2014 Fiscal Year Annual Research Report
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25711019
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Research Institution | The Institute of Physical and Chemical Research |
Principal Investigator |
吉田 聡子 独立行政法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, 上級研究員 (20450421)
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Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2017-03-31
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Keywords | 寄生植物 / ゲノム / 変異体 / 遺伝学 |
Outline of Annual Research Achievements |
1. マーカー遺伝子を用いた変異体の表現型解析 得られた変異体について、マーカー遺伝子を用いて表現型を解析した。寄生時に発現する遺伝子の、変異体での発現パターンを調べた。また、表現型に応じて、寄生マーカー遺伝子や細胞分裂、導管形成、植物ホルモン応答マーカーなどのプロモーター::GFPコンストラクト作成し、形質転換することにより、変異体内でのマーカー遺伝子の挙動を追った。 2. コシオガマ遺伝地図作成と原因遺伝子同定法の確立 変異体単離の野生株として用いた生態型Okayama(岡山大学、榎本先生より寄贈)と比較的早咲きでOkayamaとのSNPsが確認されているKyushu(九州大学、矢原先生より寄贈)ラインをかけ合わせ、F2世代を用いてマーカー解析をした。表現型が最も明確に確認できる変異体を用いて、原因遺伝子の同定をおこなった。得られた変異体を野生型親株にかけ合わせ、表現型のあるF2世代植物DNAのプールをシーケンスするMutMap法(Abe et al. 2012, Nature Biotech. 30, 174-178)を用いて、シーケンスをおこなった。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
変異体のスクリーニングを終了し、その表現型解析を進めている。また、遺伝子同定のためのシーケンスをおこない、候補遺伝子を得た。当初の予定通り順調に進展していると考えている。
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Strategy for Future Research Activity |
変異体原因遺伝子の同定をすすめ、その遺伝子機能解析をおこなう。また、他の変異体についても同定をすすめる。また、表現型解析の結果を論文として発表する。
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Causes of Carryover |
研究員の雇用が当初予定より半年遅れてスタートしたため、人件費を次年度に繰り越しする。
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Expenditure Plan for Carryover Budget |
引き続き研究員の雇用をおこない、研究を推進する。
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Research Products
(8 results)
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[Presentation] 寄生植物と宿主植物の細胞壁をめぐる攻防2015
Author(s)
吉田聡子, Musembi Mutuku, Songkui Cui, 堀千明, 清水崇, 市橋安範, 出村拓, 白須賢
Organizer
日本植物生理学会
Place of Presentation
東京農業大学
Year and Date
2015-03-16 – 2015-03-18
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[Presentation] 寄生植物ストライガの全ゲノム解読2014
Author(s)
吉田聡子, Thomas Spallek, Songkui Cui, 市橋 泰範, Seungill Kim, Yong-Min Kim, 真鍋 理一郎, Michael Timko, Doil Choi, 白須 賢
Organizer
日本植物学会
Place of Presentation
明治大学生田キャンパス
Year and Date
2014-09-12 – 2014-09-14
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