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2015 Fiscal Year Annual Research Report

Molecular dissection of organization and dynamics of membrane lipid domains

Research Project

Project/Area Number 25293015
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

小林 俊秀  国立研究開発法人理化学研究所, 佐甲細胞情報研究室, 客員主管研究員 (60162004)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 村手 源英  国立研究開発法人理化学研究所, 佐甲細胞情報研究室, 研究員 (30311369)
石塚 玲子  国立研究開発法人理化学研究所, 小林脂質生物学研究室, 専任研究員 (60342747) [Withdrawn]
阿部 充宏  国立研究開発法人理化学研究所, 佐甲細胞情報研究室, 専任研究員 (90415068)
Project Period (FY) 2013-04-01 – 2017-03-31
Keywordsスフィンゴミエリン / ラマン分光 / カベオレ / ホスホリパーゼC / コレステロール / 脂肪滴 / PLIN2 / Rab18
Outline of Annual Research Achievements

スフィンゴミエリン(SM)のクラスター形成機構: SMはクラスター化することによりSM分子同士の水素結合に起因する特徴的なラマン散乱を示すことを見出した。特徴的なラマンスペクトルを指標に、SMはジオレオイルホスファチジルコリン中ではクラスターを形成し、ジパルミトイルホスファチジルコロイン中では分散して存在すること、またコレステロールはSMと相互作用することでSM間の水素結合を阻害することを見出した。
カベオレの形成機構:膜の形状を変化させるタンパク質のスクリーニングを行った結果、ホスホリパーゼCベータ1(PLCb1)が酵素活性に依存せず、ホスファチジルエタノールアミン依存的に人工膜を管状に変化させることを見出した。細胞内で過剰発現したPLCb1および酵素活性を欠損したPLCb1の変異体はいずれも形質膜を管状に変化させた。またPLCb1を欠損した動物細胞変異株では細胞膜の特徴的な陥入構造であるカベオレが欠損していた。この結果はPLCb1がカベオレ形成に重要な役割を果たしていることを示唆している。
脂肪滴形成におけるコレステロールの役割:遊離コレステロールの蓄積は非アルコール性肝炎において重要な役割を果たしている。本研究ではヒト由来の肝培養細胞を用いてアシルコレステロールアシルトランスフェラーゼ阻害剤により遊離コレステロールを蓄積させた際の脂肪滴の動態について解析した。その結果遊離コレステロールの蓄積は脂肪滴の肥大化、脂肪滴の主要タンパク質であるPLIN2の分解、さらに低分子量GTP結合タンパク質Rab18に依存した脂肪滴と小胞体との融合を引き起こすことが明らかになった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

本研究では以下の3つの項目について明らかにすることを目的としている:
1.細胞膜中にスフィンゴ脂質とコレステロールの複合体は存在するのか?存在するとしたらその複合体はどのような時間的、空間的分布を示すのか?
2.何が脂質のクラスター化を引き起こすのか?
3.脂質ラフトの裏側はどうなっているのだろうか?
本年度はこのうち2.3.について研究を進めることができた。2.についてはスフィンゴミエリンのクラスターをラマン分光により解析する手段を見出した。また、3については脂質ラフトの一つといわれるカベオレの形成に形質膜裏側のホスファチジルエタノールアミンが重要な役割を果たしていることが示唆された。また、細胞へのコレステロールの影響を調べる過程でコレステロールが脂肪滴の分布、動態に大きく影響することを見出した。1.については新奇プローブの開発、利用について研究を進めている。

Strategy for Future Research Activity

「細胞膜中にスフィンゴ脂質とコレステロールの複合体は存在するのか?存在するとしたらその複合体はどのような時間的、空間的分布を示すのか?」について研究を完成させる。

Causes of Carryover

平成27年11月、新規脂質プローブの精製が困難なことが明らかになった。その後の検討でこの問題を解決できることが明らかになり、それらを踏まえた新しい条件下でプローブの調製を再度行った上で、応用実験に供することになった。その結果新規プローブの応用実験が平成28年度の遂行予定となった。

Expenditure Plan for Carryover Budget

物品費(血清、プラスチック器具等)、人件費(実験補助)、旅費(国際学会での発表)、その他(投稿料等)を計上した。

  • Research Products

    (15 results)

All 2016 Other

All Int'l Joint Research (4 results) Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Acknowledgement Compliant: 5 results,  Open Access: 2 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] 国立科学研究センター(CNRS)/国立衛生医学研究所(INSERM)(フランス)

    • Country Name
      FRANCE
    • Counterpart Institution
      国立科学研究センター(CNRS)/国立衛生医学研究所(INSERM)
  • [Int'l Joint Research] クイーンズランド大学(オーストラリア)

