2016 Fiscal Year Annual Research Report
Molecular pathogenesis of ribosomopathies and defective ribosome CODE
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25291003
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| Research Institution | University of Miyazaki |
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Principal Investigator |
剣持 直哉 宮崎大学, フロンティア科学実験総合センター, 教授 (00133124)
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| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2017-03-31
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| Keywords | リボソーム / 疾患モデル / ゼブラフィッシュ / 造血異常 / 核小体 / 発がん / ダイヤモンド・ブラックファン貧血 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
mRNAの選択的翻訳を制御すると考えられる「リボソームCODE」の存在を検証し、リボソーム病発症との関連を明らかにするために、以下の解析を実施し新たな知見を得た。
1. DBAモデルにおいて翻訳効率が低下した遺伝子の解析：DBAモデル（RPS19のノックダウン胚）において翻訳効率が低下した遺伝子のGO解析を行った結果、造血に関連する遺伝子および糖鎖の生合成に関連する遺伝子が同定された。飜訳効率が最も低下した遺伝子はGATA1であり、赤血球産生に重要な転写因子であった。GATA1の飜訳がDBA発症に関与する可能性がすでに報告されており、これを支持する結果となった。また、2番目に飜訳効率が低下した遺伝子は、GPIアンカーの生合成経路で働く因子をコードしており、DBAにおいて糖鎖合成が何らかの関わりを持つ可能性が示された。
2. DBA患者のエクソームデータの解析：網羅的なエクソーム解析にもかかわらず、約40％の患者でいまだ原因遺伝子が同定されていない。そこで、アミノ酸の変化を伴わないシノニマス変異もDBA発症に関与する可能性があると考え、発症とリンクするシノニマス変異の探索を行った。その結果、複数の患者で発症原因となる可能性のあるシノニマス変異を同定した。
3. ゲノム編集技術を用いたDBAモデルの作製：CRISPR/Casシステムを用いてRPS19遺伝子に変異を持つゼブラフィッシュの作製を試みた。高濃度のcrRNAを導入したゼブラフィッシュ胚はほぼすべて異常な表現型を示し、標的部位周辺に3～14ヌクレオチドの欠失が認められた。F1世代を作出するために、低濃度のcrRNAを導入して、正常に近い表現型を示した胚の飼育を継続している。
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| Research Progress Status |
28年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
28年度が最終年度であるため、記入しない。
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Research Products
(21 results)
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[Journal Article] Exome sequencing identified RPS15A as a novel causative gene for Diamond-Blackfan anemia2017
Author(s)
Ikeda F, Yoshida K, Toki T, Uechi T, Ishida S, Nakajima Y, Sasahara Y, Okuno Y, Kanezaki R, Terui K, Kamio T, Kobayashi A, Fujita T, Sato-Otsubo A, Shiraishi Y, Tanaka H, Chiba K, Muramatsu H, Kanno H, Ohga S, Ohara A, Kojima S, Kenmochi N, Miyano S, Ogawa S, Ito E
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Journal Title
Haematologica
Volume: 102
Pages: e93-e96
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] TBCD may be a causal gene in progressive neurodegenerative encephalopathy with atypical infantile spinal muscular atrophy2017
Author(s)
Ikeda T, Nakahara A, Nagano R, Utoyama M, Obara M, Moritake H, Uechi T, Mitsui J, Ishiura H, Yoshimura J, Doi K, Kenmochi N, Morishita S, Nishino I, Tsuji S, and Nunoi H
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Journal Title
J Hum Genet
Volume: 62
Pages: 473-480
DOI
Peer Reviewed
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