2014 Fiscal Year Annual Research Report
| Project/Area Number |
25893256
|
|---|
| Research Institution | Tokyo Women's Medical University |
|---|
Principal Investigator |
町田 光世 東京女子医科大学, 医学部, 特任助教 (60468692)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2013-08-30 – 2015-03-31
|
| Keywords | SNP解析 / 劣化DNA |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
法医学では一般的にshort tandem repeat領域(STR)を用いて個人識別を行っているが、曝露された環境や保存状態の悪化からDNAの断片化が起こり、従来のSTR法では解析が困難となる場合もある。近年では一塩基多型(single nucleotide polymorphisms; SNPs)解析が、遺伝子増幅サイズが短い理由から法医学分野でも注目されている。そこで、DNA損傷を受けにくい領域に存在するSNPsに着目し、従来の手法では解析が困難な劣化したDNA試料からでも解析可能なSNPsマーカーを探索するために、フィンガープリント法の一種であるAFLP(Amplified Fragment Length Polymorphism)法によってSNPsのスクリーニングを行った。なお分析にはAFLP Analysis System I(Invitrogen)を使用した。試料はヒトゲノムDNA(K562 DNA High Molecular Weight; Promega)のコントロールDNAを使用し、200bp以下の短いDNA断片になるように熱処理した後、処理前後のDNA試料を用いてAFLP分析を行った。ポリアクリルアミドゲル電気泳動によりバンドパターンを確認し、目的のAFLPバンドである劣化前後で共通に検出されるバンドを切り出した。切り出したバンドからDNAを抽出してPCR後ダイレクトシーケンス解析を行った。バンドパターンの再現性を得るために３回の繰り返し実験を試みた。最終的に32の変性前後で共通のAFLPバンドを確認し、そのうち複数のバンド由来のDNA断片において既存のSNPsが同定された。
|
| Research Progress Status |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
|
| Strategy for Future Research Activity |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
|
Research Products
(4 results)
-
-
[Presentation] 変性DNAのSNPs解析2014
Author(s)
町田光世、木林和彦
Organizer
第83回日本法医学会学術関東地方集会
Place of Presentation
東京女子医科大学弥生記念講堂（東京都新宿区）
Year and Date
2014-11-08 – 2014-11-08
-
-