    • Country Name
      AUSTRALIA
    • Counterpart Institution
      クイーンズランド大学
  • [Int'l Joint Research] 国立化学研究所(スロベニア)

    • Country Name
      SLOVENIA
    • Counterpart Institution
      国立化学研究所
  • [Int'l Joint Research] マギル大学(カナダ)

    • Country Name
      CANADA
    • Counterpart Institution
      マギル大学
  • [Journal Article] Detection of sphingomyelin clusters by Raman spectroscopy.2016

    • Author(s)
      Shirota K, Yagi K, Inaba T, Li PC, Murata M, Sugita Y, Kobayashi T.
    • Journal Title

      Biophys J

      Volume: 111 Pages: 999-1007

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2016.07.035

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Acute accumulation of free cholesterol induces the degradation of perilipin 2 and Rab18-dependent fusion of ER and lipid droplets in cultured human hepatocytes.2016

    • Author(s)
      Makino A, Hullin-Matsuda F, Murate M, Abe M, Tomishige N, Fukuda M, Yamashita S, Fujimoto T, Vidal H, Lagarde M, Delton I, Kobayashi T.
    • Journal Title

      Mol Biol Cell

      Volume: 27 Pages: 3293-3304

    • DOI

      10.1091/mbc.E15-10-0730

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Phospholipase Cβ1 induces membrane tubulation and is involved in caveolae formation.2016

    • Author(s)
      Inaba T, Kishimoto T, Murate M, Tajima T, Sakai S, Abe M, Makino A, Tomishige N, Ishitsuka R, Ikeda Y, Takeoka S, Kobayashi T.
    • Journal Title

      Proc Natl Acad Sci USA

      Volume: 113 Pages: 7834-7839

    • DOI

      10.1073/pnas.1603513113

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Detectors for evaluating the cellular landscape of sphingomyelin- and cholesterol-rich membrane domains.2016

    • Author(s)
      Kishimoto T, Ishitsuka R, Kobayashi T.
    • Journal Title

      Biochim Biophys Acta

      Volume: 1861 Pages: 812-829

    • DOI

      10.1016/j.bbalip.2016.03.013

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Pore-forming toxins: Properties, diversity, and uses as tools to image sphingomyelin and ceramide phosphoethanolamine.2016

    • Author(s)
      Yamaji-Hasegawa A, Hullin-Matsuda F, Greimel P, Kobayashi T.
    • Journal Title

      Biochim. Biophys Acta

      Volume: 1858 Pages: 576-592

    • DOI

      10.1016/j.bbamem.2015.10.012

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] Transbilayer distribution of lipids in the plasma membrane revealed by immuno-electron microscopy2016

    • Author(s)
      Murate M
    • Organizer
      57th International Conference on the Bioscience of Lipids
    • Place of Presentation
      Chamonix Mont-Blanc, France
    • Year and Date
      2016-09-04 – 2016-09-08
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Elucidation of the natural regioisomer of the endosome-specific lipid bis(monoacylglycero)phosphate2016

    • Author(s)
      Lim SR, Tan HH, Hullin-Matsuda F, Sudesh K, Gram LH, Greimel P, Kobayashi T
    • Organizer
      57th International Conference on the Bioscience of Lipids
    • Place of Presentation
      Chamonix Mont-Blanc, France
    • Year and Date
      2016-09-04 – 2016-09-08
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Phosphatidylglycerol analog regulates the synthesis of the endosome-specific lipid bis(monoacylglycero)phosphate2016

    • Author(s)
      Tan HH, Hullin-Matsuda F, Lim SR, Sudesh K, Gram LH, Greimel P, Kobayashi T
    • Organizer
      57th International Conference on the Bioscience of Lipids
    • Place of Presentation
      Chamonix Mont-Blanc, France
    • Year and Date
      2016-09-04 – 2016-09-08
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Phospholipase C beta 1 induces membrane tubulation and is involved in caveolae formation2016

    • Author(s)
      Inaba T, Kishimoto T, Murate M, Tajima T, Sakai S, Abe M, Makino A, Tomishige N, Ishitsuka R, Ikeda Y, Takeoka S, Kobayashi T
    • Organizer
      57th International Conference on the Bioscience of Lipids
    • Place of Presentation
      Chamonix Mont-Blanc, France
    • Year and Date
      2016-09-04 – 2016-09-08
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Imaging lipids and lipid domains2016

    • Author(s)
      Kobayashi T
    • Organizer
      Joint meeting of the membrane sections of the French and German Biophysical Societies
    • Place of Presentation
      Bad Herrenalb, Germany
    • Year and Date
      2016-04-11 – 2016-04-14
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks]

    • URL

      http://lipidology.riken.jp/

URL: 

Published: 2018-01-16  

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