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2015 Fiscal Year Annual Research Report

真核細胞におけるmRNA輸送基盤の解明とアプライドmRNAバイオテクロジー

Research Project

Project/Area Number 26292053
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

増田 誠司  京都大学, 生命科学研究科, 准教授 (20260614)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 井沢 真吾  京都工芸繊維大学, 工芸科学研究科, 准教授 (10273517)
Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
KeywordsmRNA輸送体 / タンパク質
Outline of Annual Research Achievements

遺伝子発現の制御段階として、転写や翻訳がよく知られている。これらに加え、高等真核細胞では、mRNAの核から細胞質への輸送も重要であることを発見した。mRNAの核外輸送は、mRNA輸送体によって担われている。報告者は、mRNA輸送体としてヒトTREX複合体とAREX複合体を見いだし、これらの生理機能の違いを明らかにした。また核外輸送を担うmRNA輸送受容体を用いて、動物細胞におけるタンパク質生産技術へと応用する研究を行った。
本研究は、TREX複合体とAREX複合体の2つに多様化したヒトmRNA輸送体が形成するmRNA核外輸送経路について、機能解析と構造解析とインフォマティクスを駆使して包括的に解析し、ヒトにおけるmRNA輸送経路の全貌を明らかにする。さらにアプライドmRNAバイオテクノロジーとして、mRNA核外輸送を効率化する第2世代の標的mRNA専用輸送系を創成し、革新的タンパク質生産技術として産業化へ結びつける研究を展開する。
mRNA輸送体について、これまで構造の不明であったURH49の結晶構造を解明した。またUAP56の構造と比較して両者が異なることを示した。さらに、UAP56とURH49が結合する配列についてpar-clip法を用いて解析した。現在NGSの解析が修了しその結果を解析中である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

1.URH49の結晶構造を明らかにした。
2.UAP56とURH49の構造は、似通っているところが多いものの、2つのドメインの連結部分の構造が異なるためにドメイン間の角度が異なっていることを見いだした。
3.UAP56とURH49の結合配列を明らかにするためにparClip法にて解析を進めNGS解析を行った。
以上の成果から、計画は順調に進んでいると判断している。

Strategy for Future Research Activity

次年度は、以下に記した内容を行うことにより、真核細胞におけるmRNA輸送基盤を明らかにする。
1.UAP56とURH49によるTREX複合体ならびにAREX複合体構築基盤の解明―結晶構造の相違がどのアミノ酸変異が原因で生じたかについて詳細な変異体解析を行う。  2.UAP56とURH49が輸送するmRNAの認識機構の解明―par-Clip法により単離したUAP56とURH49の結合配列についてNGSを用いて解析したので、その結果の詳細を進めていく。具体的には、結合コンセンサス配列の同定とそれに続くミニジーンの作製ならびにその評価を行う。 3.AREX複合体のmRNA核外輸送経路の解明―AREX複合体構成因子の抗体を用いた免疫沈降やプルダウン法によってAREX複合体と相互作用するmRNA輸送受容体を同定する。
これらの解析から多様化したmRNAの輸送受容体と、TREXならびにAREX複合体によって形成されるmRNA輸送経路を解明する。

Causes of Carryover

予想していたよりも短期間で上記成果が得られたため、当初予定していた実験を行う必要性がなくなった。この実験に予定した費用を使用する必要がなかった。

Expenditure Plan for Carryover Budget

NGSを用いて得た結合RNA配列からコンセンサス配列を導く解析、ならびにその配列を実際の細胞を用いて証明する実験に使用する。

  • Research Products

    (11 results)

All 2016 2015 Other

All Presentation (10 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Presentation] 大豆中のmRNA成熟阻害活性の同定・構造活性相関・作用基盤の解明2016

    • Author(s)
      増田誠司
    • Organizer
      日本農芸化学会大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-28 – 2016-03-28
    • Invited
  • [Presentation] A Molecular mechanism to recognize distinct target mRNAs by UAP56 and URH49, the two closely related DEAD-box helicases.2016

    • Author(s)
      Kenichi Fujita, Misa Ito and Seiji Masuda
    • Organizer
      The 14th International Student Seminar
    • Place of Presentation
      芝蘭会館(京都府京都市)
    • Year and Date
      2016-03-11 – 2016-03-11
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] The interactome analysis of PABPN1 in the nucleus of HeLa cells2016

    • Author(s)
      Intisar F. A. Mulsi, Naoko Fujiwara and Seiji Masuda
    • Organizer
      The 14th International Student Seminar
    • Place of Presentation
      芝蘭会館(京都府京都市)
    • Year and Date
      2016-03-11 – 2016-03-11
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] mRNA核外輸送因子UAP56とURH49が異なる標的mRNA群を認識する仕組み2015

    • Author(s)
      藤田賢一、伊藤慶紗、増田誠司
    • Organizer
      RNA frontier Meeting
    • Place of Presentation
      タカミヤビレッジホテル樹林(山形県山形市)
    • Year and Date
      2015-12-10 – 2015-12-10
  • [Presentation] 異なる複合体を形成するmRNA輸送因子UAP56およびURH49の三次元構造解析2015

    • Author(s)
      伊藤慶紗、藤田賢一、増田誠司
    • Organizer
      日本分子生物学会・日本生化学会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-03 – 2015-12-03
  • [Presentation] mRNA核外輸送共役因子UAP56ならびにURH49における複合体形成と選択的mRNA輸送の制御基盤2015

    • Author(s)
      藤田賢一、伊藤慶紗、増田誠司
    • Organizer
      日本分子生物学会・日本生化学会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-03 – 2015-12-03
  • [Presentation] 哺乳類mRNA核外輸送受容体補因子NXT遺伝子の多様化によるmRNA核外輸送ならびに遺伝子発現の制御2015

    • Author(s)
      猪瀬春子、増田誠司
    • Organizer
      日本分子生物学会・日本生化学会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-03 – 2015-12-03
  • [Presentation] mRNA核外輸送因子UAP56ならびにURH49における複合体形成基盤と選択的mRNA輸送制御機構の解明2015

    • Author(s)
      藤田賢一、伊藤慶紗、増田誠司
    • Organizer
      日本RNA学会
    • Place of Presentation
      ホテルライフォート札幌(北海道札幌市)
    • Year and Date
      2015-07-17 – 2015-07-17
  • [Presentation] 異なる複合体を形成するmRNA輸送因子UAP56およびURH49の構造解析2015

    • Author(s)
      伊藤慶紗、藤田賢一、増田誠司
    • Organizer
      日本RNA学会
    • Place of Presentation
      ホテルライフォート札幌(北海道札幌市)
    • Year and Date
      2015-07-16 – 2015-07-16
  • [Presentation] 人工的mRNA核外輸送システムによる組換えタンパク質高効率発現系の構築2015

    • Author(s)
      猪瀬春子、増田誠司
    • Organizer
      日本動物細胞工学会
    • Place of Presentation
      東北大学(宮城県仙台市)
    • Year and Date
      2015-07-09 – 2015-07-09
  • [Remarks] 京都大学大学院生命科学研究科分子応答機構学教室

    • URL

      http://www.bunshioutou.lif.kyoto-u.ac.jp

URL: 

Published: 2017-01-06  

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