• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2013 Fiscal Year Annual Research Report

細菌感染によるAtg5依存・非依存オートファジーの分解と炎症誘導メカニズムの解析

Research Project

Project/Area Number 25293370
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Research InstitutionTokyo Medical and Dental University

Principal Investigator

中川 一路  東京医科歯科大学, 医歯(薬)学総合研究科, 教授 (70294113)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 丸山 史人  東京医科歯科大学, 医歯(薬)学総合研究科, 准教授 (30423122)
野澤 孝志  東京医科歯科大学, 医歯(薬)学総合研究科, 助教 (10598858)
Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
Keywordsオートファジー / A群レンサ球菌 / Rabタンパク質 / 認識分子 / 炎症誘導 / Atg5
Research Abstract

本研究では、細菌感染時の菌体排除・免疫誘導機構として注目されるオートファジーについて、Atg5依存性の選択性オートファジーとAtg5非依存性のRab9により誘導される代替性オートファジーの菌体認識・分解に関わる分子機構を明らかとする.この機構を明らかとすることで、 i) 細胞内に侵入した菌を分解して排除するための機構、ii) 細胞内での菌の動態を菌種別に高精度に感知して、有効な炎症・免疫誘導・抑制を行うためのスイッチング機構としての機能、iii) 菌体を効率良く排除するためにAtg5依存性・非依存性双方の膜誘導を制御するための機構を解明することとなり、様々な細菌感染症に対する生体の新たな防御機構の制御を可能とするだけでなく、創薬標的の同定、種々の細菌感染症の発症メカニズムの解明につながると考えられる.そこで、平成25年度では、Atg5依存性・非依存性オートファジーにおける細菌感染の認識、特にA群レンサ球菌特異的に誘導されるオートファジーに必要となる(1) Atg5依存・非依存性のオートファジー誘導に必要なPAMPs, DAMPsを認識する分子の同定.(2) Atg5依存・非依存的に誘導されるA群レンサ球菌特異的オートファジーの分子メカニズム解明.特に、Rab9と結合する分子の網羅的な解析、また同様にA群レンサ球菌感染時に必須となるRab23と結合する分子の網羅的な解析によりそのネットワークを解明することを目的とした.

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

平成25年度では、オートファゴソーム形成に関わるRabタンパク質のスクリーニングを行った.現在60種あるヒトのRabタンパク質のほぼ全ての発現系を構築し、A群レンサ球菌の感染によってオートファゴソーム形成に関わるほぼ全てと考えられるRabタンパク質を同定した.これは、飢餓誘導時に誘導されるオートファゴソーム形成で誘導されるRabタンパク質の分布とは大きく異なり、細菌感染で誘導される巨大な膜の誘導には、通常では使用されることのないRabタンパク質群をも動員されていることが明らかとなった.また、これまでオートファゴソーム形成に必須であるAtgタンパクについては、これまでKOマウス由来のMEF細胞が使われてきたが、ゲノム編集法によりHeLa細胞などの培養細胞系でもAtg5, Atg7などのオーファゴソーム形成に必須なタンパク質群のKO細胞株の作成に成功することができた.そのため、Atg5依存性・非依存性のA群レンサ球菌誘導に関わるAtg遺伝子群と、それに関わる菌体成分認識分子のスクリーニングにも、これらの培養細胞を使用できるようになった.そのため、これまでMEF細胞でのみ解析を行ってきた解析が、ヒト由来細胞でも解析が可能となったため、解析の精度が上がった.
細胞内の菌体認識成分の1つであるNRLX1に着目し、その相互作用する因子の解析を行ったところ、NRLX1と相互作用を行う因子の1つが炎症反応の誘導制御に関わっていることを明らかにすることができたため、これらの分子を細胞死の誘導に関わる因子をさらに詳細に検討する.

