto, Yoshiaki Tsuda, Koji Takayama, Reiko Nagashima, Yoichi Tateishi and Tadashi Kajita
  • Organizer: MMM4, Mangrove & Macrobenthos Meeting
  • Place of Presentation: Flagler College, St. Augustine, Florida, USA
  • Year and Date: 2016-07-18 – 2016-07-22
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] WESTERN MANGROVE SPECIES IN FACE OF PAST AND CURRENT CLIMATE CHANGES: A MULTI-DISCIPLINARY APPROACH (2016)
  • Author(s): Gustavo Maruyama Mori, Mariana Vargas, Stephanie Karenina Bajay, Koji Takayama, Yu Matsuki, Rafael Silva Oliveira, Yoshihisa Suyama, Anete Pereira de Souza, Tadashi Kajita, Maria Imaculada Zucchi
  • Organizer: MMM4, Mangrove & Macrobenthos Meeting
  • Place of Presentation: Flagler College, St. Augustine, Florida, USA
  • Year and Date: 2016-07-18 – 2016-07-22
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] GENETIC AND EVOLUTIONARY CONSEQUENCES OF EXTREME LONG-DISTANCE SEED DISPERSAL OF THE MANGROVE GENERA, RHIZOPHORA AND HIBISCUS (2016)
  • Author(s): Koji Takayama, Yoichi Tateishi, Jin Murata, Tadashi Kajita
  • Organizer: MMM4, Mangrove & Macrobenthos Meeting
  • Place of Presentation: Flagler College, St. Augustine, Florida, USA
  • Year and Date: 2016-07-18 – 2016-07-22
  • Int'l Joint Research
• [Funded Workshop] The 3rd International Workshop for Conservation Genetics of Mangroves (2016)
  • Place of Presentation: 琉球大学熱帯生物圏研究センター西表研究施設
  • Year and Date: 2016-10-18 – 2016-10-19