2015 Fiscal Year Research-status Report
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25871068
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| Research Institution | Japanese Foundation for Cancer Research |
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Principal Investigator |
藤原 大 公益財団法人がん研究会, その他部局等, 研究員 (00552712)
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| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2017-03-31
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| Keywords | 肺がん / ゲノム解析 / 遺伝子病理診断学 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
肺腺がんのトランスクリプトームデータを公共データベースより取得し、既報の遺伝子セットでサブタイプ分類を実施した。特にがんゲノムアトラスより548症例の肺腺がんのデータを取得し、トランスクリプトームでのサブタイプ分類を実施後、サブタイプごとのゲノム異常を解析した。既報と類似した発現パターンのサブタイプが同定され、特徴的な変異をもつ遺伝子が得られた。また、サブタイプと関連するマイクロRNA予測を実施した。自施設の肺腺がん２４症例のマイクロアレイ実験を行い、マイクロRNAの網羅的発現解析の結果、サブタイプ特異的なマイクロRNAを同定・検証した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
計画に従い、公共データベースからトランスクリプトームデータを取得し、サブタイプを同定した。がんゲノムアトラスのデータについては、サブタイプのゲノム異常とサブタイプ特異的なマイクロRNAを予測できた。自施設の肺腺がん２４症例のデータを用いて、サブタイプ特異的なマイクロRNAの同定と検証を実施できた。
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| Strategy for Future Research Activity |
得られた結果に、追加解析も加えてまとめ、研究を発展させる。
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| Causes of Carryover |
平成28年10月6-8日開催予定の第75回日本癌学会学術総会（横浜）にて本研究成果を発表するため。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
学会参加費用に充当予定。
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