Strategy for Future Research Activity

上記の結果を踏まえ、平成26年度は以下の項目の研究を行う.
1. A群レンサ球菌感染特異的に誘導される選択性および代替性オートファジーに関連するTLRs、NLRsの機能解析.選択性および代替性オートファジーの誘導に必須なTLRs、NLRsの下流の分子群に着目し、炎症反応に関わるシグナル伝達因子を同定する.ここでは、分子と会合するシグナルパスウェイにある分子群の機能を解析すると共に、Luciferaseアッセイによる解析を行う.
2. Rab9、Rab23結合因子の細胞内動態の機能解析.H25に得たRab9あるいはRab23の結合分子群について、GFPタグ、mCherryタグ、および抗体を用いた免疫染色法により、その細胞内局在を同定する.
3. A群レンサ球菌変異株を用いた機能解析.これまで同定した新規分子を強発現あるいはノックダウンした培養細胞系において、A群レンサ球菌の表層抗原、分泌タンパク、二成分制御系の各遺伝子破壊株(40株程度)の感染モデルを構築し、上記1の結果も踏まえて、菌側の責任担当構造を解析する.
4. A群レンサ球菌感染時における炎症反応の遺伝子発現系の網羅的解析.上記1~3で得られた結果をふまえ、細胞分子の各変異体の細胞導入時や各変異菌株の感染時における炎症性サイトカインの遺伝子発現変化のパターンを高速シーケンサーにより解析する. また、これらのサイトカイン遺伝子の発現調節遺伝子についても同様に発現パターンを解析する. これらの解析は、Atg5依存・非依存性オートファジーのそれぞれ誘導時に行う.

  • Research Products

    (32 results)

All 2014 2013 Other

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (25 results) (of which Invited: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Streptococcus pyogenes Escapes from Autophagy2013

    • Author(s)
      Nakagawa I
    • Journal Title

      Cell Host and Microbe

      Volume: 14 Pages: 604-606

    • DOI

      10.1016/j.chom.2013.11.012

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Endogenous Nitrated Nucleotide Is a Key Mediator of Autophagy and Innate Defense Against Bacteria2013

    • Author(s)
      Ito C, Saito Y, Nozawa T, Fujii S, Sawa T, Inoue H, Matsunaga T, Khan S, Akashi S, Hashimoto R, Aikawa C, Takahashi E, Sagara H, Komatsu M, Tanaka K, Akaike T, Nakagawa I, Arimoto H
    • Journal Title

      Molecular Cell

      Volume: 52 Pages: 794-804

    • DOI

      10.1016/j.molcel.2013.10.024

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Analysis of the factors affecting the formation of the microbiome associated with chronic osteomyelitis of the jaw2013

    • Author(s)
      Goda A, Maruyama F, Michi Y, Nakagawa I, Harada K
    • Journal Title

      Clinical Microbiology and Infection

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1111/1469-0691.12400

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] CRISPR regulation of ittraspecies diversification by limiting IS transposition and intercellular recombination2013

    • Author(s)
      Watanabe T, Nozawa T, Aikawa C, Amano A, Maruyama F,Nakagawa I.
    • Journal Title

      GENOME BIOLOGY AND EVOLUTION

      Volume: 5 Pages: 1099-1114

    • DOI

      10.1093/gbe/evt075

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genetic Analysis of Capsular Polysaccharide Synthesis Gene Clusters from All Serotypes of Streptococcus suis: Potential Mechanisms for the Generation of Capsular Variation2013

    • Author(s)
      Okura M, Takamatsu D, Maruyama F, Nozawa T, Nakagawa I, Osaki M, Sekizaki T, Gottschalk M, Kumagai Y, Hamada S.
    • Journal Title

      Appl Environ Microbiol.

      Volume: 79 Pages: 2796-2806

    • DOI

      10.1128/AEM.03742-12

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Complete Genome Sequence of Propionibacterium acnes Isolate from sarcoidosis patient.2013

    • Author(s)
      Minegishi K, Aikawa C, Furukawa A, Watanabe T, Nakano T, Ogura Y, Ohtubo Y,Kurokawa K, Hayashi T, Maruyama F, Nakagawa I, Eishi Y
    • Journal Title

      Genome Announc

      Volume: 1 Pages: e00016-12

    • DOI

      10.1128/genomeA.00016-12

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 発現解析に基づいた選択的オートファジーに対抗するA群連鎖球菌遺伝子の同定2014

    • Author(s)
      相川知宏, Amonrattana Roobthaisong, 野澤孝志, 渡辺孝康, 丸山史人, 中川一路
    • Organizer
      第87回 日本細菌学会総会
    • Place of Presentation
      東京(タワーホール船堀)
    • Year and Date
      20140326-20140328
  • [Presentation] 複合細菌感染症に関わるキーストーン種と病原性因子ネットワーク2014

    • Author(s)
      郷田瑛, 加地博一, 丸山史人, 中川一路
    • Organizer
      第87回 日本細菌学会総会
    • Place of Presentation
      東京(タワーホール船堀)
    • Year and Date
      20140326-20140328
  • [Presentation] 細菌感染特異的オートファジーを制御する細胞制御因子の同定と機能解析2014

