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2017 Fiscal Year Annual Research Report

Site selective cellular analysis by solid-state NMR

Research Project

Project/Area Number 26291029
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

藤原 敏道  大阪大学, たんぱく質研究所, 教授 (20242381)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2018-03-31
Keywords核磁気共鳴 / 細胞内分子構造 / 常磁性造影剤 / 細胞内局在イメージング / 生物物理学
Outline of Annual Research Achievements

細胞内において運動性の高い球状蛋白質などの機能,構造,相互作用,安定性を原子分解能で解析できるのがIn-cell NMR分光法である。本課題では,この方法を発展させて運動性の低い生体膜の蛋白質構造や細胞質の蛋白質集合体構造を定量的高感度でNMR解析可能にした。同時にNMRで細胞内での位置情報を得られるようにした。応用としてモデル膜蛋白質についてNMRで得られた蛋白質構造や細胞内位置情報,電子顕微鏡像を組み合わせて,0.1nmから1μmの分解能で細胞モデル構造を解明した。このために,1) 多次元固体NMR定量測定法,2)NMR感度を1000倍向上させたDNP固体NMR法,3)位置情報を与える常磁性造影剤・分極剤の細胞局在法,4)スピン拡散距離測定法,5)対象蛋白質選択的な安定同位体13C,15N標識法を実施した。
細胞部位選択的高感度固体NMR法の確立するために,初めに次の要素技術を高度化した。1) 多次元固体NMR定量解析法,2) DNP-NMR感度向上法,3) 細胞に局在する常磁性造影剤・分極剤利用法,4) スピン拡散距離測定法,5) 細胞内の特定蛋白質選択的な同位体標識法。例えば,2)では感度向上DNP用分極剤の細胞内局在の実証,4)では細胞表面に局在する造影剤との距離を求めるための磁気緩和速度解析である。これらを標識蛋白質が含む細胞系に適用可能にして統合した。これらを統合して,膜蛋白質と水溶性蛋白質ユビキチンについて,細胞内での蛋白質構造など状態,蛋白質数,細胞内での存在分布を明らかにした。これに基づいて,対象蛋白質にフォーカスした細胞モデル構造を提示した。

Research Progress Status

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

29年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (10 results)

All 2018 2017

All Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 5 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 2 results) Book (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Direct assignment of 13C solid-state NMR signals of TFoF1 ATP synthase subunit c-ring in lipid membranes and its implication for the ring structure2017

    • Author(s)
      Kang Su-Jin、Todokoro Yasuto、Bak Suyeon、Suzuki Toshiharu、Yoshida Masasuke、Fujiwara Toshimichi、Akutsu Hideo
    • Journal Title

      Journal of Biomolecular NMR

      Volume: 70 Pages: 53~65

    • DOI

      https://doi.org/10.1007/s10858-017-0158-x

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Protein 19F-labeling using transglutaminase for the NMR study of intermolecular interactions2017

    • Author(s)
      Hattori Yoshikazu、Heidenreich David、Ono Yuki、Sugiki Toshihiko、Yokoyama Kei-ichi、Suzuki Ei-ichiro、Fujiwara Toshimichi、Kojima Chojiro
    • Journal Title

      Journal of Biomolecular NMR

      Volume: 68 Pages: 271~279

    • DOI

      https://doi.org/10.1007/s10858-017-0125-6

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mechanistic and structural basis of bioengineered bovine Cathelicidin-5 with optimized therapeutic activity2017

    • Author(s)
      Sahoo Bikash R.、Maruyama Kenta、Edula Jyotheeswara R.、Tougan Takahiro、Lin Yuxi、Lee Young-Ho、Horii Toshihiro、Fujiwara Toshimichi
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 7 Pages: 44781~44781

    • DOI

      doi:10.1038/srep44781

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Nanodisc-to-Nanofiber Transition of Noncovalent Peptide?Phospholipid Assemblies2017

    • Author(s)
      Ikeda Keisuke、Horiuchi Ayame、Egawa Ayako、Tamaki Hajime、Fujiwara Toshimichi、Nakano Minoru
    • Journal Title

      ACS Omega

      Volume: 2 Pages: 2935~2944

    • DOI

      DOI: 10.1021/acsomega.7b00424

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Conformational states of HAMP domains interacting with sensory rhodopsin membrane systems: an integrated all-atom and coarse-grained molecular dynamics simulation approach2017

    • Author(s)
      Sahoo Bikash Ranjan、Fujiwara Toshimichi
    • Journal Title

      Mol. BioSyst.

      Volume: 13 Pages: 193~207

    • DOI

      DOI: 10.1039/C6MB00730A

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] High-Field DNP and Cellular Solid-State NMR Using Paramagnetism under Low Temperatures2017

    • Author(s)
      Toshimichi Fujiwara
    • Organizer
      Taiwan-Japan Biomedical Symposium on Magnetic Resonance
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] High-Field DNP and Cellular Solid-State NMR Using Paramagnetism under Low Temperatures2017

    • Author(s)
      Toshimichi Fujiwara
    • Organizer
      Telluride workshop on DNP and Paramagnetic NMR
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] High-Field DNP and Quantitative Cellular Solid-State NMR under Low Temperatures2017

    • Author(s)
      Toshimichi Fujiwara
    • Organizer
      The 20th International Society of Magnetic Resonance
    • Int'l Joint Research
  • [Book] Experimental Approaches of NMR Spectroscopy, Methodology and Application to Life Science and Materials Science2017

    • Author(s)
      Yoh Matsuki and Toshimichi Fujiwara
    • Total Pages
      636
    • Publisher
      Springer
    • ISBN
      978-981-10-5966-7
  • [Patent(Industrial Property Rights)] NMR試料管2018

    • Inventor(s)
      松木陽,藤原敏道,遠藤由宇生,中村新治,根本貴宏
    • Industrial Property Rights Holder
      日本電子株式会社
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2018-081242

URL: 

Published: 2018-12-17  

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