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2016 Fiscal Year Annual Research Report

Protein-protein interactions that make the actin filament functional

Research Project

Project/Area Number 26251017
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

前田 雄一郎  名古屋大学, 理学研究科, 特任教授 (10321811)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 成田 哲博  名古屋大学, 理学研究科, 准教授 (30360613)
Project Period (FY) 2014-06-27 – 2017-03-31
Keywordsアクチン / アクチン・トレッドミリング / 細胞運動 / 筋肉細い線維 / ATP加水分解 / 重合・脱重合 / X線結晶構造解析 / 電子顕微鏡単粒子解析
Outline of Annual Research Achievements

本研究課題のうち(4)“アクチン重合体のもう一つの状態”の研究中、私たちは蛋白質fragminのアクチン重合体への結合を調べている過程で、重大な新発見をした。1990年に単量体アクチン (G型アクチン) の結晶構造が解明され、2009年には我々によって重合に伴うアクチン分子の形状遷移(G型からF型へ)が発見されたが、F型アクチンの高分解能の結晶構造は未知であった。私たちは今回、fragmin/アクチン= 1/1, 1/2, 2/4の3種の複合体の結晶を得た。これらにはF型アクチンが含まれ、その高分解能構造(分解能1.5A)が初めて解明された。それによって、アクチンのATP加水分解反応、および会合反応のメカニズムについてすでに重要な知見が得られた。またcofilin/アクチン線維の電子顕微鏡構造解析(3.8A分解能)よりアクチンは第3の形態(C型)をとることが明らかとなった。細胞運動の基礎にあるアクチンのATP加水分解(化学過程)、分子の形態変化、重合・脱重合サイクル(物理過程)の間でのエネルギーのやりとりが明らかになりつつある。
課題(1) “「細い線維」のEM構造解析“では、新開発した走査型透過電顕を使った単粒子解析によって、アクチン・トロポミオシン・トロポニンからなる再構成「細い線維」中でのトロポニン分子の向き、トロポミオシン分子のつぎ目の位置などが新たに解明された。Ca2+イオン存在下でのよいEM像を得ることが次の課題である。課題(2)”長さの揃った「ミニ線維」の再構成”および課題(3)”Tmodによるアクチン/Tm線維のP端止め構造の解明”では、トロポモジュリン(Tmod)とトロポミオシン(Tm)線維のつぎ目のアミノ酸配列を修正した結果、再構成した「ミニ線維」の安定度を改善した。電顕での均一性の確認と、「ミニ線維」がCa2+で調節されている点の確認が今後の課題である。

Research Progress Status

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

28年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (15 results)

All 2017 2016

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 5 results) Presentation (10 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Direct observation of the actin filament by tip-scan atomic force microscopy2016

    • Author(s)
      Narita A, Usukura E, Yagi A, Tateyama K, Akizuki S, Kikumoto M, Matsumoto T, Maéda Y, Ito S, Usukura J.
    • Journal Title

      Microscopy

      Volume: 65 Pages: 370-377

    • DOI

      10.1093/jmicro/dfw017

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Comprehensive analysis of motions in molecular dynamics trajectories of the actin capping protein and its inhibitor complexes.2016

    • Author(s)
      Koike R, Takeda S, Maéda Y, Ota M.
    • Journal Title

      Proteins

      Volume: 84 Pages: 948-956

    • DOI

      doi: 10.1002/prot.25043

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] An Unroofing Method to Observe the Cytoskeleton Directly at Molecular Resolution Using Atomic Force Microscopy.2016

    • Author(s)
      Usukura E., Narita A., Yagi A., Ito S., Usukura J.
    • Journal Title

      Sci. Rep.

      Volume: 7 Pages: 6:27472

    • DOI

      10.1038/srep27472

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] A new approach for the direct visualization of the membrane cytoskeleton in cryo-electron microscopy: a comparative study with freeze-etching electron microscopy2016

    • Author(s)
      Makihara M., Watanabe T., Usukura E., Kaibuchi K., Narita A., Tanaka N., Usukura J.
    • Journal Title

      Microscopy

      Volume: 65 Pages: 488-496

    • DOI

      10.1093/jmicro/dfw037

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Structural complexity of filaments formed from the actin and tubulin folds2016

    • Author(s)
      Jiang S., Ghoshdastider U., Narita A., Popp D., Robinson RC.
    • Journal Title

      Commun Integr Biol.,

      Volume: 9 Pages: e1242538

    • DOI

      10.1080/19420889.2016.1242538.

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] F型アクチンの結晶構造2017

    • Author(s)
      武田修一、成田哲博、小田俊郎、田中康太郎、渡邉信久、前田雄一郎
    • Organizer
      日本生物物理学会中部支部講演会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2017-03-06
  • [Presentation] クライオ電子顕微鏡法によるアクチン・コフィリン線維の構造解析2017

    • Author(s)
      田中康太郎、光岡薫、前田雄一郎、成田哲博
    • Organizer
      日本生物物理学会中部支部講演会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2017-03-06
  • [Presentation] F型アクチンの結晶構造2017

    • Author(s)
      武田修一、成田哲博、小田俊郎、田中康太郎、渡邉信久、前田雄一郎
    • Organizer
      名古屋大学シンクロトロン光研究センターシンポジウム
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2017-03-02
  • [Presentation] F型アクチンの結晶構造とアクチン集合メカニズム2017

    • Author(s)
      武田修一、前田雄一郎
    • Organizer
      F型アクチンの結晶構造とアクチン集合メカニズム
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2017-01-06
  • [Presentation] アクチン重合体の結晶構造:アクチン重合のメカニズム2016

    • Author(s)
      武田修一、前田雄一郎
    • Organizer
      筋生理の集い
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2016-12-17
  • [Presentation] Crystal structure of the "F-form" actin in complex with fragmin" IGER International Symposium on " Now in actin study: Motor protein research researching a new stage2016

    • Author(s)
      Takeda S., Narita A., Oda T., Tanaka K., Watanabe N., Maeda Y
    • Organizer
      IGER International Symposium on " Now in actin study: Motor protein research researching a new stage"
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2016-12-13
  • [Presentation] “Mg-Polymer”再考 Revisiting "Mg-Polymer"2016

    • Author(s)
      Kikumoto M., Takeda S., Matsumoto T., Maeda Y
    • Organizer
      第54回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      つくば
    • Year and Date
      2016-11-27
  • [Presentation] Crystal structure of fragmin/actin complex demonstrates a high resolution "F-form" actin structure2016

    • Author(s)
      Takeda S. Maeda Y
    • Organizer
      The 42nd Naito Conference In the Vanguard of Structural Biology: Revolutionizing Life Sciences 生命科学に革命をもたらす最先端構造生物学
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2016-10-06
  • [Presentation] Crystal structure of actin 4-mer in complex with 2x fragmin and the mechanism of actin filament assembly2016

    • Author(s)
      Takeda S, Narita A, Oda T, Tanaka K, Maeda Y
    • Organizer
      Gordon Research Conference, Muscle and Molecular Motors
    • Place of Presentation
      Mt. Snow, VM, USA
    • Year and Date
      2016-07-18
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] tructural analysis of the cytoskeleton by a tip-scan AFM, BIXAM チップスキャンAFM、BIXAM による膜細胞骨格構造解析2016

    • Author(s)
      Narita A.,Usukura E.,Yagi A., Tateyama K., Akizuki S., Kikumoto M., Matsumoto T., Maeda Y., Ito S., Usukura J.
    • Organizer
      日本顕微鏡学会第72回学術講演会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2016-06-14

URL: 

Published: 2018-01-16  

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