    • Author(s)
      中島慎太郎, 今村拓郎, 相川知宏, 丸山史人, 中川一路
    • Organizer
      第87回 日本細菌学会総会
    • Place of Presentation
      東京(タワーホール船堀)
    • Year and Date
      20140326-20140328
  • [Presentation] Atg5-independent/Rab9a-dependent target of intracellular group A streptococcus2014

    • Author(s)
      野澤孝志, 野澤敦子, 相川知宏, 丸山史人, 中川一路
    • Organizer
      第87回 日本細菌学会総会
    • Place of Presentation
      東京(タワーホール船堀)
    • Year and Date
      20140326-20140328
  • [Presentation] Contribution of recycling endosome in Group A Streptococcus induced autophagosome formation2014

    • Author(s)
      Bijaya Haobam, 野澤孝志, 野澤敦子, 尾田誠一郎, 相川知宏, 丸山史人, 中川一路
    • Organizer
      第87回 日本細菌学会総会
    • Place of Presentation
      東京(タワーホール船堀)
    • Year and Date
      20140326-20140328
  • [Presentation] The Small GTPase Rab30 regulates anti-bacterial autophagy2014

    • Author(s)
      尾田誠一郎, 野澤孝志, 野澤敦子, 相川知宏, 丸山史人, 中川一路
    • Organizer
      第87回 日本細菌学会総会
    • Place of Presentation
      東京(タワーホール船堀)
    • Year and Date
      20140326-20140328
  • [Presentation] Rab35 and TBC1D10A regulate the recruitment of NDP52 to groupA Streptococcus for autophagy2014

    • Author(s)
      野澤敦子, 野澤孝志, Bijaya Haobam, 相川知宏, 丸山史人, 中川一路
    • Organizer
      第87回 日本細菌学会総会
    • Place of Presentation
      東京(タワーホール船堀)
    • Year and Date
      20140326-20140328
  • [Presentation] インプラント周囲炎および歯周炎罹患部位の細菌群集比較を通じた周囲炎原因候補種と機能遺伝子の選定2014

    • Author(s)
      芝多佳彦,丸山史人, 竹内康雄,渡辺孝康, 小柳達郎, 和泉雄一, 中川一路
    • Organizer
      第87回 日本細菌学会総会
    • Place of Presentation
      東京(タワーホール船堀)
    • Year and Date
      20140326-20140328
  • [Presentation] 歯周病原細菌におけるCRISPRのゲノム進化制御2014

    • Author(s)
      渡辺孝康,野澤孝志,相川知宏,丸山史人,中川一路
    • Organizer
      第87回 日本細菌学会総会
    • Place of Presentation
      東京(タワーホール船堀)
    • Year and Date
      20140326-20140328
  • [Presentation] 歯周病原細菌におけるCRISPRのゲノム進化制御2014

    • Author(s)
      渡辺孝康,野澤孝志,相川知宏,丸山史人,中川一路
    • Organizer
      第8回日本ゲノム微生物学会
    • Place of Presentation
      東京(東京農業大学)
    • Year and Date
      20140307-20140309
  • [Presentation] 細胞内寄生を介したA群連鎖球菌の多様化・進化機構の解明2014

    • Author(s)
      山田俊介,柴崎真樹,渡辺孝康,丸山史人,中川一路
    • Organizer
      第8回日本ゲノム微生物学会
    • Place of Presentation
      東京(東京農業大学)
    • Year and Date
      20140307-20140309
  • [Presentation] 種間の競争・協力がもたらす複合感染症成立機構2014

    • Author(s)
      丸山史人,遠藤亜希子,和泉雄一,中川一路
    • Organizer
      第8回日本ゲノム微生物学会
    • Place of Presentation
      東京(東京農業大学)
    • Year and Date
      20140307-20140309
  • [Presentation] インプラント周囲炎・歯周炎罹患部位で活性を有する細菌群集比較を通じた周囲炎原因候補種の選定2013

    • Author(s)
      芝多佳彦,竹内康雄,中川一路, 和泉雄一
    • Organizer
      第78回国腔病学会学術大会
    • Place of Presentation
      東京(東京医科歯科大学)
    • Year and Date
      20131206-20131207
  • [Presentation] 歯周病原細菌ゲノム情報から紐解く種の共生機構2013

    • Author(s)
      遠藤亜希子,渡辺孝康,丸山史人,和泉雄一,中川一路
    • Organizer
      第29回日本微生物生体学大会
    • Place of Presentation
      鹿児島(鹿児島大学郡元キャンパス)
    • Year and Date
      20131122-20131125
  • [Presentation] CRISPRによる病原性細菌の生存と進化侵略2013

    • Author(s)
      中川一路
    • Organizer
      第55回歯科基礎医学会学術大会・総会
    • Place of Presentation
      岡山(岡山コンベンションセンター)
    • Year and Date
      20130920-20130922
    • Invited
  • [Presentation] Porphyromonas gingivalisにおける遺伝的組換えとCRISPRによる相反的な種内多様性制御2013

    • Author(s)
      丸山史人,渡辺孝康,野澤孝志,中川一路
    • Organizer
      第55回歯科基礎医学会学術大会・総会
    • Place of Presentation
      岡山(岡山コンベンションセンター)
    • Year and Date
      20130920-20130922
  • [Presentation] Red-complex構成細菌間での異なる進化機構2013

    • Author(s)
      遠藤亜希子,渡辺孝志,丸山史人,和泉雄一,中川一路
    • Organizer
      第55回歯科基礎医学会学術大会・総会
    • Place of Presentation
      岡山(岡山コンベンションセンター)
    • Year and Date
      20130920-20130922
  • [Presentation] 多株ゲノム情報から見出された歯周病原細菌CRISPRの新機能2013

    • Author(s)
      渡辺孝康,野澤孝志,相川知宏,遠藤亜希子,丸山史人,中川一路
    • Organizer
      第7回日本ゲノム微生物学会若手の会
    • Place of Presentation
      静岡(ろうきん研修所富士センター)
    • Year and Date
      20130919-20130920
  • [Presentation] 遺伝的組換えとCRISPRによる相反的な細菌種内多様性制御2013

    • Author(s)
      丸山史人,渡辺孝康,野澤孝志,相川知宏,中川一路
    • Organizer
      NGS現場の会 第三回研究会
    • Place of Presentation
      神戸(神戸ポートピアホテル)
    • Year and Date
      20130904-20130905
  • [Presentation] CRISPRとゲノム構造からみた歯周病原細菌の共存機構2013

    • Author(s)
      渡辺孝康,遠藤亜希子,丸山史人,和泉雄一,中川一路
    • Organizer
      NGS現場の会 第三回研究会
    • Place of Presentation
      神戸(神戸ポートピアホテル)
    • Year and Date
      20130904-20130905
  • [Presentation] 顎骨骨髄炎の細菌創を規定する因子とコア・マイクロバイオーム2013

    • Author(s)
      郷田瑛,丸山史人,道泰之,加地博一,中川一路,原田清
    • Organizer
      第7回細菌学若手コロッセウム
    • Place of Presentation
      広島(フォレストヒルズガーデン/広島エアポートホテル)
    • Year and Date
      20130807-20130809
  • [Presentation] Atg5-independent/Rab9A-dependent target of intracellular Group A Streptococcus2013

    • Author(s)
      Takashi Nozawa, Chihiro Aikawa, Shinichiro Oda, Akira Goda, Fumito Maruyama, and Ichiro Nakagawa
    • Organizer
      FEMS2013
    • Place of Presentation
      ライプチヒ、ドイツ
    • Year and Date
      20130721-20130725
  • [Presentation] Analysis of the factors affecting the formation of the microbiome associated with chronic osteomyelitis of the jaw2013

    • Author(s)
      Akira Goda, Fumito Maruyama, Yasuyuki Michi, Nakagawa Ichiro, and Kiyoshi Harada
    • Organizer
      FEMS2013
    • Place of Presentation
      ライプチヒ、ドイツ
    • Year and Date
      20130721-20130725
  • [Presentation] 比較ゲノム解析から見出されたTannerella forsythia特異的生存戦略2013

    • Author(s)
      遠藤亜希子、渡辺孝康、荒川真一、丸山史人、中川一路、和泉雄一
    • Organizer
      第56回日本歯周病学会
    • Place of Presentation
      東京(タワーホール船堀)
    • Year and Date
      20130531-20130601
  • [Presentation] インプラント周囲炎と歯周炎で構成種と共起・排除関係が異なる2013

    • Author(s)
      丸山緑子、竹内康雄、丸山史人、中川一路、和泉雄一
    • Organizer
      第56回日本歯周病学会
    • Place of Presentation
      東京(タワーホール船堀)
    • Year and Date
      20130531-20130601
  • [Remarks] 東京医科歯科大学・大学院医歯学総合研究科・細菌感染制御学分野

    • URL

      http://www.tmd.ac.jp/grad/bac/

URL: 

Published: 2015-05-28  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi